MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	CAC	2	6	99	104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844329
2	NC_021519	GCT	2	6	125	130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844329
3	NC_021519	TAA	2	6	194	199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844329
4	NC_021519	AAC	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844329
5	NC_021519	CTG	2	6	370	375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844329
6	NC_021519	ACT	2	6	412	417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844329
7	NC_021519	TCT	2	6	508	513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844329
8	NC_021519	AAG	2	6	556	561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844329
9	NC_021519	AAG	2	6	601	606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844329
10	NC_021519	CTG	2	6	657	662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844329
11	NC_021519	TGT	2	6	697	702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844329
12	NC_021519	TGA	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844329
13	NC_021519	GCC	2	6	864	869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844329
14	NC_021519	AGC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844329
15	NC_021519	CAA	2	6	908	913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844329
16	NC_021519	CCA	2	6	987	992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844329
17	NC_021519	TAA	2	6	1037	1042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844329
18	NC_021519	CAC	2	6	1055	1060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844329
19	NC_021519	CCA	2	6	1061	1066	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844329
20	NC_021519	CAT	2	6	1192	1197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844329
21	NC_021519	ATT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844330
22	NC_021519	TAT	2	6	1531	1536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844330
23	NC_021519	ATA	2	6	1751	1756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844330
24	NC_021519	TAT	2	6	1759	1764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844330
25	NC_021519	GGC	2	6	1768	1773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844330
26	NC_021519	TGA	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844330
27	NC_021519	TTG	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844330
28	NC_021519	GTT	2	6	1966	1971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844330
29	NC_021519	GAA	2	6	1980	1985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844330
30	NC_021519	CAC	2	6	1997	2002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844330
31	NC_021519	GTG	2	6	2003	2008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844330
32	NC_021519	CAA	2	6	2028	2033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844330
33	NC_021519	AAG	2	6	2120	2125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844330
34	NC_021519	AGT	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844330
35	NC_021519	AGA	2	6	2181	2186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844330
36	NC_021519	GAA	3	9	2247	2255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844330
37	NC_021519	TTA	2	6	2272	2277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844330
38	NC_021519	AAC	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844331
39	NC_021519	ATT	2	6	2347	2352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844331
40	NC_021519	CAG	2	6	2357	2362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844331
41	NC_021519	AAG	2	6	2417	2422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844331
42	NC_021519	GTG	2	6	2536	2541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844331
43	NC_021519	TAT	2	6	2613	2618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844331
44	NC_021519	ACC	2	6	2630	2635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844331
45	NC_021519	ACT	2	6	2717	2722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844331
46	NC_021519	TGG	2	6	2739	2744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844331
47	NC_021519	ACA	2	6	2826	2831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844331
48	NC_021519	TTA	2	6	2902	2907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844332
49	NC_021519	GGT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844332
50	NC_021519	ATC	3	9	2960	2968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844332
51	NC_021519	GAA	2	6	3028	3033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844332
52	NC_021519	TGA	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844332
53	NC_021519	CAA	2	6	3103	3108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844332
54	NC_021519	CGC	2	6	3129	3134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844332
55	NC_021519	ATT	2	6	3190	3195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844332
56	NC_021519	CCA	2	6	3243	3248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844332
57	NC_021519	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844332
58	NC_021519	CAG	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844332
59	NC_021519	CTA	2	6	3431	3436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844332
60	NC_021519	AAT	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844332
61	NC_021519	ATG	2	6	3716	3721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844332
62	NC_021519	TGG	2	6	3865	3870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844332
63	NC_021519	AAT	2	6	3917	3922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844332
64	NC_021519	TTG	2	6	3970	3975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844333
65	NC_021519	CAG	2	6	4141	4146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844333
66	NC_021519	AGC	2	6	4223	4228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844333
67	NC_021519	AGA	2	6	4301	4306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844333
68	NC_021519	GAA	2	6	4356	4361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844333
69	NC_021519	GTG	2	6	4375	4380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844333
70	NC_021519	ATT	2	6	4384	4389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844333
71	NC_021519	ATA	2	6	4591	4596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844333
