MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 1752

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021521	GTTAA	2	10	4911	4920	40 %	40 %	20 %	0 %	514058765
2	NC_021521	GCAAA	2	10	5754	5763	60 %	0 %	20 %	20 %	514058766
3	NC_021521	TGCCG	2	10	5892	5901	0 %	20 %	40 %	40 %	514058766
4	NC_021521	GAAAA	2	10	7213	7222	80 %	0 %	20 %	0 %	514058767
5	NC_021521	ATCAA	2	10	7803	7812	60 %	20 %	0 %	20 %	514058769
6	NC_021521	TCTAA	2	10	7813	7822	40 %	40 %	0 %	20 %	514058769
7	NC_021521	GGAAT	2	10	9923	9932	40 %	20 %	40 %	0 %	514058770
8	NC_021521	GCGTG	2	10	10565	10574	0 %	20 %	60 %	20 %	514058770
9	NC_021521	GAAAA	2	10	13201	13210	80 %	0 %	20 %	0 %	514058771
10	NC_021521	GGCGT	2	10	13431	13440	0 %	20 %	60 %	20 %	514058772
11	NC_021521	CAAAC	2	10	14447	14456	60 %	0 %	0 %	40 %	514058772
12	NC_021521	TGAAT	2	10	17115	17124	40 %	40 %	20 %	0 %	514058774
13	NC_021521	TAATC	2	10	19682	19691	40 %	40 %	0 %	20 %	514058776
14	NC_021521	AATTC	2	10	31410	31419	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_021521	TCAAC	2	10	33417	33426	40 %	20 %	0 %	40 %	514058794
16	NC_021521	AGTTC	2	10	33654	33663	20 %	40 %	20 %	20 %	514058794
17	NC_021521	TGTGA	2	10	34669	34678	20 %	40 %	40 %	0 %	514058795
18	NC_021521	TTGCG	2	10	34722	34731	0 %	40 %	40 %	20 %	514058795
19	NC_021521	TTGAG	2	10	35903	35912	20 %	40 %	40 %	0 %	514058796
20	NC_021521	TTCGC	2	10	36474	36483	0 %	40 %	20 %	40 %	514058797
21	NC_021521	ACGGT	2	10	37162	37171	20 %	20 %	40 %	20 %	514058797
22	NC_021521	TGCAT	2	10	37260	37269	20 %	40 %	20 %	20 %	514058797
23	NC_021521	ATTAC	2	10	38323	38332	40 %	40 %	0 %	20 %	514058798
24	NC_021521	AAGAT	2	10	38831	38840	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021521	GATTA	2	10	42346	42355	40 %	40 %	20 %	0 %	514058803
26	NC_021521	AACTG	2	10	43506	43515	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021521	ATTGC	2	10	44251	44260	20 %	40 %	20 %	20 %	514058806
28	NC_021521	AACGC	2	10	47331	47340	40 %	0 %	20 %	40 %	514058809
29	NC_021521	TTGGG	2	10	48533	48542	0 %	40 %	60 %	0 %	514058810
30	NC_021521	AAAGA	2	10	50306	50315	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021521	CACGG	2	10	50677	50686	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_021521	AATTT	2	10	51696	51705	40 %	60 %	0 %	0 %	514058811
33	NC_021521	CAAAC	2	10	51854	51863	60 %	0 %	0 %	40 %	514058811
34	NC_021521	AATGC	2	10	57456	57465	40 %	20 %	20 %	20 %	514058815
35	NC_021521	TTTAC	2	10	59038	59047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021521	TGAGA	2	10	62422	62431	40 %	20 %	40 %	0 %	514058818
37	NC_021521	TTCAT	2	10	64353	64362	20 %	60 %	0 %	20 %	514058821
38	NC_021521	TTTTA	2	10	67383	67392	20 %	80 %	0 %	0 %	514058823
39	NC_021521	TAAAA	2	10	69974	69983	80 %	20 %	0 %	0 %	514058824
40	NC_021521	TAATA	2	10	71749	71758	60 %	40 %	0 %	0 %	514058827
41	NC_021521	CAATT	2	10	73469	73478	40 %	40 %	0 %	20 %	514058828
42	NC_021521	TGATT	2	10	74633	74642	20 %	60 %	20 %	0 %	514058830
43	NC_021521	GGGAA	2	10	77278	77287	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021521	CTTAT	2	10	78421	78430	20 %	60 %	0 %	20 %	514058833
45	NC_021521	GCATT	2	10	79913	79922	20 %	40 %	20 %	20 %	514058834
46	NC_021521	CTCGG	2	10	80150	80159	0 %	20 %	40 %	40 %	514058834
47	NC_021521	CATTA	2	10	81470	81479	40 %	40 %	0 %	20 %	514058835
48	NC_021521	AAAAC	2	10	82893	82902	80 %	0 %	0 %	20 %	514058836
49	NC_021521	ACGAA	2	10	84289	84298	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_021521	GTTGC	2	10	85089	85098	0 %	40 %	40 %	20 %	514058838
