MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 159

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	ATGA	2	8	30	37	50 %	25 %	25 %	0 %	513844329
2	NC_021519	ACTT	2	8	522	529	25 %	50 %	0 %	25 %	513844329
3	NC_021519	ATGC	2	8	1882	1889	25 %	25 %	25 %	25 %	513844330
4	NC_021519	GCTT	2	8	2173	2180	0 %	50 %	25 %	25 %	513844330
5	NC_021519	TTCA	2	8	2440	2447	25 %	50 %	0 %	25 %	513844331
6	NC_021519	AATC	2	8	2452	2459	50 %	25 %	0 %	25 %	513844331
7	NC_021519	TACG	2	8	2589	2596	25 %	25 %	25 %	25 %	513844331
8	NC_021519	GTTT	2	8	2862	2869	0 %	75 %	25 %	0 %	513844331
9	NC_021519	CATT	2	8	3173	3180	25 %	50 %	0 %	25 %	513844332
10	NC_021519	CGTT	2	8	3412	3419	0 %	50 %	25 %	25 %	513844332
11	NC_021519	ACGA	2	8	3571	3578	50 %	0 %	25 %	25 %	513844332
12	NC_021519	ACCT	2	8	3628	3635	25 %	25 %	0 %	50 %	513844332
13	NC_021519	CGAT	2	8	3758	3765	25 %	25 %	25 %	25 %	513844332
14	NC_021519	GATT	2	8	3837	3844	25 %	50 %	25 %	0 %	513844332
15	NC_021519	ATTA	2	8	4949	4956	50 %	50 %	0 %	0 %	513844334
16	NC_021519	AATT	2	8	6280	6287	50 %	50 %	0 %	0 %	513844335
17	NC_021519	GTTG	2	8	6581	6588	0 %	50 %	50 %	0 %	513844335
18	NC_021519	AAGG	2	8	7046	7053	50 %	0 %	50 %	0 %	513844336
19	NC_021519	ATCC	2	8	7178	7185	25 %	25 %	0 %	50 %	513844336
20	NC_021519	TGAC	2	8	7335	7342	25 %	25 %	25 %	25 %	513844336
21	NC_021519	ATAA	2	8	7539	7546	75 %	25 %	0 %	0 %	513844336
22	NC_021519	CCTT	2	8	7596	7603	0 %	50 %	0 %	50 %	513844337
23	NC_021519	CAAA	2	8	9239	9246	75 %	0 %	0 %	25 %	513844339
24	NC_021519	GTAT	2	8	11746	11753	25 %	50 %	25 %	0 %	513844341
25	NC_021519	CTAT	2	8	12148	12155	25 %	50 %	0 %	25 %	513844341
26	NC_021519	CTAC	2	8	12201	12208	25 %	25 %	0 %	50 %	513844341
27	NC_021519	CGTC	2	8	12762	12769	0 %	25 %	25 %	50 %	513844342
28	NC_021519	TTAA	2	8	14798	14805	50 %	50 %	0 %	0 %	513844344
29	NC_021519	GTGG	2	8	14851	14858	0 %	25 %	75 %	0 %	513844344
30	NC_021519	AGAA	2	8	15185	15192	75 %	0 %	25 %	0 %	513844345
31	NC_021519	CAAT	2	8	16099	16106	50 %	25 %	0 %	25 %	513844345
32	NC_021519	CAAT	2	8	16225	16232	50 %	25 %	0 %	25 %	513844345
33	NC_021519	TTTA	2	8	16693	16700	25 %	75 %	0 %	0 %	513844346
34	NC_021519	CAAT	2	8	16728	16735	50 %	25 %	0 %	25 %	513844346
35	NC_021519	GTTA	2	8	16943	16950	25 %	50 %	25 %	0 %	513844346
36	NC_021519	CATA	2	8	17244	17251	50 %	25 %	0 %	25 %	513844346
37	NC_021519	CAAG	2	8	17315	17322	50 %	0 %	25 %	25 %	513844346
38	NC_021519	AGTT	2	8	17383	17390	25 %	50 %	25 %	0 %	513844346
39	NC_021519	TGTA	2	8	17445	17452	25 %	50 %	25 %	0 %	513844346
40	NC_021519	AAAG	2	8	17677	17684	75 %	0 %	25 %	0 %	513844346
41	NC_021519	TATT	2	8	17836	17843	25 %	75 %	0 %	0 %	513844347
42	NC_021519	TTTC	2	8	17846	17853	0 %	75 %	0 %	25 %	513844347
43	NC_021519	TTTA	2	8	18251	18258	25 %	75 %	0 %	0 %	513844347
44	NC_021519	ATTT	2	8	18392	18399	25 %	75 %	0 %	0 %	513844347
45	NC_021519	ATAG	2	8	18528	18535	50 %	25 %	25 %	0 %	513844347
46	NC_021519	ATCA	2	8	18818	18825	50 %	25 %	0 %	25 %	513844347
47	NC_021519	ATTT	2	8	18935	18942	25 %	75 %	0 %	0 %	513844347
