MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16H

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021519	G	7	7	2287	2293	0 %	0 %	100 %	0 %	513844330
2	NC_021519	A	6	6	4050	4055	100 %	0 %	0 %	0 %	513844333
3	NC_021519	A	6	6	4205	4210	100 %	0 %	0 %	0 %	513844333
4	NC_021519	A	7	7	4728	4734	100 %	0 %	0 %	0 %	513844333
5	NC_021519	A	6	6	4819	4824	100 %	0 %	0 %	0 %	513844334
6	NC_021519	T	6	6	4990	4995	0 %	100 %	0 %	0 %	513844334
7	NC_021519	T	6	6	5559	5564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021519	A	6	6	5683	5688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021519	A	7	7	5850	5856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021519	T	6	6	6072	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	513844335
11	NC_021519	A	6	6	6564	6569	100 %	0 %	0 %	0 %	513844335
12	NC_021519	A	6	6	7439	7444	100 %	0 %	0 %	0 %	513844336
13	NC_021519	A	8	8	8284	8291	100 %	0 %	0 %	0 %	513844337
14	NC_021519	A	6	6	8950	8955	100 %	0 %	0 %	0 %	513844338
15	NC_021519	T	6	6	9385	9390	0 %	100 %	0 %	0 %	513844339
16	NC_021519	A	6	6	11107	11112	100 %	0 %	0 %	0 %	513844340
17	NC_021519	T	6	6	11124	11129	0 %	100 %	0 %	0 %	513844340
18	NC_021519	A	7	7	11322	11328	100 %	0 %	0 %	0 %	513844341
19	NC_021519	T	7	7	11555	11561	0 %	100 %	0 %	0 %	513844341
20	NC_021519	A	7	7	11786	11792	100 %	0 %	0 %	0 %	513844341
21	NC_021519	T	6	6	11975	11980	0 %	100 %	0 %	0 %	513844341
22	NC_021519	T	6	6	12299	12304	0 %	100 %	0 %	0 %	513844341
23	NC_021519	A	7	7	12410	12416	100 %	0 %	0 %	0 %	513844341
24	NC_021519	T	6	6	12569	12574	0 %	100 %	0 %	0 %	513844342
25	NC_021519	T	6	6	12585	12590	0 %	100 %	0 %	0 %	513844342
26	NC_021519	A	6	6	13282	13287	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021519	T	6	6	13469	13474	0 %	100 %	0 %	0 %	513844343
28	NC_021519	T	6	6	13783	13788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021519	A	9	9	14008	14016	100 %	0 %	0 %	0 %	513844344
30	NC_021519	T	6	6	14113	14118	0 %	100 %	0 %	0 %	513844344
31	NC_021519	T	8	8	14299	14306	0 %	100 %	0 %	0 %	513844344
32	NC_021519	A	6	6	14396	14401	100 %	0 %	0 %	0 %	513844344
33	NC_021519	A	7	7	14602	14608	100 %	0 %	0 %	0 %	513844344
34	NC_021519	A	7	7	14880	14886	100 %	0 %	0 %	0 %	513844344
35	NC_021519	A	7	7	15612	15618	100 %	0 %	0 %	0 %	513844345
36	NC_021519	A	8	8	15700	15707	100 %	0 %	0 %	0 %	513844345
37	NC_021519	A	7	7	15863	15869	100 %	0 %	0 %	0 %	513844345
38	NC_021519	T	6	6	16255	16260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021519	T	6	6	17011	17016	0 %	100 %	0 %	0 %	513844346
40	NC_021519	T	6	6	17075	17080	0 %	100 %	0 %	0 %	513844346
41	NC_021519	T	6	6	17987	17992	0 %	100 %	0 %	0 %	513844347
42	NC_021519	T	7	7	18055	18061	0 %	100 %	0 %	0 %	513844347
43	NC_021519	A	7	7	18095	18101	100 %	0 %	0 %	0 %	513844347
44	NC_021519	T	7	7	18169	18175	0 %	100 %	0 %	0 %	513844347
45	NC_021519	T	6	6	18239	18244	0 %	100 %	0 %	0 %	513844347
46	NC_021519	A	6	6	18302	18307	100 %	0 %	0 %	0 %	513844347
47	NC_021519	T	6	6	18310	18315	0 %	100 %	0 %	0 %	513844347
48	NC_021519	T	6	6	18539	18544	0 %	100 %	0 %	0 %	513844347
49	NC_021519	T	8	8	18619	18626	0 %	100 %	0 %	0 %	513844347
50	NC_021519	A	6	6	18731	18736	100 %	0 %	0 %	0 %	513844347
51	NC_021519	T	6	6	18978	18983	0 %	100 %	0 %	0 %	513844347
52	NC_021519	A	6	6	19290	19295	100 %	0 %	0 %	0 %	513844348
53	NC_021519	A	7	7	20406	20412	100 %	0 %	0 %	0 %	513844349
54	NC_021519	T	6	6	21431	21436	0 %	100 %	0 %	0 %	513844350
55	NC_021519	A	6	6	21513	21518	100 %	0 %	0 %	0 %	513844350
56	NC_021519	T	6	6	22439	22444	0 %	100 %	0 %	0 %	513844352
57	NC_021519	T	7	7	22462	22468	0 %	100 %	0 %	0 %	513844352
58	NC_021519	A	6	6	23725	23730	100 %	0 %	0 %	0 %	513844353
59	NC_021519	A	6	6	23777	23782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021519	A	6	6	23784	23789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021519	T	6	6	25242	25247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021519	T	6	6	25513	25518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021519	A	6	6	26642	26647	100 %	0 %	0 %	0 %	513844355
64	NC_021519	A	6	6	27245	27250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021519	A	6	6	27528	27533	100 %	0 %	0 %	0 %	513844356
66	NC_021519	T	6	6	28223	28228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021519	T	7	7	29144	29150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021519	A	6	6	29726	29731	100 %	0 %	0 %	0 %	513844359
