MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	TA	3	6	968	973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021518	TC	3	6	2376	2381	0 %	50 %	0 %	50 %	513843970
3	NC_021518	TA	3	6	2476	2481	50 %	50 %	0 %	0 %	513843970
4	NC_021518	TA	3	6	2652	2657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021518	AT	3	6	3206	3211	50 %	50 %	0 %	0 %	513843971
6	NC_021518	TA	3	6	6292	6297	50 %	50 %	0 %	0 %	513843975
7	NC_021518	AT	3	6	6774	6779	50 %	50 %	0 %	0 %	513843975
8	NC_021518	TA	3	6	6970	6975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021518	CA	3	6	7551	7556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021518	AT	3	6	8336	8341	50 %	50 %	0 %	0 %	513843976
11	NC_021518	CA	3	6	10368	10373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_021518	AG	3	6	12519	12524	50 %	0 %	50 %	0 %	513843979
13	NC_021518	TA	3	6	13175	13180	50 %	50 %	0 %	0 %	513843979
14	NC_021518	AT	3	6	16450	16455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021518	AT	3	6	16669	16674	50 %	50 %	0 %	0 %	513843983
16	NC_021518	AT	3	6	16964	16969	50 %	50 %	0 %	0 %	513843983
17	NC_021518	AT	4	8	17582	17589	50 %	50 %	0 %	0 %	513843983
18	NC_021518	AT	3	6	18004	18009	50 %	50 %	0 %	0 %	513843984
19	NC_021518	GA	3	6	18123	18128	50 %	0 %	50 %	0 %	513843984
20	NC_021518	AC	3	6	18379	18384	50 %	0 %	0 %	50 %	513843984
21	NC_021518	AT	4	8	19266	19273	50 %	50 %	0 %	0 %	513843985
22	NC_021518	TA	3	6	19301	19306	50 %	50 %	0 %	0 %	513843985
23	NC_021518	GA	3	6	19314	19319	50 %	0 %	50 %	0 %	513843985
24	NC_021518	TA	3	6	19368	19373	50 %	50 %	0 %	0 %	513843985
25	NC_021518	GA	3	6	21757	21762	50 %	0 %	50 %	0 %	513843989
26	NC_021518	AT	3	6	24310	24315	50 %	50 %	0 %	0 %	513843996
27	NC_021518	TC	3	6	28390	28395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021518	TG	3	6	30617	30622	0 %	50 %	50 %	0 %	513844001
29	NC_021518	GA	3	6	36256	36261	50 %	0 %	50 %	0 %	513844009
30	NC_021518	CT	3	6	37887	37892	0 %	50 %	0 %	50 %	513844013
31	NC_021518	TG	3	6	38534	38539	0 %	50 %	50 %	0 %	513844014
32	NC_021518	TA	3	6	38900	38905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021518	TA	3	6	38916	38921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021518	AT	3	6	39320	39325	50 %	50 %	0 %	0 %	513844015
35	NC_021518	AC	3	6	39519	39524	50 %	0 %	0 %	50 %	513844015
36	NC_021518	AT	3	6	42532	42537	50 %	50 %	0 %	0 %	513844019
37	NC_021518	TG	3	6	43442	43447	0 %	50 %	50 %	0 %	513844020
38	NC_021518	GC	4	8	44917	44924	0 %	0 %	50 %	50 %	513844021
39	NC_021518	GT	3	6	46183	46188	0 %	50 %	50 %	0 %	513844022
40	NC_021518	AT	3	6	46865	46870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021518	GT	3	6	46940	46945	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021518	AT	3	6	47185	47190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021518	AC	3	6	47203	47208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_021518	GT	3	6	48049	48054	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.