MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 498

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	GAT	2	6	124	129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843968
2	NC_021518	AAT	2	6	601	606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843969
3	NC_021518	CAC	2	6	707	712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843969
4	NC_021518	GCC	2	6	723	728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843969
5	NC_021518	TAA	2	6	1085	1090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843970
6	NC_021518	GTT	2	6	1102	1107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843970
7	NC_021518	CTT	2	6	1189	1194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843970
8	NC_021518	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843970
9	NC_021518	TAA	2	6	1379	1384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843970
10	NC_021518	CAA	3	9	1387	1395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843970
11	NC_021518	ATA	2	6	1552	1557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843970
12	NC_021518	TAA	2	6	1681	1686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843970
13	NC_021518	CAA	2	6	1732	1737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843970
14	NC_021518	ACC	3	9	1748	1756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843970
15	NC_021518	CAG	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843970
16	NC_021518	TGA	2	6	1842	1847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843970
17	NC_021518	ACC	2	6	1849	1854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843970
18	NC_021518	AAT	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843970
19	NC_021518	AAT	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843970
20	NC_021518	TCT	2	6	2073	2078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843970
21	NC_021518	GCT	3	9	2115	2123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843970
22	NC_021518	CAG	2	6	2128	2133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843970
23	NC_021518	TAG	2	6	2150	2155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843970
24	NC_021518	AAT	2	6	2247	2252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843970
25	NC_021518	ACC	2	6	2273	2278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843970
26	NC_021518	ACC	2	6	2302	2307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843970
27	NC_021518	CAA	2	6	2429	2434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843970
28	NC_021518	AAC	2	6	2531	2536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843970
29	NC_021518	TAG	2	6	2747	2752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843971
30	NC_021518	AGT	2	6	2777	2782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843971
31	NC_021518	TAA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843971
32	NC_021518	GTT	2	6	2798	2803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843971
33	NC_021518	ATC	2	6	2836	2841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843971
34	NC_021518	GAA	2	6	3070	3075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843971
35	NC_021518	ATC	2	6	3230	3235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843971
36	NC_021518	TAG	2	6	3243	3248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843971
37	NC_021518	AAT	2	6	3263	3268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843971
38	NC_021518	GAG	2	6	3286	3291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	513843971
39	NC_021518	GCT	2	6	3339	3344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843971
40	NC_021518	ACC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843971
41	NC_021518	AAC	2	6	3632	3637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843971
42	NC_021518	GAT	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843971
43	NC_021518	CAA	2	6	3769	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843971
44	NC_021518	AAT	2	6	3787	3792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843971
45	NC_021518	CAA	2	6	3795	3800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843971
46	NC_021518	CTG	2	6	3816	3821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843971
47	NC_021518	GAT	2	6	3871	3876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843971
48	NC_021518	ACT	2	6	4270	4275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843972
49	NC_021518	TTC	2	6	4362	4367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843972
50	NC_021518	GAA	2	6	4376	4381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843972
51	NC_021518	ATA	2	6	4527	4532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843972
52	NC_021518	ACC	2	6	4595	4600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843972
53	NC_021518	TGC	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843974
54	NC_021518	TCA	2	6	5257	5262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843974
55	NC_021518	ACC	2	6	5308	5313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843974
56	NC_021518	ACC	2	6	5346	5351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843974
57	NC_021518	AAT	2	6	5434	5439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843974
58	NC_021518	CTT	2	6	5459	5464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843974
59	NC_021518	ATA	2	6	5486	5491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843974
60	NC_021518	TAC	2	6	5556	5561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843974
61	NC_021518	AAT	2	6	5568	5573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843974
62	NC_021518	GAA	2	6	5590	5595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843974
63	NC_021518	AAT	2	6	5625	5630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843974
64	NC_021518	ACC	2	6	5637	5642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843974
65	NC_021518	AGT	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843974
66	NC_021518	ATA	2	6	5687	5692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843974
67	NC_021518	TGA	2	6	5706	5711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843974
68	NC_021518	AAT	2	6	5713	5718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843974
69	NC_021518	GCT	2	6	5753	5758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843974
70	NC_021518	ATT	2	6	5767	5772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843974
71	NC_021518	CAT	2	6	5814	5819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843974
72	NC_021518	AAT	2	6	5910	5915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843974
73	NC_021518	CCG	2	6	5935	5940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843974
74	NC_021518	GTC	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843975
75	NC_021518	GCC	2	6	6328	6333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843975
76	NC_021518	TTC	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843975
