MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 6162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021521	CAGA	2	8	671	678	50 %	0 %	25 %	25 %	514058763
2	NC_021521	AAAT	2	8	1052	1059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021521	CTTT	2	8	1476	1483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021521	TTTG	2	8	1563	1570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021521	TAAA	2	8	1734	1741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021521	TTTC	2	8	1953	1960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021521	CTTG	2	8	2132	2139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021521	ACTG	2	8	2738	2745	25 %	25 %	25 %	25 %	514058764
9	NC_021521	ATTG	2	8	2951	2958	25 %	50 %	25 %	0 %	514058764
10	NC_021521	TTGC	2	8	3279	3286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021521	TGAT	2	8	3307	3314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021521	TTAT	2	8	3431	3438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021521	TTTG	2	8	3493	3500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021521	GTTG	2	8	3544	3551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021521	ATTA	2	8	3684	3691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021521	AATT	2	8	4466	4473	50 %	50 %	0 %	0 %	514058765
17	NC_021521	TGAA	2	8	4990	4997	50 %	25 %	25 %	0 %	514058765
18	NC_021521	TAAA	2	8	5358	5365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021521	ACTC	2	8	5499	5506	25 %	25 %	0 %	50 %	514058766
20	NC_021521	TTTG	2	8	6189	6196	0 %	75 %	25 %	0 %	514058766
21	NC_021521	ATTC	2	8	6948	6955	25 %	50 %	0 %	25 %	514058767
22	NC_021521	TTTA	2	8	7053	7060	25 %	75 %	0 %	0 %	514058767
23	NC_021521	ATCA	2	8	7135	7142	50 %	25 %	0 %	25 %	514058767
24	NC_021521	AGCA	2	8	7174	7181	50 %	0 %	25 %	25 %	514058767
25	NC_021521	AGAA	2	8	7534	7541	75 %	0 %	25 %	0 %	514058768
26	NC_021521	TTAA	2	8	7786	7793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021521	GTTT	2	8	8108	8115	0 %	75 %	25 %	0 %	514058769
28	NC_021521	TATC	2	8	8946	8953	25 %	50 %	0 %	25 %	514058770
29	NC_021521	ATTT	2	8	8970	8977	25 %	75 %	0 %	0 %	514058770
30	NC_021521	AACC	2	8	9189	9196	50 %	0 %	0 %	50 %	514058770
31	NC_021521	TTTG	2	8	9893	9900	0 %	75 %	25 %	0 %	514058770
32	NC_021521	AAAG	2	8	9972	9979	75 %	0 %	25 %	0 %	514058770
33	NC_021521	CTTT	2	8	10045	10052	0 %	75 %	0 %	25 %	514058770
34	NC_021521	AATC	2	8	10056	10063	50 %	25 %	0 %	25 %	514058770
35	NC_021521	TGCC	2	8	10777	10784	0 %	25 %	25 %	50 %	514058770
36	NC_021521	TGCT	2	8	11507	11514	0 %	50 %	25 %	25 %	514058770
37	NC_021521	TTGA	2	8	11769	11776	25 %	50 %	25 %	0 %	514058770
38	NC_021521	TTTA	2	8	11966	11973	25 %	75 %	0 %	0 %	514058770
39	NC_021521	AAAG	2	8	12351	12358	75 %	0 %	25 %	0 %	514058771
40	NC_021521	TTAA	2	8	12522	12529	50 %	50 %	0 %	0 %	514058771
41	NC_021521	TTTA	2	8	13357	13364	25 %	75 %	0 %	0 %	514058772
42	NC_021521	GATG	2	8	13756	13763	25 %	25 %	50 %	0 %	514058772
43	NC_021521	CTTG	2	8	13906	13913	0 %	50 %	25 %	25 %	514058772
44	NC_021521	ATTT	2	8	13920	13927	25 %	75 %	0 %	0 %	514058772
45	NC_021521	TTGA	2	8	14747	14754	25 %	50 %	25 %	0 %	514058772
46	NC_021521	AGTG	2	8	15877	15884	25 %	25 %	50 %	0 %	514058772
47	NC_021521	TTTG	2	8	16093	16100	0 %	75 %	25 %	0 %	514058772
