MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16D

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021526	ATGA	2	8	558	565	50 %	25 %	25 %	0 %	513845192
2	NC_021526	ACTT	2	8	1050	1057	25 %	50 %	0 %	25 %	513845192
3	NC_021526	CCAT	2	8	1820	1827	25 %	25 %	0 %	50 %	513845193
4	NC_021526	TAAT	2	8	1945	1952	50 %	50 %	0 %	0 %	513845193
5	NC_021526	AGTG	2	8	2071	2078	25 %	25 %	50 %	0 %	513845194
6	NC_021526	TTGG	2	8	2106	2113	0 %	50 %	50 %	0 %	513845194
7	NC_021526	AAAG	2	8	2630	2637	75 %	0 %	25 %	0 %	513845195
8	NC_021526	CAAG	2	8	2969	2976	50 %	0 %	25 %	25 %	513845195
9	NC_021526	ACCA	2	8	2979	2986	50 %	0 %	0 %	50 %	513845195
10	NC_021526	GAAC	2	8	3313	3320	50 %	0 %	25 %	25 %	513845196
11	NC_021526	CAAT	2	8	3554	3561	50 %	25 %	0 %	25 %	513845196
12	NC_021526	TTGG	2	8	3740	3747	0 %	50 %	50 %	0 %	513845196
13	NC_021526	GATC	2	8	4002	4009	25 %	25 %	25 %	25 %	513845196
14	NC_021526	TAAT	2	8	4186	4193	50 %	50 %	0 %	0 %	513845196
15	NC_021526	TTTG	2	8	4955	4962	0 %	75 %	25 %	0 %	513845197
16	NC_021526	CTGA	2	8	5352	5359	25 %	25 %	25 %	25 %	513845198
17	NC_021526	TGAA	2	8	5392	5399	50 %	25 %	25 %	0 %	513845198
18	NC_021526	ACTT	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	513845199
19	NC_021526	CAAC	2	8	6322	6329	50 %	0 %	0 %	50 %	513845200
20	NC_021526	AGGT	2	8	6811	6818	25 %	25 %	50 %	0 %	513845201
21	NC_021526	GCCA	2	8	6861	6868	25 %	0 %	25 %	50 %	513845201
22	NC_021526	TTCA	2	8	6933	6940	25 %	50 %	0 %	25 %	513845201
23	NC_021526	TTAG	2	8	8418	8425	25 %	50 %	25 %	0 %	513845202
24	NC_021526	CGAT	2	8	8490	8497	25 %	25 %	25 %	25 %	513845202
25	NC_021526	GATT	2	8	8619	8626	25 %	50 %	25 %	0 %	513845202
26	NC_021526	TTCG	2	8	8998	9005	0 %	50 %	25 %	25 %	513845202
27	NC_021526	CATA	2	8	10070	10077	50 %	25 %	0 %	25 %	513845203
28	NC_021526	CTTG	2	8	10290	10297	0 %	50 %	25 %	25 %	513845203
29	NC_021526	GAAT	2	8	10457	10464	50 %	25 %	25 %	0 %	513845203
30	NC_021526	ATTC	2	8	12130	12137	25 %	50 %	0 %	25 %	513845203
31	NC_021526	CCAG	3	12	14013	14024	25 %	0 %	25 %	50 %	513845206
32	NC_021526	ACAG	2	8	14719	14726	50 %	0 %	25 %	25 %	513845207
33	NC_021526	GCTG	2	8	14734	14741	0 %	25 %	50 %	25 %	513845207
34	NC_021526	TACT	2	8	14963	14970	25 %	50 %	0 %	25 %	513845207
35	NC_021526	TAAC	2	8	16203	16210	50 %	25 %	0 %	25 %	513845207
36	NC_021526	CAAC	2	8	16673	16680	50 %	0 %	0 %	50 %	513845207
37	NC_021526	GATT	2	8	17096	17103	25 %	50 %	25 %	0 %	513845208
38	NC_021526	ACGC	2	8	18204	18211	25 %	0 %	25 %	50 %	513845209
39	NC_021526	CTCA	2	8	19102	19109	25 %	25 %	0 %	50 %	513845210
