MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	AAAG	2	8	1608	1615	75 %	0 %	25 %	0 %	513843970
2	NC_021518	ACAA	2	8	1701	1708	75 %	0 %	0 %	25 %	513843970
3	NC_021518	TAAC	2	8	1861	1868	50 %	25 %	0 %	25 %	513843970
4	NC_021518	CAAA	2	8	2448	2455	75 %	0 %	0 %	25 %	513843970
5	NC_021518	TAAT	2	8	3012	3019	50 %	50 %	0 %	0 %	513843971
6	NC_021518	AAAT	2	8	3314	3321	75 %	25 %	0 %	0 %	513843971
7	NC_021518	CAAA	2	8	3898	3905	75 %	0 %	0 %	25 %	513843971
8	NC_021518	TAAG	2	8	4276	4283	50 %	25 %	25 %	0 %	513843972
9	NC_021518	GAGC	2	8	4324	4331	25 %	0 %	50 %	25 %	513843972
10	NC_021518	TCAA	2	8	4386	4393	50 %	25 %	0 %	25 %	513843972
11	NC_021518	TTGA	2	8	4534	4541	25 %	50 %	25 %	0 %	513843972
12	NC_021518	TCAA	2	8	4790	4797	50 %	25 %	0 %	25 %	513843973
13	NC_021518	TAAT	2	8	5270	5277	50 %	50 %	0 %	0 %	513843974
14	NC_021518	AAAT	2	8	5314	5321	75 %	25 %	0 %	0 %	513843974
15	NC_021518	AATT	2	8	5394	5401	50 %	50 %	0 %	0 %	513843974
16	NC_021518	GAAA	2	8	5897	5904	75 %	0 %	25 %	0 %	513843974
17	NC_021518	GAAC	2	8	9959	9966	50 %	0 %	25 %	25 %	513843976
18	NC_021518	TTGA	2	8	9969	9976	25 %	50 %	25 %	0 %	513843976
19	NC_021518	AGTC	2	8	10130	10137	25 %	25 %	25 %	25 %	513843976
20	NC_021518	AATC	2	8	11284	11291	50 %	25 %	0 %	25 %	513843978
21	NC_021518	CTTA	2	8	11913	11920	25 %	50 %	0 %	25 %	513843979
22	NC_021518	CAAT	2	8	12074	12081	50 %	25 %	0 %	25 %	513843979
23	NC_021518	TCTA	2	8	12084	12091	25 %	50 %	0 %	25 %	513843979
24	NC_021518	TGTC	2	8	12403	12410	0 %	50 %	25 %	25 %	513843979
25	NC_021518	CTTT	2	8	12559	12566	0 %	75 %	0 %	25 %	513843979
26	NC_021518	ATAA	2	8	13465	13472	75 %	25 %	0 %	0 %	513843979
27	NC_021518	GATC	2	8	13776	13783	25 %	25 %	25 %	25 %	513843979
28	NC_021518	CAAT	2	8	13829	13836	50 %	25 %	0 %	25 %	513843979
29	NC_021518	TTTC	2	8	14082	14089	0 %	75 %	0 %	25 %	513843980
30	NC_021518	TGCC	2	8	14150	14157	0 %	25 %	25 %	50 %	513843980
31	NC_021518	TTAG	2	8	14428	14435	25 %	50 %	25 %	0 %	513843980
32	NC_021518	GCCG	2	8	14521	14528	0 %	0 %	50 %	50 %	513843980
33	NC_021518	TGAT	2	8	14830	14837	25 %	50 %	25 %	0 %	513843981
34	NC_021518	ATTT	2	8	15136	15143	25 %	75 %	0 %	0 %	513843981
35	NC_021518	TTTA	2	8	16738	16745	25 %	75 %	0 %	0 %	513843983
36	NC_021518	TATT	2	8	17192	17199	25 %	75 %	0 %	0 %	513843983
37	NC_021518	AAAC	2	8	17290	17297	75 %	0 %	0 %	25 %	513843983
38	NC_021518	TGAT	2	8	17436	17443	25 %	50 %	25 %	0 %	513843983
39	NC_021518	CAAT	2	8	17802	17809	50 %	25 %	0 %	25 %	513843983
40	NC_021518	ATCA	2	8	18415	18422	50 %	25 %	0 %	25 %	513843984
41	NC_021518	AATT	2	8	19516	19523	50 %	50 %	0 %	0 %	513843985
42	NC_021518	ACAT	2	8	20066	20073	50 %	25 %	0 %	25 %	513843986
43	NC_021518	TTGC	2	8	20404	20411	0 %	50 %	25 %	25 %	513843987
44	NC_021518	GAGT	2	8	20624	20631	25 %	25 %	50 %	0 %	513843987
45	NC_021518	ACGA	2	8	21466	21473	50 %	0 %	25 %	25 %	513843988
46	NC_021518	ATCA	2	8	22048	22055	50 %	25 %	0 %	25 %	513843990
47	NC_021518	CAAA	2	8	22944	22951	75 %	0 %	0 %	25 %	513843993
48	NC_021518	AAGC	2	8	23005	23012	50 %	0 %	25 %	25 %	513843993
49	NC_021518	ATTA	2	8	23035	23042	50 %	50 %	0 %	0 %	513843993
50	NC_021518	CAAA	3	12	23324	23335	75 %	0 %	0 %	25 %	513843994
51	NC_021518	CAAG	2	8	23353	23360	50 %	0 %	25 %	25 %	513843994
52	NC_021518	CGGG	2	8	23601	23608	0 %	0 %	75 %	25 %	513843994