48	NC_021521	GCTT	2	8	16181	16188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_021521	AAAG	2	8	16360	16367	75 %	0 %	25 %	0 %	514058773
50	NC_021521	TGAC	2	8	16544	16551	25 %	25 %	25 %	25 %	514058773
51	NC_021521	TGAA	2	8	16733	16740	50 %	25 %	25 %	0 %	514058773
52	NC_021521	CATT	2	8	17019	17026	25 %	50 %	0 %	25 %	514058774
53	NC_021521	CTTT	2	8	18709	18716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_021521	CGTG	2	8	19270	19277	0 %	25 %	50 %	25 %	514058776
55	NC_021521	ATAG	2	8	19710	19717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021521	CAGT	2	8	20115	20122	25 %	25 %	25 %	25 %	514058777
57	NC_021521	TAAT	2	8	20590	20597	50 %	50 %	0 %	0 %	514058778
58	NC_021521	ATTA	2	8	20749	20756	50 %	50 %	0 %	0 %	514058779
59	NC_021521	CAAC	2	8	20893	20900	50 %	0 %	0 %	50 %	514058779
60	NC_021521	ACCG	2	8	21875	21882	25 %	0 %	25 %	50 %	514058780
61	NC_021521	TGCC	2	8	22174	22181	0 %	25 %	25 %	50 %	514058780
62	NC_021521	GATT	2	8	22511	22518	25 %	50 %	25 %	0 %	514058781
63	NC_021521	ACCG	2	8	23454	23461	25 %	0 %	25 %	50 %	514058781
64	NC_021521	GCGA	2	8	23982	23989	25 %	0 %	50 %	25 %	514058782
65	NC_021521	AAAC	2	8	24012	24019	75 %	0 %	0 %	25 %	514058782
66	NC_021521	CTTG	2	8	24135	24142	0 %	50 %	25 %	25 %	514058782
67	NC_021521	TTGA	2	8	24313	24320	25 %	50 %	25 %	0 %	514058782
68	NC_021521	GTTT	2	8	25165	25172	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021521	AATC	2	8	25182	25189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021521	CTTG	2	8	25717	25724	0 %	50 %	25 %	25 %	514058783
71	NC_021521	ATTT	2	8	26261	26268	25 %	75 %	0 %	0 %	514058783
72	NC_021521	AAAT	2	8	26388	26395	75 %	25 %	0 %	0 %	514058783
73	NC_021521	GCTT	2	8	26553	26560	0 %	50 %	25 %	25 %	514058783
74	NC_021521	CAAA	2	8	26817	26824	75 %	0 %	0 %	25 %	514058784
75	NC_021521	AATT	2	8	27284	27291	50 %	50 %	0 %	0 %	514058785
76	NC_021521	ATTT	2	8	27649	27656	25 %	75 %	0 %	0 %	514058785
77	NC_021521	AATC	2	8	28354	28361	50 %	25 %	0 %	25 %	514058786
78	NC_021521	CTCG	2	8	29188	29195	0 %	25 %	25 %	50 %	514058787
79	NC_021521	CAAT	2	8	29765	29772	50 %	25 %	0 %	25 %	514058788
80	NC_021521	TAAG	2	8	29869	29876	50 %	25 %	25 %	0 %	514058788
81	NC_021521	AATC	2	8	30190	30197	50 %	25 %	0 %	25 %	514058789
82	NC_021521	CGTC	2	8	30286	30293	0 %	25 %	25 %	50 %	514058789
83	NC_021521	TCAA	2	8	30758	30765	50 %	25 %	0 %	25 %	514058790
84	NC_021521	TTTC	2	8	30955	30962	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_021521	AAAG	2	8	31102	31109	75 %	0 %	25 %	0 %	514058791
86	NC_021521	ATAG	2	8	31204	31211	50 %	25 %	25 %	0 %	514058791
87	NC_021521	TGGT	2	8	31287	31294	0 %	50 %	50 %	0 %	514058791
88	NC_021521	GATG	2	8	31389	31396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021521	AAGC	2	8	31431	31438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_021521	TAGC	2	8	31800	31807	25 %	25 %	25 %	25 %	514058792
91	NC_021521	ATCT	2	8	31828	31835	25 %	50 %	0 %	25 %	514058792
92	NC_021521	TCAA	2	8	32558	32565	50 %	25 %	0 %	25 %	514058793
93	NC_021521	TTCG	2	8	32717	32724	0 %	50 %	25 %	25 %	514058793
94	NC_021521	AATA	2	8	34317	34324	75 %	25 %	0 %	0 %	514058795
95	NC_021521	TCGC	2	8	34604	34611	0 %	25 %	25 %	50 %	514058795
96	NC_021521	GAAA	2	8	34773	34780	75 %	0 %	25 %	0 %	514058795