77	NC_021518	TTG	2	6	6399	6404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843975
78	NC_021518	CTT	2	6	6409	6414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843975
79	NC_021518	TAA	2	6	6452	6457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843975
80	NC_021518	TTG	2	6	6527	6532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843975
81	NC_021518	GAC	2	6	6747	6752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843975
82	NC_021518	ACA	2	6	7825	7830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843976
83	NC_021518	AGC	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843976
84	NC_021518	TCA	3	9	7858	7866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843976
85	NC_021518	GCC	2	6	7929	7934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843976
86	NC_021518	TAT	2	6	8047	8052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843976
87	NC_021518	GCC	2	6	8562	8567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843976
88	NC_021518	TAT	2	6	8580	8585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843976
89	NC_021518	GTA	2	6	8590	8595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843976
90	NC_021518	TAA	2	6	8630	8635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843976
91	NC_021518	TTA	2	6	8708	8713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843976
92	NC_021518	TAG	2	6	8768	8773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843976
93	NC_021518	TAT	2	6	8922	8927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843976
94	NC_021518	ATG	2	6	8935	8940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843976
95	NC_021518	TAA	2	6	8972	8977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843976
96	NC_021518	ATA	2	6	9100	9105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843976
97	NC_021518	AAT	2	6	9225	9230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843976
98	NC_021518	TAT	2	6	9402	9407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843976
99	NC_021518	AAG	2	6	9409	9414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843976
100	NC_021518	TAA	2	6	9416	9421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843976
101	NC_021518	GGT	2	6	9435	9440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843976
102	NC_021518	TAA	2	6	9476	9481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843976
103	NC_021518	TTA	2	6	9551	9556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843976
104	NC_021518	CAA	2	6	9645	9650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843976
105	NC_021518	TCA	2	6	9738	9743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843976
106	NC_021518	ATC	2	6	9811	9816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843976
107	NC_021518	CTT	2	6	9886	9891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843976
108	NC_021518	ATA	2	6	9922	9927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843976
109	NC_021518	CAA	2	6	9950	9955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843976
110	NC_021518	AGC	2	6	9986	9991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843976
111	NC_021518	GTT	2	6	10017	10022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843976
112	NC_021518	AAT	2	6	10041	10046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843976
113	NC_021518	CTT	2	6	10055	10060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843976
114	NC_021518	GTT	2	6	10158	10163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843976
115	NC_021518	ACT	2	6	10192	10197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843976
116	NC_021518	CGT	3	9	10569	10577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843977
117	NC_021518	TAC	2	6	10655	10660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843977
118	NC_021518	GTT	2	6	11097	11102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843978
119	NC_021518	TCG	2	6	11239	11244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843978
120	NC_021518	TGT	2	6	11366	11371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843978
121	NC_021518	GTT	2	6	11471	11476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843978
122	NC_021518	TGA	2	6	11504	11509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843978
123	NC_021518	GAT	2	6	11930	11935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843979
124	NC_021518	TAA	2	6	11975	11980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843979
125	NC_021518	TCT	2	6	11995	12000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843979
126	NC_021518	CTG	2	6	12122	12127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843979
127	NC_021518	GTT	2	6	12128	12133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843979
128	NC_021518	TAA	2	6	12140	12145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843979
129	NC_021518	GAT	2	6	12227	12232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843979
130	NC_021518	AAC	2	6	12300	12305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843979
131	NC_021518	TAC	2	6	12428	12433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843979
132	NC_021518	AAG	2	6	12540	12545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843979
133	NC_021518	ATA	2	6	12610	12615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843979
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136	NC_021518	TAA	2	6	12932	12937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843979
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139	NC_021518	ATC	2	6	13411	13416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843979
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247	NC_021518	TGA	2	6	23469	23474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843994
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250	NC_021518	CCT	2	6	23580	23585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513843994
251	NC_021518	GTT	2	6	23623	23628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843994
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254	NC_021518	AGT	2	6	23877	23882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843995
255	NC_021518	TCA	2	6	23894	23899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843995
256	NC_021518	TCA	2	6	23951	23956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843995
257	NC_021518	CGC	2	6	24066	24071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843995
258	NC_021518	GCT	2	6	24242	24247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843996
259	NC_021518	AGA	2	6	24253	24258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843996
260	NC_021518	AAG	2	6	24471	24476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843996
261	NC_021518	GAA	2	6	24530	24535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843996
262	NC_021518	TGA	2	6	24537	24542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843996