53	NC_021518	GACC	2	8	23858	23865	25 %	0 %	25 %	50 %	513843995
54	NC_021518	TAGT	2	8	23932	23939	25 %	50 %	25 %	0 %	513843995
55	NC_021518	CCGA	2	8	24521	24528	25 %	0 %	25 %	50 %	513843996
56	NC_021518	TCGC	2	8	24543	24550	0 %	25 %	25 %	50 %	513843996
57	NC_021518	GAAA	2	8	25296	25303	75 %	0 %	25 %	0 %	513843997
58	NC_021518	TGAA	2	8	25541	25548	50 %	25 %	25 %	0 %	513843997
59	NC_021518	CGTT	2	8	25610	25617	0 %	50 %	25 %	25 %	513843997
60	NC_021518	GATG	2	8	26193	26200	25 %	25 %	50 %	0 %	513843997
61	NC_021518	GATC	2	8	26517	26524	25 %	25 %	25 %	25 %	513843998
62	NC_021518	CAAA	2	8	27224	27231	75 %	0 %	0 %	25 %	513843998
63	NC_021518	GATC	2	8	27521	27528	25 %	25 %	25 %	25 %	513843998
64	NC_021518	CGAT	2	8	27836	27843	25 %	25 %	25 %	25 %	513843998
65	NC_021518	CGAA	2	8	28417	28424	50 %	0 %	25 %	25 %	513843999
66	NC_021518	ACTA	2	8	28704	28711	50 %	25 %	0 %	25 %	513843999
67	NC_021518	GGTC	2	8	28778	28785	0 %	25 %	50 %	25 %	513843999
68	NC_021518	TGCT	2	8	28890	28897	0 %	50 %	25 %	25 %	513843999
69	NC_021518	CCCG	2	8	29035	29042	0 %	0 %	25 %	75 %	513844000
70	NC_021518	CTTG	2	8	29283	29290	0 %	50 %	25 %	25 %	513844000
71	NC_021518	TGTT	2	8	29310	29317	0 %	75 %	25 %	0 %	513844000
72	NC_021518	TTTG	2	8	29692	29699	0 %	75 %	25 %	0 %	513844001
73	NC_021518	TAAC	2	8	30208	30215	50 %	25 %	0 %	25 %	513844001
74	NC_021518	TTTA	2	8	30425	30432	25 %	75 %	0 %	0 %	513844001
75	NC_021518	TAAT	2	8	30517	30524	50 %	50 %	0 %	0 %	513844001
76	NC_021518	CAAC	2	8	30925	30932	50 %	0 %	0 %	50 %	513844001
77	NC_021518	TTGC	2	8	30974	30981	0 %	50 %	25 %	25 %	513844001
78	NC_021518	GTTA	2	8	31049	31056	25 %	50 %	25 %	0 %	513844001
79	NC_021518	TGCG	2	8	31067	31074	0 %	25 %	50 %	25 %	513844001
80	NC_021518	AATT	2	8	32401	32408	50 %	50 %	0 %	0 %	513844004
81	NC_021518	ATTG	2	8	34310	34317	25 %	50 %	25 %	0 %	513844006
82	NC_021518	CAAC	2	8	34863	34870	50 %	0 %	0 %	50 %	513844007
83	NC_021518	ACGA	2	8	35965	35972	50 %	0 %	25 %	25 %	513844008
84	NC_021518	GGAC	2	8	37166	37173	25 %	0 %	50 %	25 %	513844012
85	NC_021518	GGTG	2	8	38559	38566	0 %	25 %	75 %	0 %	513844014
86	NC_021518	ATAC	2	8	39138	39145	50 %	25 %	0 %	25 %	513844015
87	NC_021518	GTTG	2	8	39146	39153	0 %	50 %	50 %	0 %	513844015
88	NC_021518	TTAT	2	8	39834	39841	25 %	75 %	0 %	0 %	513844015
89	NC_021518	TTAG	2	8	40524	40531	25 %	50 %	25 %	0 %	513844017
90	NC_021518	CGAT	2	8	40596	40603	25 %	25 %	25 %	25 %	513844017
91	NC_021518	GATT	2	8	40725	40732	25 %	50 %	25 %	0 %	513844017
92	NC_021518	TTCG	2	8	41104	41111	0 %	50 %	25 %	25 %	513844017
93	NC_021518	GCCA	2	8	43097	43104	25 %	0 %	25 %	50 %	513844019
94	NC_021518	ACTA	2	8	43332	43339	50 %	25 %	0 %	25 %	513844019
95	NC_021518	AAAC	2	8	43833	43840	75 %	0 %	0 %	25 %	513844020
96	NC_021518	ATTG	2	8	44385	44392	25 %	50 %	25 %	0 %	513844021
97	NC_021518	TTTC	2	8	44843	44850	0 %	75 %	0 %	25 %	513844021
98	NC_021518	TATC	2	8	45933	45940	25 %	50 %	0 %	25 %	513844022
99	NC_021518	CGCT	2	8	46156	46163	0 %	25 %	25 %	50 %	513844022
100	NC_021518	ATAA	2	8	46514	46521	75 %	25 %	0 %	0 %	513844022
101	NC_021518	AATT	2	8	49249	49256	50 %	50 %	0 %	0 %	513844024
102	NC_021518	TTTG	2	8	49381	49388	0 %	75 %	25 %	0 %	513844024
103	NC_021518	TGAT	2	8	49539	49546	25 %	50 %	25 %	0 %	513844024

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.