97	NC_021521	ATAA	2	8	36148	36155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021521	TAAA	2	8	36223	36230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021521	AATT	2	8	36270	36277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021521	AATC	2	8	36310	36317	50 %	25 %	0 %	25 %	514058797
101	NC_021521	GTCG	2	8	36608	36615	0 %	25 %	50 %	25 %	514058797
102	NC_021521	ATTT	2	8	37003	37010	25 %	75 %	0 %	0 %	514058797
103	NC_021521	TAAA	2	8	37100	37107	75 %	25 %	0 %	0 %	514058797
104	NC_021521	ATTG	3	12	37497	37508	25 %	50 %	25 %	0 %	514058797
105	NC_021521	GTGG	2	8	37579	37586	0 %	25 %	75 %	0 %	514058797
106	NC_021521	CCTG	2	8	37966	37973	0 %	25 %	25 %	50 %	514058798
107	NC_021521	TTGA	2	8	38721	38728	25 %	50 %	25 %	0 %	514058798
108	NC_021521	CGCT	2	8	39125	39132	0 %	25 %	25 %	50 %	514058799
109	NC_021521	TCAA	2	8	39705	39712	50 %	25 %	0 %	25 %	514058799
110	NC_021521	GAAT	2	8	40412	40419	50 %	25 %	25 %	0 %	514058801
111	NC_021521	TTTA	2	8	40953	40960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021521	TCAA	2	8	41605	41612	50 %	25 %	0 %	25 %	514058802
113	NC_021521	ATGA	2	8	42492	42499	50 %	25 %	25 %	0 %	514058803
114	NC_021521	GGCA	2	8	42590	42597	25 %	0 %	50 %	25 %	514058803
115	NC_021521	AAAT	2	8	43467	43474	75 %	25 %	0 %	0 %	514058804
116	NC_021521	GTTT	2	8	43633	43640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021521	AGTT	2	8	43700	43707	25 %	50 %	25 %	0 %	514058805
118	NC_021521	TGCG	2	8	44267	44274	0 %	25 %	50 %	25 %	514058806
119	NC_021521	GTAT	2	8	44359	44366	25 %	50 %	25 %	0 %	514058806
120	NC_021521	GCTA	2	8	45331	45338	25 %	25 %	25 %	25 %	514058806
121	NC_021521	GGAA	2	8	45447	45454	50 %	0 %	50 %	0 %	514058806
122	NC_021521	TTCT	2	8	45485	45492	0 %	75 %	0 %	25 %	514058806
123	NC_021521	TGGT	2	8	45836	45843	0 %	50 %	50 %	0 %	514058807
124	NC_021521	CCTC	2	8	46469	46476	0 %	25 %	0 %	75 %	514058808
125	NC_021521	TTTA	2	8	47348	47355	25 %	75 %	0 %	0 %	514058809
126	NC_021521	TGGG	2	8	47456	47463	0 %	25 %	75 %	0 %	514058809
127	NC_021521	TTGT	2	8	47496	47503	0 %	75 %	25 %	0 %	514058809
128	NC_021521	CGGT	2	8	48097	48104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_021521	CTAC	2	8	48395	48402	25 %	25 %	0 %	50 %	514058810
130	NC_021521	GCAA	2	8	48404	48411	50 %	0 %	25 %	25 %	514058810
131	NC_021521	CGTG	2	8	48432	48439	0 %	25 %	50 %	25 %	514058810
132	NC_021521	TCGC	2	8	48606	48613	0 %	25 %	25 %	50 %	514058810
133	NC_021521	AGAA	2	8	49381	49388	75 %	0 %	25 %	0 %	514058810
134	NC_021521	TGGA	2	8	49503	49510	25 %	25 %	50 %	0 %	514058810
135	NC_021521	ATCA	2	8	49518	49525	50 %	25 %	0 %	25 %	514058810
136	NC_021521	TGAG	2	8	49927	49934	25 %	25 %	50 %	0 %	514058810
137	NC_021521	GAAA	2	8	49937	49944	75 %	0 %	25 %	0 %	514058810
138	NC_021521	TCAA	2	8	50375	50382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021521	CGAC	2	8	50817	50824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021521	AATC	2	8	51471	51478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021521	CAGG	2	8	51749	51756	25 %	0 %	50 %	25 %	514058811
142	NC_021521	TCGC	2	8	52389	52396	0 %	25 %	25 %	50 %	514058811
143	NC_021521	TAAA	2	8	53494	53501	75 %	25 %	0 %	0 %	514058812
144	NC_021521	TGGC	2	8	53533	53540	0 %	25 %	50 %	25 %	514058812
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