MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus parasuis ZJ0906

Total Repeats: 1380

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021521	AAAT	2	8	1052	1059	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021521	CTTT	2	8	1476	1483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021521	TTTG	2	8	1563	1570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021521	TAAA	2	8	1734	1741	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021521	TTTC	2	8	1953	1960	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021521	CTTG	2	8	2132	2139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021521	TTGC	2	8	3279	3286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021521	TGAT	2	8	3307	3314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021521	TTAT	2	8	3431	3438	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021521	TTTG	2	8	3493	3500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021521	GTTG	2	8	3544	3551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021521	ATTA	2	8	3684	3691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021521	TAAA	2	8	5358	5365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021521	TTAA	2	8	7786	7793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021521	GCTT	2	8	16181	16188	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021521	CTTT	2	8	18709	18716	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_021521	ATAG	2	8	19710	19717	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021521	GTTT	2	8	25165	25172	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021521	AATC	2	8	25182	25189	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021521	TTTC	2	8	30955	30962	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021521	GATG	2	8	31389	31396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021521	AAGC	2	8	31431	31438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_021521	ATAA	2	8	36148	36155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021521	TAAA	2	8	36223	36230	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021521	AATT	2	8	36270	36277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021521	TTTA	2	8	40953	40960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021521	GTTT	2	8	43633	43640	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021521	CGGT	2	8	48097	48104	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021521	TCAA	2	8	50375	50382	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021521	CGAC	2	8	50817	50824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_021521	AATC	2	8	51471	51478	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_021521	CGGT	2	8	54808	54815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021521	ACCA	2	8	54879	54886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021521	TTCA	2	8	54890	54897	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_021521	GATT	2	8	55227	55234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021521	TTAA	2	8	55266	55273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021521	CAAT	2	8	55691	55698	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_021521	TATG	2	8	59112	59119	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021521	CAAG	2	8	63818	63825	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021521	ATTT	2	8	72433	72440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021521	AAAT	2	8	74299	74306	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021521	TGTC	2	8	82371	82378	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_021521	ATCA	2	8	83909	83916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_021521	TGCC	2	8	84182	84189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_021521	GGTC	2	8	84363	84370	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_021521	ATTG	2	8	84423	84430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021521	ATTA	2	8	91834	91841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021521	TAAT	2	8	92093	92100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021521	CAAA	2	8	96478	96485	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_021521	ATAC	2	8	100569	100576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_021521	ACTT	2	8	102465	102472	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_021521	GTAG	2	8	102497	102504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021521	ATAA	2	8	103012	103019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021521	CTGA	2	8	105143	105150	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_021521	GTTT	2	8	105182	105189	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021521	ATCA	2	8	108139	108146	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_021521	ATTA	2	8	108527	108534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021521	AATC	2	8	108655	108662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_021521	CTTA	2	8	110217	110224	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_021521	AAAG	2	8	111574	111581	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021521	TTTA	2	8	111721	111728	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021521	AGAA	2	8	113082	113089	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021521	TATT	2	8	113090	113097	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021521	ATTA	2	8	113499	113506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021521	TGAT	2	8	113864	113871	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021521	ATTT	2	8	113904	113911	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021521	ATCT	2	8	115047	115054	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_021521	ATTG	2	8	115071	115078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021521	AAAT	2	8	116970	116977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021521	AAAC	2	8	117007	117014	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_021521	AATA	2	8	123470	123477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021521	GCAA	2	8	130769	130776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_021521	TTTC	2	8	130872	130879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_021521	TTAT	2	8	133414	133421	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021521	TGAT	2	8	133565	133572	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021521	CTGA	2	8	142423	142430	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_021521	GTTT	2	8	142462	142469	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021521	GGGT	2	8	143809	143816	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021521	ACCC	2	8	143866	143873	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_021521	ACAG	2	8	148955	148962	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_021521	AGTT	2	8	151314	151321	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021521	TCTT	2	8	156594	156601	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_021521	ATCA	2	8	158576	158583	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_021521	TCAC	2	8	162155	162162	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_021521	ATTG	2	8	167832	167839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021521	GTAA	2	8	171128	171135	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021521	ATAG	2	8	172460	172467	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021521	GAAA	2	8	176311	176318	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021521	TAAG	2	8	176322	176329	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021521	TATT	2	8	179503	179510	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021521	ATCA	2	8	179530	179537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_021521	TTGG	2	8	180306	180313	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021521	AAGT	2	8	180428	180435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021521	TCTT	2	8	180451	180458	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021521	TTTA	2	8	182089	182096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021521	ATTA	2	8	188623	188630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021521	AATT	2	8	188838	188845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021521	GAAC	2	8	189177	189184	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_021521	TGTT	2	8	189509	189516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021521	AGCG	2	8	189694	189701	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_021521	TTTA	2	8	189759	189766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021521	AACT	2	8	190067	190074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_021521	GAAA	2	8	190156	190163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021521	CCTT	2	8	191815	191822	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021521	TGGA	2	8	195824	195831	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021521	GTTT	2	8	195917	195924	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021521	TAAA	2	8	195973	195980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021521	CATT	2	8	199108	199115	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_021521	TCAT	2	8	203157	203164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_021521	GAAC	2	8	205853	205860	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_021521	GCAC	2	8	205917	205924	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021521	ATCA	2	8	206147	206154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_021521	ATCT	2	8	206597	206604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_021521	AGAT	2	8	206665	206672	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021521	TTCT	2	8	206750	206757	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_021521	CTTG	2	8	207082	207089	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021521	GTTG	2	8	207505	207512	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021521	TGTT	2	8	208334	208341	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021521	GGTG	2	8	210651	210658	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021521	GGTG	2	8	211244	211251	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021521	GGTT	2	8	212821	212828	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021521	TGAA	2	8	213058	213065	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021521	TTAA	2	8	213344	213351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021521	CACC	2	8	219191	219198	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_021521	TGTT	2	8	219271	219278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021521	TGTT	2	8	220323	220330	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021521	TTTA	2	8	220584	220591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021521	TAAA	2	8	220600	220607	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021521	GTTT	2	8	220615	220622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021521	AAAT	2	8	220646	220653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021521	GTTA	2	8	220764	220771	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021521	TAAA	2	8	222490	222497	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021521	TAAC	2	8	223280	223287	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021521	TTTA	2	8	223311	223318	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021521	CAGA	2	8	223682	223689	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021521	TGAA	2	8	225646	225653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021521	GCGA	2	8	225692	225699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_021521	CAAT	2	8	226962	226969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_021521	AATA	2	8	230773	230780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021521	TTTC	2	8	235299	235306	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_021521	GTTG	2	8	236839	236846	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021521	TTCT	2	8	239306	239313	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_021521	GGTT	2	8	239922	239929	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021521	AGAT	2	8	252212	252219	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021521	ATAA	2	8	252220	252227	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021521	ATGT	2	8	252231	252238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021521	GAAT	2	8	252253	252260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021521	TTTG	2	8	252283	252290	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021521	TGAT	2	8	252369	252376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_021521	GCCT	2	8	252416	252423	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021521	ATGA	2	8	260947	260954	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021521	ACCA	2	8	261863	261870	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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