72	NC_021519	GAA	2	6	4631	4636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844333
73	NC_021519	AGT	2	6	4649	4654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844333
74	NC_021519	TGA	2	6	4708	4713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844333
75	NC_021519	TTA	2	6	4879	4884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844334
76	NC_021519	CTT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844334
77	NC_021519	TTA	2	6	4926	4931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844334
78	NC_021519	TGT	2	6	5077	5082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844334
79	NC_021519	GAT	2	6	5133	5138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844334
80	NC_021519	GTT	2	6	5198	5203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844334
81	NC_021519	ATG	2	6	6045	6050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844335
82	NC_021519	CTT	2	6	6155	6160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844335
83	NC_021519	GCA	2	6	6242	6247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844335
84	NC_021519	GAT	2	6	6260	6265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844335
85	NC_021519	GGT	2	6	6296	6301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844335
86	NC_021519	CAA	2	6	6318	6323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844335
87	NC_021519	ATT	2	6	6498	6503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844335
88	NC_021519	AAC	2	6	6510	6515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844335
89	NC_021519	TTG	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844335
90	NC_021519	TCG	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844335
91	NC_021519	ACG	2	6	6658	6663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844335
92	NC_021519	TGA	2	6	6677	6682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844335
93	NC_021519	GAA	2	6	6734	6739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844335
94	NC_021519	TGG	2	6	6758	6763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844335
95	NC_021519	AGG	2	6	6814	6819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513844335
96	NC_021519	ACG	2	6	6878	6883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844336
97	NC_021519	GAT	2	6	6991	6996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844336
98	NC_021519	ACG	2	6	7103	7108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844336
99	NC_021519	ATG	2	6	7170	7175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844336
100	NC_021519	TGA	2	6	7206	7211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844336
101	NC_021519	GTA	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844336
102	NC_021519	TTG	2	6	7308	7313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844336
103	NC_021519	CAC	2	6	7317	7322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844336
104	NC_021519	GTT	2	6	7382	7387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844336
105	NC_021519	AGC	2	6	7408	7413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844336
106	NC_021519	TCA	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844336
107	NC_021519	ACA	2	6	7506	7511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844336
108	NC_021519	TAC	2	6	7523	7528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844336
109	NC_021519	TGA	2	6	7583	7588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844337
110	NC_021519	CAT	2	6	7671	7676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844337
111	NC_021519	GCG	2	6	7716	7721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844337
112	NC_021519	TGA	2	6	7820	7825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844337
113	NC_021519	TTG	2	6	7827	7832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844337
114	NC_021519	ATT	2	6	7971	7976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844337
115	NC_021519	CCA	2	6	8035	8040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844337
116	NC_021519	TAG	2	6	8044	8049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844337
117	NC_021519	TTG	2	6	8232	8237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844337
118	NC_021519	ATT	2	6	8394	8399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844338
119	NC_021519	TTG	2	6	8646	8651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844338
120	NC_021519	AGA	2	6	8690	8695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844338
121	NC_021519	TGA	2	6	8741	8746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844338
122	NC_021519	ACC	2	6	8801	8806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844338
123	NC_021519	TGA	2	6	8915	8920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844338
124	NC_021519	TGG	2	6	9140	9145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513844339
125	NC_021519	GCA	2	6	9179	9184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844339
126	NC_021519	ACA	2	6	9189	9194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844339
127	NC_021519	TAT	2	6	9318	9323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844339
128	NC_021519	ACG	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844339
129	NC_021519	GGC	2	6	9453	9458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844339
130	NC_021519	AAC	2	6	9635	9640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844339
131	NC_021519	ATT	3	9	9739	9747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513844339
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471	NC_021519	CTT	2	6	37523	37528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844367
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492	NC_021519	TTG	2	6	40254	40259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844369
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496	NC_021519	ACA	2	6	40550	40555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513844369
497	NC_021519	TGA	2	6	40565	40570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844369
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499	NC_021519	TAA	3	9	41007	41015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844370
500	NC_021519	GGC	2	6	41044	41049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513844370

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