51	NC_021521	GTGAA	2	10	85448	85457	40 %	20 %	40 %	0 %	514058838
52	NC_021521	TGTTT	2	10	86526	86535	0 %	80 %	20 %	0 %	514058839
53	NC_021521	TTTCC	2	10	89118	89127	0 %	60 %	0 %	40 %	514058841
54	NC_021521	GCAGA	2	10	93046	93055	40 %	0 %	40 %	20 %	514058846
55	NC_021521	AAAGT	2	10	97275	97284	60 %	20 %	20 %	0 %	514058851
56	NC_021521	GTTTG	2	10	97741	97750	0 %	60 %	40 %	0 %	514058851
57	NC_021521	CACGG	2	10	99775	99784	20 %	0 %	40 %	40 %	514058854
58	NC_021521	ACGTT	2	10	100359	100368	20 %	40 %	20 %	20 %	514058854
59	NC_021521	GTGAA	2	10	100489	100498	40 %	20 %	40 %	0 %	514058854
60	NC_021521	CAATA	2	10	100770	100779	60 %	20 %	0 %	20 %	514058855
61	NC_021521	ATGTT	2	10	104458	104467	20 %	60 %	20 %	0 %	514058859
62	NC_021521	CTGCT	2	10	109569	109578	0 %	40 %	20 %	40 %	514058864
63	NC_021521	AGTAA	2	10	111210	111219	60 %	20 %	20 %	0 %	514058865
64	NC_021521	AAAAG	2	10	111500	111509	80 %	0 %	20 %	0 %	514058865
65	NC_021521	TTTCA	2	10	113002	113011	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_021521	CCGAA	2	10	113615	113624	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_021521	GTTTT	2	10	115019	115028	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021521	TTTCC	2	10	116617	116626	0 %	60 %	0 %	40 %	514058869
69	NC_021521	TCCAT	2	10	117672	117681	20 %	40 %	0 %	40 %	514058870
70	NC_021521	ACCGC	2	10	118771	118780	20 %	0 %	20 %	60 %	514058871
71	NC_021521	AATAA	2	10	119441	119450	80 %	20 %	0 %	0 %	514058872
72	NC_021521	GCACG	2	10	119967	119976	20 %	0 %	40 %	40 %	514058873
73	NC_021521	CTAAA	2	10	123083	123092	60 %	20 %	0 %	20 %	514058877
74	NC_021521	ATTGC	2	10	123449	123458	20 %	40 %	20 %	20 %	514058877
75	NC_021521	TAAAT	2	10	123553	123562	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021521	AAAAT	2	10	124526	124535	80 %	20 %	0 %	0 %	514058878
77	NC_021521	GGCTC	2	10	124976	124985	0 %	20 %	40 %	40 %	514058879
78	NC_021521	TCTGT	2	10	126061	126070	0 %	60 %	20 %	20 %	514058879
79	NC_021521	CTCAA	2	10	127586	127595	40 %	20 %	0 %	40 %	514058880
80	NC_021521	GACCA	2	10	128790	128799	40 %	0 %	20 %	40 %	514058881
81	NC_021521	TATTT	2	10	129042	129051	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021521	AATGA	2	10	129097	129106	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021521	TTTCC	2	10	130047	130056	0 %	60 %	0 %	40 %	514058882
84	NC_021521	GTTTT	2	10	131967	131976	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021521	GTGGC	2	10	132061	132070	0 %	20 %	60 %	20 %	514058884
86	NC_021521	AAAAT	2	10	133711	133720	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021521	GTGAT	2	10	134363	134372	20 %	40 %	40 %	0 %	514058885
88	NC_021521	TGAAA	2	10	137019	137028	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021521	AAAGT	2	10	137392	137401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021521	CAGAT	2	10	139889	139898	40 %	20 %	20 %	20 %	514058889
91	NC_021521	ATTTG	2	10	140577	140586	20 %	60 %	20 %	0 %	514058889
92	NC_021521	TTAAG	2	10	144446	144455	40 %	40 %	20 %	0 %	514058892
93	NC_021521	AAGGC	2	10	145147	145156	40 %	0 %	40 %	20 %	514058893
94	NC_021521	TTTTA	2	10	148148	148157	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021521	AGCCA	2	10	148438	148447	40 %	0 %	20 %	40 %	514058897
96	NC_021521	TACCT	2	10	149324	149333	20 %	40 %	0 %	40 %	514058899
97	NC_021521	AAATC	2	10	149957	149966	60 %	20 %	0 %	20 %	514058900