48	NC_021519	GAAG	2	8	19092	19099	50 %	0 %	50 %	0 %	513844347
49	NC_021519	CCAA	2	8	19413	19420	50 %	0 %	0 %	50 %	513844348
50	NC_021519	GGTT	2	8	19529	19536	0 %	50 %	50 %	0 %	513844348
51	NC_021519	ATAC	2	8	19813	19820	50 %	25 %	0 %	25 %	513844348
52	NC_021519	TTAT	2	8	21098	21105	25 %	75 %	0 %	0 %	513844350
53	NC_021519	GTTA	2	8	21176	21183	25 %	50 %	25 %	0 %	513844350
54	NC_021519	CAAC	2	8	21910	21917	50 %	0 %	0 %	50 %	513844351
55	NC_021519	TCTT	2	8	22550	22557	0 %	75 %	0 %	25 %	513844352
56	NC_021519	TCTT	2	8	22680	22687	0 %	75 %	0 %	25 %	513844352
57	NC_021519	AATT	2	8	23363	23370	50 %	50 %	0 %	0 %	513844353
58	NC_021519	TAAA	2	8	23896	23903	75 %	25 %	0 %	0 %	513844354
59	NC_021519	TTCA	2	8	25062	25069	25 %	50 %	0 %	25 %	513844354
60	NC_021519	AATT	2	8	25850	25857	50 %	50 %	0 %	0 %	513844355
61	NC_021519	TTAA	2	8	26332	26339	50 %	50 %	0 %	0 %	513844355
62	NC_021519	TGGC	2	8	26478	26485	0 %	25 %	50 %	25 %	513844355
63	NC_021519	GAAC	2	8	26609	26616	50 %	0 %	25 %	25 %	513844355
64	NC_021519	CAAA	2	8	26754	26761	75 %	0 %	0 %	25 %	513844355
65	NC_021519	GCAA	2	8	26819	26826	50 %	0 %	25 %	25 %	513844355
66	NC_021519	CTGG	2	8	27078	27085	0 %	25 %	50 %	25 %	513844355
67	NC_021519	CGAA	2	8	27328	27335	50 %	0 %	25 %	25 %	513844356
68	NC_021519	ATCG	2	8	27779	27786	25 %	25 %	25 %	25 %	513844356
69	NC_021519	ACTA	2	8	27850	27857	50 %	25 %	0 %	25 %	513844356
70	NC_021519	TCTA	2	8	28543	28550	25 %	50 %	0 %	25 %	513844357
71	NC_021519	CAAA	2	8	28840	28847	75 %	0 %	0 %	25 %	513844358
72	NC_021519	TGAT	2	8	28934	28941	25 %	50 %	25 %	0 %	513844358
73	NC_021519	TGGT	2	8	29383	29390	0 %	50 %	50 %	0 %	513844359
74	NC_021519	TTAT	2	8	29450	29457	25 %	75 %	0 %	0 %	513844359
75	NC_021519	TTGA	2	8	29988	29995	25 %	50 %	25 %	0 %	513844359
76	NC_021519	CGGC	2	8	30538	30545	0 %	0 %	50 %	50 %	513844359
77	NC_021519	GATT	2	8	30818	30825	25 %	50 %	25 %	0 %	513844359
78	NC_021519	ATTA	2	8	31278	31285	50 %	50 %	0 %	0 %	513844359
79	NC_021519	ATCA	2	8	31900	31907	50 %	25 %	0 %	25 %	513844359
80	NC_021519	GCTA	2	8	31950	31957	25 %	25 %	25 %	25 %	513844359
81	NC_021519	CAAA	2	8	32361	32368	75 %	0 %	0 %	25 %	513844361
82	NC_021519	ACCT	2	8	32822	32829	25 %	25 %	0 %	50 %	513844361
83	NC_021519	TGAT	2	8	32919	32926	25 %	50 %	25 %	0 %	513844361
84	NC_021519	TTGA	2	8	33677	33684	25 %	50 %	25 %	0 %	513844361
85	NC_021519	TGGT	2	8	34383	34390	0 %	50 %	50 %	0 %	513844362
86	NC_021519	GAAT	2	8	34399	34406	50 %	25 %	25 %	0 %	513844362
87	NC_021519	TGTT	2	8	34524	34531	0 %	75 %	25 %	0 %	513844362
88	NC_021519	TGGT	2	8	34813	34820	0 %	50 %	50 %	0 %	513844363
89	NC_021519	TTCA	2	8	35026	35033	25 %	50 %	0 %	25 %	513844363
90	NC_021519	GCTG	2	8	35215	35222	0 %	25 %	50 %	25 %	513844364
91	NC_021519	CATA	2	8	35984	35991	50 %	25 %	0 %	25 %	513844365
92	NC_021519	CAAT	2	8	36107	36114	50 %	25 %	0 %	25 %	513844365
93	NC_021519	GCCA	2	8	36860	36867	25 %	0 %	25 %	50 %	513844366
94	NC_021519	GATA	2	8	37662	37669	50 %	25 %	25 %	0 %	513844368
95	NC_021519	ATTC	2	8	38124	38131	25 %	50 %	0 %	25 %	513844368
