MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	A	6	6	717	722	100 %	0 %	0 %	0 %	513843969
2	NC_021518	T	7	7	1068	1074	0 %	100 %	0 %	0 %	513843970
3	NC_021518	A	6	6	1519	1524	100 %	0 %	0 %	0 %	513843970
4	NC_021518	A	6	6	3163	3168	100 %	0 %	0 %	0 %	513843971
5	NC_021518	A	6	6	3347	3352	100 %	0 %	0 %	0 %	513843971
6	NC_021518	T	6	6	3664	3669	0 %	100 %	0 %	0 %	513843971
7	NC_021518	A	6	6	3732	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	513843971
8	NC_021518	A	6	6	3919	3924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021518	T	8	8	4713	4720	0 %	100 %	0 %	0 %	513843973
10	NC_021518	T	6	6	5125	5130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021518	T	6	6	5408	5413	0 %	100 %	0 %	0 %	513843974
12	NC_021518	A	6	6	6048	6053	100 %	0 %	0 %	0 %	513843974
13	NC_021518	A	6	6	6116	6121	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021518	T	6	6	6631	6636	0 %	100 %	0 %	0 %	513843975
15	NC_021518	T	6	6	6705	6710	0 %	100 %	0 %	0 %	513843975
16	NC_021518	A	6	6	7686	7691	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021518	A	7	7	8039	8045	100 %	0 %	0 %	0 %	513843976
18	NC_021518	T	7	7	10241	10247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021518	A	6	6	10408	10413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021518	T	6	6	10880	10885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021518	A	6	6	11072	11077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021518	A	6	6	12708	12713	100 %	0 %	0 %	0 %	513843979
23	NC_021518	T	8	8	12827	12834	0 %	100 %	0 %	0 %	513843979
24	NC_021518	T	6	6	12910	12915	0 %	100 %	0 %	0 %	513843979
25	NC_021518	T	7	7	13548	13554	0 %	100 %	0 %	0 %	513843979
26	NC_021518	T	6	6	13657	13662	0 %	100 %	0 %	0 %	513843979
27	NC_021518	A	6	6	13763	13768	100 %	0 %	0 %	0 %	513843979
28	NC_021518	A	6	6	14711	14716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021518	T	6	6	14751	14756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021518	T	6	6	14768	14773	0 %	100 %	0 %	0 %	513843981
31	NC_021518	T	7	7	14861	14867	0 %	100 %	0 %	0 %	513843981
32	NC_021518	A	6	6	14987	14992	100 %	0 %	0 %	0 %	513843981
33	NC_021518	T	7	7	15329	15335	0 %	100 %	0 %	0 %	513843981
34	NC_021518	A	7	7	15429	15435	100 %	0 %	0 %	0 %	513843981
35	NC_021518	T	6	6	15799	15804	0 %	100 %	0 %	0 %	513843981
36	NC_021518	A	6	6	15809	15814	100 %	0 %	0 %	0 %	513843981
37	NC_021518	A	8	8	16210	16217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021518	A	6	6	16898	16903	100 %	0 %	0 %	0 %	513843983
39	NC_021518	T	7	7	17127	17133	0 %	100 %	0 %	0 %	513843983
40	NC_021518	T	7	7	17215	17221	0 %	100 %	0 %	0 %	513843983
41	NC_021518	T	7	7	17320	17326	0 %	100 %	0 %	0 %	513843983
42	NC_021518	T	6	6	17822	17827	0 %	100 %	0 %	0 %	513843983
43	NC_021518	A	6	6	18022	18027	100 %	0 %	0 %	0 %	513843984
44	NC_021518	A	6	6	18633	18638	100 %	0 %	0 %	0 %	513843985
45	NC_021518	T	6	6	19048	19053	0 %	100 %	0 %	0 %	513843985
46	NC_021518	A	7	7	19342	19348	100 %	0 %	0 %	0 %	513843985
47	NC_021518	A	6	6	19653	19658	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021518	A	6	6	19713	19718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021518	A	6	6	20091	20096	100 %	0 %	0 %	0 %	513843986
50	NC_021518	T	6	6	20144	20149	0 %	100 %	0 %	0 %	513843986
51	NC_021518	T	6	6	20373	20378	0 %	100 %	0 %	0 %	513843987
52	NC_021518	T	6	6	20466	20471	0 %	100 %	0 %	0 %	513843987
53	NC_021518	T	7	7	21518	21524	0 %	100 %	0 %	0 %	513843989
54	NC_021518	A	7	7	23502	23508	100 %	0 %	0 %	0 %	513843994
55	NC_021518	A	8	8	23915	23922	100 %	0 %	0 %	0 %	513843995
56	NC_021518	T	7	7	23984	23990	0 %	100 %	0 %	0 %	513843995
57	NC_021518	A	6	6	24566	24571	100 %	0 %	0 %	0 %	513843996
58	NC_021518	T	8	8	24631	24638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021518	A	7	7	24824	24830	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
60	NC_021518	A	6	6	24834	24839	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
61	NC_021518	A	6	6	24886	24891	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
62	NC_021518	A	6	6	25532	25537	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
