MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	AGTT	2	8	1294	1301	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021519	TTTA	2	8	1317	1324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021519	ATTG	2	8	5828	5835	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021519	GTTA	2	8	6002	6009	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021519	CTTT	2	8	13415	13422	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021519	TATT	2	8	16295	16302	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021519	AATA	2	8	16309	16316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021519	GTTG	2	8	16556	16563	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021519	TCGT	2	8	22969	22976	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021519	AGCA	2	8	23005	23012	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021519	TAGA	2	8	25199	25206	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021519	TAAG	2	8	25295	25302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021519	TTAA	2	8	25795	25802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021519	ACGC	2	8	28298	28305	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021519	TTGC	2	8	28768	28775	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_021519	AGTA	2	8	29179	29186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021519	ATTG	2	8	34638	34645	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021519	ATTT	2	8	36666	36673	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021519	ATTA	2	8	37120	37127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021519	GCTA	2	8	38583	38590	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021519	CATA	2	8	38688	38695	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021519	GTGG	2	8	38726	38733	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021519	TTTG	2	8	38746	38753	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021519	TGTT	2	8	38781	38788	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021519	TAAA	2	8	38820	38827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021519	TTGG	2	8	40676	40683	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021519	AGGA	2	8	43534	43541	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021519	ACCT	2	8	43591	43598	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021519	CAAA	2	8	43601	43608	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_021519	AGAA	2	8	48786	48793	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021519	GTTA	2	8	49474	49481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021519	CTGA	2	8	49495	49502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_021519	TGGC	2	8	52763	52770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_021519	GGGA	2	8	53722	53729	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021519	TGAG	2	8	57399	57406	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021519	TGGT	2	8	58613	58620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021519	CAGC	2	8	58681	58688	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021519	CAAG	2	8	59373	59380	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_021519	CAAT	2	8	59551	59558	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_021519	AAAG	2	8	62179	62186	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021519	AAAT	2	8	72819	72826	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021519	TTCC	2	8	74028	74035	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.