69	NC_021519	A	6	6	29853	29858	100 %	0 %	0 %	0 %	513844359
70	NC_021519	A	6	6	30012	30017	100 %	0 %	0 %	0 %	513844359
71	NC_021519	C	6	6	32898	32903	0 %	0 %	0 %	100 %	513844361
72	NC_021519	A	6	6	33702	33707	100 %	0 %	0 %	0 %	513844361
73	NC_021519	T	6	6	34305	34310	0 %	100 %	0 %	0 %	513844362
74	NC_021519	T	6	6	35059	35064	0 %	100 %	0 %	0 %	513844364
75	NC_021519	T	6	6	36215	36220	0 %	100 %	0 %	0 %	513844365
76	NC_021519	A	6	6	36633	36638	100 %	0 %	0 %	0 %	513844365
77	NC_021519	A	7	7	37136	37142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021519	T	7	7	37160	37166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021519	T	7	7	37381	37387	0 %	100 %	0 %	0 %	513844367
80	NC_021519	A	6	6	38244	38249	100 %	0 %	0 %	0 %	513844368
81	NC_021519	A	6	6	38348	38353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021519	A	6	6	38483	38488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021519	A	6	6	38829	38834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021519	T	6	6	39066	39071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021519	A	7	7	39205	39211	100 %	0 %	0 %	0 %	513844369
86	NC_021519	T	6	6	40951	40956	0 %	100 %	0 %	0 %	513844370
87	NC_021519	T	6	6	41236	41241	0 %	100 %	0 %	0 %	513844370
88	NC_021519	A	6	6	41554	41559	100 %	0 %	0 %	0 %	513844370
89	NC_021519	T	6	6	43688	43693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021519	A	6	6	44234	44239	100 %	0 %	0 %	0 %	513844372
91	NC_021519	T	6	6	45554	45559	0 %	100 %	0 %	0 %	513844373
92	NC_021519	A	6	6	46277	46282	100 %	0 %	0 %	0 %	513844373
93	NC_021519	A	7	7	46782	46788	100 %	0 %	0 %	0 %	513844374
94	NC_021519	C	6	6	47195	47200	0 %	0 %	0 %	100 %	513844375
95	NC_021519	A	6	6	47350	47355	100 %	0 %	0 %	0 %	513844375
96	NC_021519	A	6	6	49224	49229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021519	T	6	6	49468	49473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021519	T	6	6	49550	49555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021519	A	7	7	50004	50010	100 %	0 %	0 %	0 %	513844377
100	NC_021519	A	6	6	50157	50162	100 %	0 %	0 %	0 %	513844377
101	NC_021519	A	7	7	51230	51236	100 %	0 %	0 %	0 %	513844380
102	NC_021519	A	6	6	51731	51736	100 %	0 %	0 %	0 %	513844382
103	NC_021519	A	6	6	52570	52575	100 %	0 %	0 %	0 %	513844382
104	NC_021519	A	6	6	52713	52718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021519	A	8	8	53765	53772	100 %	0 %	0 %	0 %	513844385
106	NC_021519	A	6	6	55415	55420	100 %	0 %	0 %	0 %	513844386
107	NC_021519	T	6	6	55652	55657	0 %	100 %	0 %	0 %	513844386
108	NC_021519	A	6	6	56074	56079	100 %	0 %	0 %	0 %	513844386
109	NC_021519	A	6	6	56112	56117	100 %	0 %	0 %	0 %	513844386
110	NC_021519	G	6	6	56589	56594	0 %	0 %	100 %	0 %	513844387
111	NC_021519	A	6	6	57074	57079	100 %	0 %	0 %	0 %	513844388
112	NC_021519	A	6	6	57347	57352	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021519	A	8	8	57800	57807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021519	A	6	6	59239	59244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021519	A	7	7	59418	59424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021519	A	6	6	59467	59472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021519	A	6	6	60912	60917	100 %	0 %	0 %	0 %	513844391
118	NC_021519	A	6	6	61592	61597	100 %	0 %	0 %	0 %	513844391
119	NC_021519	A	6	6	61949	61954	100 %	0 %	0 %	0 %	513844391
120	NC_021519	T	7	7	62249	62255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021519	G	6	6	63452	63457	0 %	0 %	100 %	0 %	513844394
122	NC_021519	A	6	6	63523	63528	100 %	0 %	0 %	0 %	513844394
123	NC_021519	C	7	7	64180	64186	0 %	0 %	0 %	100 %	513844395
124	NC_021519	A	6	6	66302	66307	100 %	0 %	0 %	0 %	513844397
125	NC_021519	A	6	6	67074	67079	100 %	0 %	0 %	0 %	513844397
126	NC_021519	A	7	7	68306	68312	100 %	0 %	0 %	0 %	513844397
127	NC_021519	A	7	7	68384	68390	100 %	0 %	0 %	0 %	513844397
128	NC_021519	G	6	6	68919	68924	0 %	0 %	100 %	0 %	513844398
129	NC_021519	A	6	6	69026	69031	100 %	0 %	0 %	0 %	513844398
130	NC_021519	A	6	6	69201	69206	100 %	0 %	0 %	0 %	513844398
131	NC_021519	A	6	6	72362	72367	100 %	0 %	0 %	0 %	513844400
132	NC_021519	A	6	6	72670	72675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021519	T	6	6	73258	73263	0 %	100 %	0 %	0 %	513844401
134	NC_021519	T	7	7	73796	73802	0 %	100 %	0 %	0 %	513844402

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.