96	NC_021519	GATT	2	8	39119	39126	25 %	50 %	25 %	0 %	513844369
97	NC_021519	CGTC	2	8	39578	39585	0 %	25 %	25 %	50 %	513844369
98	NC_021519	TTAA	2	8	39891	39898	50 %	50 %	0 %	0 %	513844369
99	NC_021519	TAAT	2	8	40066	40073	50 %	50 %	0 %	0 %	513844369
100	NC_021519	GCAA	2	8	40421	40428	50 %	0 %	25 %	25 %	513844369
101	NC_021519	TATC	2	8	41089	41096	25 %	50 %	0 %	25 %	513844370
102	NC_021519	CAAA	2	8	41778	41785	75 %	0 %	0 %	25 %	513844370
103	NC_021519	GCAA	2	8	41997	42004	50 %	0 %	25 %	25 %	513844370
104	NC_021519	GTGG	2	8	42421	42428	0 %	25 %	75 %	0 %	513844370
105	NC_021519	CCCA	2	8	44390	44397	25 %	0 %	0 %	75 %	513844372
106	NC_021519	ATGA	2	8	44777	44784	50 %	25 %	25 %	0 %	513844372
107	NC_021519	GCCG	2	8	45361	45368	0 %	0 %	50 %	50 %	513844373
108	NC_021519	TTTC	2	8	46567	46574	0 %	75 %	0 %	25 %	513844373
109	NC_021519	CTGT	2	8	47034	47041	0 %	50 %	25 %	25 %	513844375
110	NC_021519	GGTT	2	8	47695	47702	0 %	50 %	50 %	0 %	513844375
111	NC_021519	TAAA	2	8	47813	47820	75 %	25 %	0 %	0 %	513844375
112	NC_021519	TCAG	2	8	49695	49702	25 %	25 %	25 %	25 %	513844377
113	NC_021519	CAAT	2	8	49711	49718	50 %	25 %	0 %	25 %	513844377
114	NC_021519	TCAA	2	8	50363	50370	50 %	25 %	0 %	25 %	513844377
115	NC_021519	TGAT	2	8	50879	50886	25 %	50 %	25 %	0 %	513844379
116	NC_021519	ACCC	2	8	50944	50951	25 %	0 %	0 %	75 %	513844379
117	NC_021519	TCAG	2	8	51531	51538	25 %	25 %	25 %	25 %	513844381
118	NC_021519	GGTT	2	8	52155	52162	0 %	50 %	50 %	0 %	513844382
119	NC_021519	AGAC	2	8	52241	52248	50 %	0 %	25 %	25 %	513844382
120	NC_021519	GGGT	2	8	53612	53619	0 %	25 %	75 %	0 %	513844384
121	NC_021519	GAAA	2	8	54091	54098	75 %	0 %	25 %	0 %	513844385
122	NC_021519	TTGA	2	8	54678	54685	25 %	50 %	25 %	0 %	513844386
123	NC_021519	TCAA	2	8	55198	55205	50 %	25 %	0 %	25 %	513844386
124	NC_021519	ACGG	2	8	55289	55296	25 %	0 %	50 %	25 %	513844386
125	NC_021519	CGCT	2	8	55684	55691	0 %	25 %	25 %	50 %	513844386
126	NC_021519	GCTA	2	8	56025	56032	25 %	25 %	25 %	25 %	513844386
127	NC_021519	AAGC	2	8	56034	56041	50 %	0 %	25 %	25 %	513844386
128	NC_021519	TTAG	2	8	56602	56609	25 %	50 %	25 %	0 %	513844387
129	NC_021519	TGGT	2	8	56695	56702	0 %	50 %	50 %	0 %	513844387
130	NC_021519	GCTT	2	8	56920	56927	0 %	50 %	25 %	25 %	513844387
131	NC_021519	AAAT	2	8	57047	57054	75 %	25 %	0 %	0 %	513844388
132	NC_021519	AAGG	2	8	57241	57248	50 %	0 %	50 %	0 %	513844388
133	NC_021519	TTTC	2	8	58947	58954	0 %	75 %	0 %	25 %	513844390
134	NC_021519	CCAG	2	8	59883	59890	25 %	0 %	25 %	50 %	513844391
135	NC_021519	TTAA	2	8	60668	60675	50 %	50 %	0 %	0 %	513844391
136	NC_021519	CAAT	2	8	61170	61177	50 %	25 %	0 %	25 %	513844391
137	NC_021519	CGGC	2	8	62683	62690	0 %	0 %	50 %	50 %	513844392
138	NC_021519	TTGA	2	8	63024	63031	25 %	50 %	25 %	0 %	513844392
139	NC_021519	AATT	2	8	63485	63492	50 %	50 %	0 %	0 %	513844394
140	NC_021519	GCAA	2	8	63570	63577	50 %	0 %	25 %	25 %	513844394
141	NC_021519	TTTG	2	8	64014	64021	0 %	75 %	25 %	0 %	513844394
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.