MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	AACCA	2	10	2040	2049	60 %	0 %	0 %	40 %	513843970
2	NC_021518	CAATA	2	10	2509	2518	60 %	20 %	0 %	20 %	513843970
3	NC_021518	TTAAC	2	10	7699	7708	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_021518	CTTCA	2	10	10983	10992	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_021518	AATTA	2	10	11269	11278	60 %	40 %	0 %	0 %	513843978
6	NC_021518	ACCAT	2	10	12021	12030	40 %	20 %	0 %	40 %	513843979
7	NC_021518	GAATA	2	10	12413	12422	60 %	20 %	20 %	0 %	513843979
8	NC_021518	GATTA	2	10	13365	13374	40 %	40 %	20 %	0 %	513843979
9	NC_021518	TTGCA	2	10	13713	13722	20 %	40 %	20 %	20 %	513843979
10	NC_021518	CTAAT	2	10	14880	14889	40 %	40 %	0 %	20 %	513843981
11	NC_021518	GCATT	2	10	15115	15124	20 %	40 %	20 %	20 %	513843981
12	NC_021518	CTTTT	2	10	15323	15332	0 %	80 %	0 %	20 %	513843981
13	NC_021518	GGACA	2	10	18842	18851	40 %	0 %	40 %	20 %	513843985
14	NC_021518	GCTAA	2	10	21028	21037	40 %	20 %	20 %	20 %	513843988
15	NC_021518	AAATC	2	10	21833	21842	60 %	20 %	0 %	20 %	513843990
16	NC_021518	CTAAA	2	10	23282	23291	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021518	ACTTC	2	10	26954	26963	20 %	40 %	0 %	40 %	513843998
18	NC_021518	TTTAG	2	10	29352	29361	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021518	ATCCG	2	10	30831	30840	20 %	20 %	20 %	40 %	513844001
20	NC_021518	CATGC	2	10	32853	32862	20 %	20 %	20 %	40 %	513844005
21	NC_021518	AAAAG	2	10	34378	34387	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021518	GCTAA	2	10	35528	35537	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_021518	AAATC	2	10	36332	36341	60 %	20 %	0 %	20 %	513844010
24	NC_021518	TTGAC	2	10	38032	38041	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_021518	TAAAA	2	10	40177	40186	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021518	TAATT	2	10	42795	42804	40 %	60 %	0 %	0 %	513844019
27	NC_021518	TTCTT	2	10	43388	43397	0 %	80 %	0 %	20 %	513844019
28	NC_021518	ATCTT	2	10	45127	45136	20 %	60 %	0 %	20 %	513844021
29	NC_021518	AAAAT	2	10	45565	45574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021518	AAGCA	2	10	46021	46030	60 %	0 %	20 %	20 %	513844022

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.