40	NC_021526	CAAC	2	8	19220	19227	50 %	0 %	0 %	50 %	513845210
41	NC_021526	CACG	2	8	19413	19420	25 %	0 %	25 %	50 %	513845210
42	NC_021526	TTCT	2	8	19507	19514	0 %	75 %	0 %	25 %	513845210
43	NC_021526	ACCT	2	8	19873	19880	25 %	25 %	0 %	50 %	513845210
44	NC_021526	ACTA	2	8	19936	19943	50 %	25 %	0 %	25 %	513845210
45	NC_021526	TAAA	2	8	20599	20606	75 %	25 %	0 %	0 %	513845211
46	NC_021526	TTGG	2	8	20880	20887	0 %	50 %	50 %	0 %	513845211
47	NC_021526	TTGC	2	8	20943	20950	0 %	50 %	25 %	25 %	513845211
48	NC_021526	TTGA	2	8	20999	21006	25 %	50 %	25 %	0 %	513845211
49	NC_021526	CTGG	2	8	21064	21071	0 %	25 %	50 %	25 %	513845211
50	NC_021526	ATAA	2	8	21788	21795	75 %	25 %	0 %	0 %	513845211
51	NC_021526	GTTA	2	8	21827	21834	25 %	50 %	25 %	0 %	513845211
52	NC_021526	CATA	2	8	21980	21987	50 %	25 %	0 %	25 %	513845211
53	NC_021526	TCAT	2	8	22098	22105	25 %	50 %	0 %	25 %	513845211
54	NC_021526	ATAC	2	8	22708	22715	50 %	25 %	0 %	25 %	513845211
55	NC_021526	TTGT	2	8	22896	22903	0 %	75 %	25 %	0 %	513845211
56	NC_021526	TTAC	2	8	24642	24649	25 %	50 %	0 %	25 %	513845212
57	NC_021526	GCCA	2	8	25672	25679	25 %	0 %	25 %	50 %	513845213
58	NC_021526	CTGA	2	8	25787	25794	25 %	25 %	25 %	25 %	513845213
59	NC_021526	TCAT	2	8	26056	26063	25 %	50 %	0 %	25 %	513845214
60	NC_021526	CATT	2	8	27059	27066	25 %	50 %	0 %	25 %	513845216
61	NC_021526	AATA	2	8	27441	27448	75 %	25 %	0 %	0 %	513845217
62	NC_021526	GTGG	2	8	30525	30532	0 %	25 %	75 %	0 %	513845220
63	NC_021526	TTAA	2	8	30686	30693	50 %	50 %	0 %	0 %	513845220
64	NC_021526	ACGA	2	8	30739	30746	50 %	0 %	25 %	25 %	513845220
65	NC_021526	GAAC	2	8	30904	30911	50 %	0 %	25 %	25 %	513845220
66	NC_021526	ATTT	2	8	32112	32119	25 %	75 %	0 %	0 %	513845223
67	NC_021526	AAAG	2	8	32181	32188	75 %	0 %	25 %	0 %	513845223
68	NC_021526	AGAA	2	8	32261	32268	75 %	0 %	25 %	0 %	513845223
69	NC_021526	TGGT	2	8	32494	32501	0 %	50 %	50 %	0 %	513845223
70	NC_021526	GAAA	2	8	32674	32681	75 %	0 %	25 %	0 %	513845223
71	NC_021526	TTAA	2	8	32905	32912	50 %	50 %	0 %	0 %	513845223
72	NC_021526	CTCA	2	8	32970	32977	25 %	25 %	0 %	50 %	513845223
73	NC_021526	TAAA	2	8	32996	33003	75 %	25 %	0 %	0 %	513845223
74	NC_021526	AATT	2	8	33077	33084	50 %	50 %	0 %	0 %	513845223
75	NC_021526	AACA	2	8	33101	33108	75 %	0 %	0 %	25 %	513845223
76	NC_021526	GCAA	2	8	33546	33553	50 %	0 %	25 %	25 %	513845223
77	NC_021526	TTAT	2	8	33600	33607	25 %	75 %	0 %	0 %	513845223
78	NC_021526	CTAG	2	8	34680	34687	25 %	25 %	25 %	25 %	513845224

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.