MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	AACTT	2	10	244	253	40 %	40 %	0 %	20 %	513844329
2	NC_021519	GCTTG	2	10	2086	2095	0 %	40 %	40 %	20 %	513844330
3	NC_021519	GAACA	2	10	2848	2857	60 %	0 %	20 %	20 %	513844331
4	NC_021519	TAAAA	2	10	5123	5132	80 %	20 %	0 %	0 %	513844334
5	NC_021519	AGTGA	2	10	6369	6378	40 %	20 %	40 %	0 %	513844335
6	NC_021519	AGTAT	2	10	8731	8740	40 %	40 %	20 %	0 %	513844338
7	NC_021519	GGATT	2	10	10819	10828	20 %	40 %	40 %	0 %	513844340
8	NC_021519	TTATT	2	10	11810	11819	20 %	80 %	0 %	0 %	513844341
9	NC_021519	TTTTC	2	10	16046	16055	0 %	80 %	0 %	20 %	513844345
10	NC_021519	GAATC	2	10	18917	18926	40 %	20 %	20 %	20 %	513844347
11	NC_021519	TTAAT	2	10	19120	19129	40 %	60 %	0 %	0 %	513844347
12	NC_021519	TAAAT	2	10	19161	19170	60 %	40 %	0 %	0 %	513844348
13	NC_021519	GAAGG	2	10	19602	19611	40 %	0 %	60 %	0 %	513844348
14	NC_021519	GTTAA	2	10	24844	24853	40 %	40 %	20 %	0 %	513844354
15	NC_021519	TTGGA	2	10	29553	29562	20 %	40 %	40 %	0 %	513844359
16	NC_021519	GCCTG	2	10	29568	29577	0 %	20 %	40 %	40 %	513844359
17	NC_021519	AACGA	2	10	32831	32840	60 %	0 %	20 %	20 %	513844361
18	NC_021519	CAGTT	2	10	34647	34656	20 %	40 %	20 %	20 %	513844363
19	NC_021519	GTTTT	2	10	37444	37453	0 %	80 %	20 %	0 %	513844367
20	NC_021519	CTTTT	2	10	38214	38223	0 %	80 %	0 %	20 %	513844368
21	NC_021519	AACCA	2	10	40269	40278	60 %	0 %	0 %	40 %	513844369
22	NC_021519	GGTTA	2	10	41318	41327	20 %	40 %	40 %	0 %	513844370
23	NC_021519	AAATC	2	10	41737	41746	60 %	20 %	0 %	20 %	513844370
24	NC_021519	TGGCA	2	10	48004	48013	20 %	20 %	40 %	20 %	513844375
25	NC_021519	CAAAG	2	10	48126	48135	60 %	0 %	20 %	20 %	513844375
26	NC_021519	AAGAT	2	10	50483	50492	60 %	20 %	20 %	0 %	513844377
27	NC_021519	TTAGT	2	10	51318	51327	20 %	60 %	20 %	0 %	513844381
28	NC_021519	GTCGA	2	10	51385	51394	20 %	20 %	40 %	20 %	513844381
29	NC_021519	AAAAT	2	10	53383	53392	80 %	20 %	0 %	0 %	513844384
30	NC_021519	AACCA	2	10	55943	55952	60 %	0 %	0 %	40 %	513844386
31	NC_021519	GCAAT	2	10	57290	57299	40 %	20 %	20 %	20 %	513844388
32	NC_021519	TTCGT	2	10	57919	57928	0 %	60 %	20 %	20 %	513844389
33	NC_021519	CAGAC	2	10	60353	60362	40 %	0 %	20 %	40 %	513844391
34	NC_021519	GGCGG	2	10	63322	63331	0 %	0 %	80 %	20 %	513844393
35	NC_021519	ACGCA	2	10	67254	67263	40 %	0 %	20 %	40 %	513844397
36	NC_021519	CAAGG	2	10	70953	70962	40 %	0 %	40 %	20 %	513844399
37	NC_021519	ATTCA	2	10	73551	73560	40 %	40 %	0 %	20 %	513844401
38	NC_021519	TTGGC	2	10	73884	73893	0 %	40 %	40 %	20 %	513844402
39	NC_021519	TGTTT	2	10	73984	73993	0 %	80 %	20 %	0 %	513844402

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.