63	NC_021518	A	6	6	25552	25557	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
64	NC_021518	A	6	6	26932	26937	100 %	0 %	0 %	0 %	513843998
65	NC_021518	A	6	6	27352	27357	100 %	0 %	0 %	0 %	513843998
66	NC_021518	T	6	6	28193	28198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021518	T	6	6	28257	28262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021518	A	7	7	28653	28659	100 %	0 %	0 %	0 %	513843999
69	NC_021518	T	8	8	28721	28728	0 %	100 %	0 %	0 %	513843999
70	NC_021518	T	7	7	29135	29141	0 %	100 %	0 %	0 %	513844000
71	NC_021518	C	6	6	29417	29422	0 %	0 %	0 %	100 %	513844001
72	NC_021518	T	7	7	30846	30852	0 %	100 %	0 %	0 %	513844001
73	NC_021518	T	6	6	30904	30909	0 %	100 %	0 %	0 %	513844001
74	NC_021518	T	6	6	31296	31301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021518	A	6	6	31787	31792	100 %	0 %	0 %	0 %	513844002
76	NC_021518	A	7	7	31802	31808	100 %	0 %	0 %	0 %	513844002
77	NC_021518	A	6	6	32016	32021	100 %	0 %	0 %	0 %	513844003
78	NC_021518	A	6	6	32221	32226	100 %	0 %	0 %	0 %	513844003
79	NC_021518	T	6	6	32272	32277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021518	A	7	7	32610	32616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021518	A	6	6	33207	33212	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021518	T	6	6	33294	33299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021518	A	6	6	33391	33396	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021518	T	6	6	34469	34474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021518	T	7	7	35281	35287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021518	T	7	7	36017	36023	0 %	100 %	0 %	0 %	513844009
87	NC_021518	T	6	6	36453	36458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021518	T	7	7	36952	36958	0 %	100 %	0 %	0 %	513844012
89	NC_021518	T	6	6	37227	37232	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021518	A	6	6	37523	37528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021518	T	6	6	37554	37559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021518	T	6	6	37639	37644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021518	T	7	7	38016	38022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021518	A	6	6	38254	38259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021518	T	9	9	38567	38575	0 %	100 %	0 %	0 %	513844014
96	NC_021518	T	6	6	38582	38587	0 %	100 %	0 %	0 %	513844014
97	NC_021518	A	7	7	39234	39240	100 %	0 %	0 %	0 %	513844015
98	NC_021518	A	6	6	39955	39960	100 %	0 %	0 %	0 %	513844016
99	NC_021518	A	6	6	39984	39989	100 %	0 %	0 %	0 %	513844016
100	NC_021518	A	6	6	39994	39999	100 %	0 %	0 %	0 %	513844016
101	NC_021518	T	6	6	40906	40911	0 %	100 %	0 %	0 %	513844017
102	NC_021518	T	6	6	41189	41194	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021518	A	6	6	42234	42239	100 %	0 %	0 %	0 %	513844018
104	NC_021518	A	6	6	42371	42376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021518	A	7	7	42442	42448	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021518	T	6	6	42499	42504	0 %	100 %	0 %	0 %	513844019
107	NC_021518	T	7	7	42803	42809	0 %	100 %	0 %	0 %	513844019
108	NC_021518	A	6	6	43807	43812	100 %	0 %	0 %	0 %	513844020
109	NC_021518	A	6	6	44179	44184	100 %	0 %	0 %	0 %	513844020
110	NC_021518	T	6	6	44810	44815	0 %	100 %	0 %	0 %	513844021
111	NC_021518	T	7	7	45381	45387	0 %	100 %	0 %	0 %	513844021
112	NC_021518	T	6	6	45580	45585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021518	T	7	7	45720	45726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021518	T	7	7	45758	45764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021518	A	7	7	45802	45808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021518	T	6	6	46826	46831	0 %	100 %	0 %	0 %	513844022
117	NC_021518	T	6	6	48015	48020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021518	C	6	6	48055	48060	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
119	NC_021518	C	7	7	48210	48216	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
120	NC_021518	A	6	6	48912	48917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021518	T	6	6	49399	49404	0 %	100 %	0 %	0 %	513844024

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.