MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	TTTC	2	8	24	31	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_021518	ACTA	2	8	390	397	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_021518	TACC	2	8	1019	1026	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021518	TTAA	2	8	2667	2674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021518	ATTT	2	8	3986	3993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021518	AACA	2	8	7028	7035	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_021518	AAGT	2	8	7585	7592	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021518	TTCG	2	8	10821	10828	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021518	TTTA	2	8	11039	11046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021518	TTGC	2	8	13940	13947	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021518	AAGC	2	8	15859	15866	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_021518	GTTC	2	8	16409	16416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021518	TAAA	2	8	19708	19715	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021518	AATA	2	8	22125	22132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021518	AAAG	2	8	23300	23307	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021518	TCCA	2	8	24669	24676	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021518	ATAA	2	8	28024	28031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021518	TTGT	2	8	28991	28998	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021518	CTTT	2	8	29336	29343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021518	TTCT	2	8	31160	31167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021518	TCTT	2	8	31239	31246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_021518	TGGA	2	8	31722	31729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021518	ATTG	2	8	33185	33192	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021518	TCAC	2	8	33417	33424	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021518	GTTA	2	8	34351	34358	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021518	ACGA	2	8	35229	35236	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_021518	AAAG	2	8	37663	37670	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021518	CTTT	2	8	38011	38018	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_021518	TATT	2	8	38285	38292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021518	ATGA	2	8	45554	45561	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021518	CCAA	2	8	45628	45635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021518	CCAA	2	8	47860	47867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021518	CCAA	2	8	48235	48242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_021518	TTTA	2	8	48256	48263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021518	TTAA	2	8	48456	48463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.