MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	AACCA	2	10	2040	2049	60 %	0 %	0 %	40 %	513843970
2	NC_021518	CAATA	2	10	2509	2518	60 %	20 %	0 %	20 %	513843970
3	NC_021518	AATTA	2	10	11269	11278	60 %	40 %	0 %	0 %	513843978
4	NC_021518	ACCAT	2	10	12021	12030	40 %	20 %	0 %	40 %	513843979
5	NC_021518	GAATA	2	10	12413	12422	60 %	20 %	20 %	0 %	513843979
6	NC_021518	GATTA	2	10	13365	13374	40 %	40 %	20 %	0 %	513843979
7	NC_021518	TTGCA	2	10	13713	13722	20 %	40 %	20 %	20 %	513843979
8	NC_021518	CTAAT	2	10	14880	14889	40 %	40 %	0 %	20 %	513843981
9	NC_021518	GCATT	2	10	15115	15124	20 %	40 %	20 %	20 %	513843981
10	NC_021518	CTTTT	2	10	15323	15332	0 %	80 %	0 %	20 %	513843981
11	NC_021518	GGACA	2	10	18842	18851	40 %	0 %	40 %	20 %	513843985
12	NC_021518	GCTAA	2	10	21028	21037	40 %	20 %	20 %	20 %	513843988
13	NC_021518	AAATC	2	10	21833	21842	60 %	20 %	0 %	20 %	513843990
14	NC_021518	ACTTC	2	10	26954	26963	20 %	40 %	0 %	40 %	513843998
15	NC_021518	ATCCG	2	10	30831	30840	20 %	20 %	20 %	40 %	513844001
16	NC_021518	CATGC	2	10	32853	32862	20 %	20 %	20 %	40 %	513844005
17	NC_021518	AAATC	2	10	36332	36341	60 %	20 %	0 %	20 %	513844010
18	NC_021518	TAATT	2	10	42795	42804	40 %	60 %	0 %	0 %	513844019
19	NC_021518	TTCTT	2	10	43388	43397	0 %	80 %	0 %	20 %	513844019
20	NC_021518	ATCTT	2	10	45127	45136	20 %	60 %	0 %	20 %	513844021
21	NC_021518	AAGCA	2	10	46021	46030	60 %	0 %	20 %	20 %	513844022

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.