MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16D

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021526	AACTT	2	10	772	781	40 %	40 %	0 %	20 %	513845192
2	NC_021526	AAAAT	2	10	2278	2287	80 %	20 %	0 %	0 %	513845194
3	NC_021526	AGTTA	2	10	2669	2678	40 %	40 %	20 %	0 %	513845195
4	NC_021526	CTCAT	2	10	10689	10698	20 %	40 %	0 %	40 %	513845203
5	NC_021526	GCAGT	2	10	14058	14067	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
6	NC_021526	GCAGT	2	10	14136	14145	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
7	NC_021526	GCAGT	2	10	14175	14184	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
8	NC_021526	GCAGT	2	10	14214	14223	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
9	NC_021526	GCAGT	2	10	14253	14262	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
10	NC_021526	GCAGT	2	10	14292	14301	20 %	20 %	40 %	20 %	513845206
11	NC_021526	TAATT	2	10	17109	17118	40 %	60 %	0 %	0 %	513845208
12	NC_021526	CAAAT	2	10	17729	17738	60 %	20 %	0 %	20 %	513845209
13	NC_021526	CAGAT	2	10	18127	18136	40 %	20 %	20 %	20 %	513845209
14	NC_021526	TACCT	2	10	20357	20366	20 %	40 %	0 %	40 %	513845211
15	NC_021526	AGTTA	2	10	24527	24536	40 %	40 %	20 %	0 %	513845212
16	NC_021526	TCTCT	2	10	25896	25905	0 %	60 %	0 %	40 %	513845214
17	NC_021526	GTTTT	2	10	30459	30468	0 %	80 %	20 %	0 %	513845220
18	NC_021526	ATGAC	2	10	30936	30945	40 %	20 %	20 %	20 %	513845220
19	NC_021526	ATTTT	2	10	31613	31622	20 %	80 %	0 %	0 %	513845222
20	NC_021526	GCTAA	2	10	35779	35788	40 %	20 %	20 %	20 %	513845227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.