98	NC_021521	GCAAG	2	10	150595	150604	40 %	0 %	40 %	20 %	514058901
99	NC_021521	AAATT	2	10	151776	151785	60 %	40 %	0 %	0 %	514058902
100	NC_021521	AACTC	2	10	155595	155604	40 %	20 %	0 %	40 %	514058904
101	NC_021521	AGCCA	2	10	157128	157137	40 %	0 %	20 %	40 %	514058905
102	NC_021521	TGCAT	2	10	158850	158859	20 %	40 %	20 %	20 %	514058907
103	NC_021521	TAAAT	2	10	159609	159618	60 %	40 %	0 %	0 %	514058907
104	NC_021521	CGGTT	2	10	160249	160258	0 %	40 %	40 %	20 %	514058908
105	NC_021521	CTTTT	2	10	162127	162136	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_021521	AAATT	2	10	162758	162767	60 %	40 %	0 %	0 %	514058911
107	NC_021521	CACCG	2	10	163393	163402	20 %	0 %	20 %	60 %	514058911
108	NC_021521	TTGAG	2	10	165601	165610	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021521	GTTGG	2	10	166221	166230	0 %	40 %	60 %	0 %	514058914
110	NC_021521	GAACC	2	10	166984	166993	40 %	0 %	20 %	40 %	514058915
111	NC_021521	ACGAA	2	10	168317	168326	60 %	0 %	20 %	20 %	514058916
112	NC_021521	CCATT	2	10	168663	168672	20 %	40 %	0 %	40 %	514058916
113	NC_021521	GGTTT	2	10	168822	168831	0 %	60 %	40 %	0 %	514058916
114	NC_021521	TAAAG	2	10	170294	170303	60 %	20 %	20 %	0 %	514058918
115	NC_021521	ACGAA	2	10	171564	171573	60 %	0 %	20 %	20 %	514058919
116	NC_021521	CCATT	2	10	171671	171680	20 %	40 %	0 %	40 %	514058920
117	NC_021521	CCATT	2	10	172155	172164	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
118	NC_021521	TAATT	2	10	173669	173678	40 %	60 %	0 %	0 %	514058923
119	NC_021521	TGTAA	2	10	175892	175901	40 %	40 %	20 %	0 %	514058924
120	NC_021521	ATACG	2	10	177299	177308	40 %	20 %	20 %	20 %	514058925
121	NC_021521	TGCTC	2	10	178715	178724	0 %	40 %	20 %	40 %	514058927
122	NC_021521	ATTTT	2	10	179475	179484	20 %	80 %	0 %	0 %	514058927
123	NC_021521	TTCCC	2	10	180398	180407	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
124	NC_021521	TTATT	2	10	180470	180479	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021521	GCTTT	2	10	182548	182557	0 %	60 %	20 %	20 %	514058930
126	NC_021521	GGCAA	2	10	183151	183160	40 %	0 %	40 %	20 %	514058930
127	NC_021521	TTTTA	2	10	184237	184246	20 %	80 %	0 %	0 %	514058931
128	NC_021521	GGCTT	2	10	185503	185512	0 %	40 %	40 %	20 %	514058933
129	NC_021521	TTTTC	2	10	187628	187637	0 %	80 %	0 %	20 %	514058935
130	NC_021521	TGCCG	2	10	187734	187743	0 %	20 %	40 %	40 %	514058935
131	NC_021521	AAATT	2	10	188513	188522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021521	AGCCA	2	10	189371	189380	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_021521	TAAAT	2	10	190193	190202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021521	AAGAA	2	10	190695	190704	80 %	0 %	20 %	0 %	514058936
135	NC_021521	AATAT	2	10	191766	191775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021521	AAATC	2	10	193176	193185	60 %	20 %	0 %	20 %	514058938
137	NC_021521	GCGAA	2	10	194572	194581	40 %	0 %	40 %	20 %	514058939
138	NC_021521	CAGGG	2	10	195726	195735	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_021521	CAAAC	2	10	196452	196461	60 %	0 %	0 %	40 %	514058940
140	NC_021521	GATGT	2	10	197299	197308	20 %	40 %	40 %	0 %	514058941
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147	NC_021521	TTTTC	2	10	207217	207226	0 %	80 %	0 %	20 %	514058951
148	NC_021521	ATAAA	2	10	207478	207487	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021521	TTTGA	2	10	208502	208511	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021521	TAACT	2	10	210794	210803	40 %	40 %	0 %	20 %	514058957
