MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16L

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021520	AAC	2	6	199	204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
2	NC_021520	ACA	3	9	284	292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
3	NC_021520	TTA	2	6	350	355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844558
4	NC_021520	CAA	2	6	508	513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844558
5	NC_021520	GTT	2	6	546	551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844558
6	NC_021520	TGG	2	6	555	560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844558
7	NC_021520	ATT	2	6	3077	3082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
8	NC_021520	TTA	3	9	3157	3165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
9	NC_021520	ACT	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
10	NC_021520	TTC	2	6	3703	3708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844559
11	NC_021520	AAC	2	6	3793	3798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844559
12	NC_021520	TCA	2	6	3817	3822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
13	NC_021520	TTA	2	6	3853	3858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
14	NC_021520	TAT	2	6	3920	3925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
15	NC_021520	AAT	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
16	NC_021520	GAC	2	6	4406	4411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844559
17	NC_021520	TAG	2	6	4418	4423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844559
18	NC_021520	ATT	2	6	4493	4498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844559
19	NC_021520	ATC	2	6	4561	4566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844559
20	NC_021520	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
21	NC_021520	TAA	2	6	4663	4668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844559
22	NC_021520	AAC	2	6	4721	4726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844559
23	NC_021520	AAT	2	6	5709	5714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844560
24	NC_021520	ATT	2	6	5727	5732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844560
25	NC_021520	TCT	2	6	5733	5738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844560
26	NC_021520	TTC	2	6	5741	5746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844560
27	NC_021520	TCA	2	6	5772	5777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844560
28	NC_021520	TAA	2	6	5819	5824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844560
29	NC_021520	ACT	2	6	5846	5851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844560
30	NC_021520	GAT	2	6	5860	5865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844560
31	NC_021520	ATC	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844561
32	NC_021520	GTT	2	6	6204	6209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844561
33	NC_021520	TAA	2	6	6210	6215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844561
34	NC_021520	AGC	2	6	6232	6237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844561
35	NC_021520	TAA	2	6	6276	6281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844561
36	NC_021520	ATT	3	9	6304	6312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844561

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.