263	NC_021518	CAA	2	6	24750	24755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843997
264	NC_021518	ATG	2	6	24758	24763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
265	NC_021518	AGC	2	6	24767	24772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843997
266	NC_021518	TGA	2	6	25049	25054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
267	NC_021518	AAT	2	6	25135	25140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843997
268	NC_021518	ATC	2	6	25180	25185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843997
269	NC_021518	AGA	2	6	25419	25424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843997
270	NC_021518	AAT	2	6	25426	25431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843997
271	NC_021518	TTC	2	6	25486	25491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843997
272	NC_021518	GAA	2	6	25566	25571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843997
273	NC_021518	TGA	2	6	25580	25585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
274	NC_021518	TGA	2	6	25593	25598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
275	NC_021518	TTG	2	6	25805	25810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843997
276	NC_021518	GCA	2	6	25902	25907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843997
277	NC_021518	ACG	2	6	26003	26008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843997
278	NC_021518	ACA	2	6	26039	26044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843997
279	NC_021518	ATT	2	6	26063	26068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843997
280	NC_021518	ATC	2	6	26071	26076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843997
281	NC_021518	CTT	2	6	26154	26159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843997
282	NC_021518	GAA	2	6	26175	26180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843997
283	NC_021518	GCA	2	6	26215	26220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843997
284	NC_021518	TGA	2	6	26301	26306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843997
285	NC_021518	TGA	2	6	26348	26353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843998
286	NC_021518	ATT	2	6	26366	26371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843998
287	NC_021518	CTG	2	6	26422	26427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843998
288	NC_021518	TTA	2	6	26489	26494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843998
289	NC_021518	TTC	2	6	26542	26547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843998
290	NC_021518	TCT	2	6	26639	26644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843998
291	NC_021518	ATC	2	6	26719	26724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843998
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293	NC_021518	TCG	2	6	26767	26772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843998
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312	NC_021518	GCA	2	6	27911	27916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843998
313	NC_021518	AGT	2	6	28523	28528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843999
314	NC_021518	TGA	2	6	28687	28692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843999
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322	NC_021518	CTT	2	6	29147	29152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844000
323	NC_021518	TCA	2	6	29169	29174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844000
324	NC_021518	TTC	2	6	29210	29215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844000
325	NC_021518	TTC	2	6	29222	29227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844000
326	NC_021518	TGC	2	6	29502	29507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844001
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330	NC_021518	GAT	2	6	29779	29784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844001
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337	NC_021518	CGT	2	6	30354	30359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844001
338	NC_021518	CCA	2	6	30418	30423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844001
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344	NC_021518	GCC	2	6	30889	30894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513844001
345	NC_021518	CCA	2	6	31111	31116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844001
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349	NC_021518	ATC	2	6	31837	31842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844002
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352	NC_021518	TAA	2	6	32140	32145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844003
353	NC_021518	GAA	2	6	32165	32170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513844003
354	NC_021518	TAA	2	6	32236	32241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844003
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357	NC_021518	TGA	2	6	32891	32896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844005
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362	NC_021518	AAT	2	6	34155	34160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844006
363	NC_021518	GTC	2	6	34163	34168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513844006
364	NC_021518	TCA	2	6	34200	34205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844006
365	NC_021518	AAT	2	6	34223	34228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844006
366	NC_021518	TTC	2	6	34268	34273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513844006
367	NC_021518	CAT	2	6	34803	34808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844007
368	NC_021518	GAT	2	6	34850	34855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513844007
369	NC_021518	ACG	2	6	34935	34940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844007
370	NC_021518	CAT	2	6	35009	35014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844007
371	NC_021518	TCA	2	6	35538	35543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844008
372	NC_021518	AAT	2	6	35673	35678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844008
373	NC_021518	GTT	2	6	35718	35723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513844008
374	NC_021518	ACC	2	6	35733	35738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844008
375	NC_021518	ACC	2	6	35901	35906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513844008
376	NC_021518	ACT	2	6	35916	35921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844008
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378	NC_021518	CAG	2	6	36049	36054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513844009
379	NC_021518	TAA	2	6	36084	36089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513844009
380	NC_021518	CTA	2	6	36267	36272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513844009
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