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154	NC_021521	GTATT	2	10	217394	217403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_021521	CTAAA	2	10	223374	223383	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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170	NC_021521	CTTTA	2	10	239419	239428	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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175	NC_021521	AATGG	2	10	241402	241411	40 %	20 %	40 %	0 %	514058997
176	NC_021521	TAAGG	2	10	242283	242292	40 %	20 %	40 %	0 %	514058998
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179	NC_021521	AAATT	2	10	245723	245732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_021521	GGGTT	2	10	279605	279614	0 %	40 %	60 %	0 %	514059037
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238	NC_021521	ACGGC	2	10	318167	318176	20 %	0 %	40 %	40 %	514059079
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241	NC_021521	CTAAT	2	10	322349	322358	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
242	NC_021521	TTTTA	2	10	323366	323375	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_021521	ACGGC	2	10	326854	326863	20 %	0 %	40 %	40 %	514059087
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248	NC_021521	TGCAG	2	10	334517	334526	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
249	NC_021521	CAAAT	2	10	336420	336429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
250	NC_021521	GGATT	2	10	338203	338212	20 %	40 %	40 %	0 %	514059103
251	NC_021521	TCTTA	2	10	339038	339047	20 %	60 %	0 %	20 %	514059104
252	NC_021521	TGTGG	2	10	340186	340195	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021521	TGGCG	2	10	340852	340861	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
254	NC_021521	TGATT	2	10	342530	342539	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
255	NC_021521	CTTTT	2	10	346898	346907	0 %	80 %	0 %	20 %	514059108
256	NC_021521	GCAAA	2	10	347309	347318	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
257	NC_021521	CTGTT	2	10	348714	348723	0 %	60 %	20 %	20 %	514059109
258	NC_021521	GAAAA	2	10	352191	352200	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021521	TGCCT	2	10	352455	352464	0 %	40 %	20 %	40 %	514059112
260	NC_021521	GGAGG	2	10	353414	353423	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021521	TGTCA	2	10	353653	353662	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
262	NC_021521	ATTGA	2	10	356742	356751	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_021521	TTTGG	2	10	359355	359364	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
264	NC_021521	AGCGA	2	10	361470	361479	40 %	0 %	40 %	20 %	514059121
265	NC_021521	GGCAC	2	10	361601	361610	20 %	0 %	40 %	40 %	514059122
266	NC_021521	ATTTT	2	10	363285	363294	20 %	80 %	0 %	0 %	514059123
267	NC_021521	TAGTT	2	10	366572	366581	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021521	TTCGT	2	10	366870	366879	0 %	60 %	20 %	20 %	514059127
269	NC_021521	TATTT	2	10	366972	366981	20 %	80 %	0 %	0 %	514059127
270	NC_021521	GATTT	2	10	367591	367600	20 %	60 %	20 %	0 %	514059127
271	NC_021521	AATTT	2	10	370596	370605	40 %	60 %	0 %	0 %	514059130
272	NC_021521	CTTAT	2	10	373461	373470	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_021521	AAACC	2	10	374322	374331	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
274	NC_021521	AATGG	2	10	374481	374490	40 %	20 %	40 %	0 %	514059135
