MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16L

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021520	AAC	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
2	NC_021520	ACA	3	9	284	292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
3	NC_021520	TTA	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844558
4	NC_021520	CAA	2	6	508	513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
5	NC_021520	GTT	2	6	546	551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844558
6	NC_021520	TGG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844558
7	NC_021520	CTA	2	6	833	838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021520	GCC	2	6	1003	1008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021520	TTC	2	6	1053	1058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021520	AAC	2	6	1137	1142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021520	AAC	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021520	TCT	2	6	1280	1285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021520	TTA	2	6	1424	1429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021520	AAT	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021520	AAC	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021520	TTA	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021520	TAG	2	6	1769	1774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021520	ACT	2	6	1844	1849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021520	TAT	2	6	1905	1910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021520	TTA	2	6	1924	1929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021520	TAA	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021520	CTT	2	6	2074	2079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021520	ATA	2	6	2181	2186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021520	CAA	2	6	2378	2383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_021520	TAA	2	6	2527	2532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021520	TCT	2	6	2535	2540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021520	TCA	2	6	2664	2669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021520	AAT	2	6	2720	2725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021520	ACA	2	6	2752	2757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021520	ATG	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021520	TAA	2	6	2980	2985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021520	ATT	2	6	3077	3082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
33	NC_021520	TTA	3	9	3157	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
34	NC_021520	ACT	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
35	NC_021520	TTC	2	6	3703	3708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844559
36	NC_021520	AAC	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844559
37	NC_021520	TCA	2	6	3817	3822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
38	NC_021520	TTA	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
39	NC_021520	TAT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
40	NC_021520	AAT	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
41	NC_021520	GAC	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844559
42	NC_021520	TAG	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844559
43	NC_021520	ATT	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
44	NC_021520	ATC	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
45	NC_021520	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
46	NC_021520	TAA	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
47	NC_021520	AAC	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844559
48	NC_021520	GAT	2	6	4882	4887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021520	TTA	2	6	5147	5152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021520	GTT	2	6	5319	5324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021520	CAA	2	6	5345	5350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021520	CTT	2	6	5681	5686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021520	TCA	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021520	AAT	2	6	5709	5714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844560
55	NC_021520	ATT	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844560
56	NC_021520	TCT	2	6	5733	5738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844560
57	NC_021520	TTC	2	6	5741	5746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844560
58	NC_021520	TCA	2	6	5772	5777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844560
59	NC_021520	TAA	2	6	5819	5824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844560
60	NC_021520	ACT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844560
61	NC_021520	GAT	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844560
62	NC_021520	ATC	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844561
63	NC_021520	GTT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844561
64	NC_021520	TAA	2	6	6210	6215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844561
65	NC_021520	AGC	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844561
66	NC_021520	TAA	2	6	6276	6281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844561
67	NC_021520	ATT	3	9	6304	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844561
68	NC_021520	CAA	2	6	6377	6382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_021520	TCA	2	6	6441	6446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.