MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	AACTGA	2	12	886	897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	513844329
2	NC_021519	TTATTT	2	12	10673	10684	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	513844340
3	NC_021519	TTAATA	2	12	11165	11176	50 %	50 %	0 %	0 %	513844340
4	NC_021519	TTAAAT	2	12	18268	18279	50 %	50 %	0 %	0 %	513844347
5	NC_021519	TTCAGT	2	12	24202	24213	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	513844354
6	NC_021519	GTATCA	2	12	30860	30871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	513844359
7	NC_021519	GTTGAC	2	12	39426	39437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	513844369
8	NC_021519	ATTGTG	2	12	47938	47949	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	513844375
9	NC_021519	AAAATT	2	12	52343	52354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844382
10	NC_021519	GATAAA	2	12	52967	52978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	513844383
11	NC_021519	CAACAG	2	12	56199	56210	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	513844386
12	NC_021519	TTAATC	2	12	56401	56412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	513844387
13	NC_021519	TGCGAG	2	12	60763	60774	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	513844391
14	NC_021519	TTTGAT	2	12	61994	62005	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	513844391
15	NC_021519	TCAATT	2	12	63179	63190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	513844392
16	NC_021519	TGACGT	2	12	67435	67446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	513844397
17	NC_021519	GGTGGC	2	12	68129	68140	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	513844397
18	NC_021519	GCCAAT	2	12	71484	71495	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	513844399
19	NC_021519	GAAGCC	2	12	73438	73449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844401
20	NC_021519	CGATAA	2	12	73669	73680	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	513844401

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.