275	NC_021521	TTCGT	2	10	374588	374597	0 %	60 %	20 %	20 %	514059136
276	NC_021521	TCCTT	2	10	375121	375130	0 %	60 %	0 %	40 %	514059137
277	NC_021521	TAGAT	2	10	379053	379062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
278	NC_021521	TTGAC	2	10	380432	380441	20 %	40 %	20 %	20 %	514059143
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280	NC_021521	ATTGT	2	10	381655	381664	20 %	60 %	20 %	0 %	514059143
281	NC_021521	TTTTG	2	10	382215	382224	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
282	NC_021521	TGGCG	2	10	382995	383004	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
283	NC_021521	AAAAT	2	10	383011	383020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_021521	TACGG	2	10	383034	383043	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
285	NC_021521	AGATG	2	10	383668	383677	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021521	ATTGC	2	10	388615	388624	20 %	40 %	20 %	20 %	514059146
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309	NC_021521	TATTC	2	10	417906	417915	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
310	NC_021521	AGTCG	2	10	421680	421689	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
311	NC_021521	AGGTT	2	10	422130	422139	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
312	NC_021521	TGATT	2	10	424056	424065	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_021521	ATTAT	2	10	464393	464402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_021521	AAATA	2	10	464861	464870	80 %	20 %	0 %	0 %	514059202
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353	NC_021521	GCTTG	2	10	483303	483312	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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373	NC_021521	AATTT	2	10	503659	503668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
374	NC_021521	TTCCG	2	10	504820	504829	0 %	40 %	20 %	40 %	514059240
375	NC_021521	TATGA	2	10	505921	505930	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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384	NC_021521	TATTG	2	10	510376	510385	20 %	60 %	20 %	0 %	514059247
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388	NC_021521	GCAAA	2	10	518791	518800	60 %	0 %	20 %	20 %	514059257
389	NC_021521	AAAAC	2	10	519244	519253	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
390	NC_021521	GATAC	2	10	521274	521283	40 %	20 %	20 %	20 %	514059261
391	NC_021521	GGTGG	2	10	522972	522981	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
392	NC_021521	CCTAC	2	10	523610	523619	20 %	20 %	0 %	60 %	514059263
393	NC_021521	TCAAA	2	10	525693	525702	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
394	NC_021521	CTTTT	2	10	526032	526041	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
395	NC_021521	ATGGG	2	10	529386	529395	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
396	NC_021521	TATGA	2	10	529622	529631	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
397	NC_021521	GATTT	2	10	530120	530129	20 %	60 %	20 %	0 %	514059267
398	NC_021521	GATGA	2	10	531073	531082	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_021521	CTTGC	2	10	535309	535318	0 %	40 %	20 %	40 %	514059273
402	NC_021521	AAATA	2	10	537733	537742	80 %	20 %	0 %	0 %	514059277
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404	NC_021521	ATAAA	2	10	538262	538271	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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