MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16F

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021518	A	6	6	717	722	100 %	0 %	0 %	0 %	513843969
2	NC_021518	T	7	7	1068	1074	0 %	100 %	0 %	0 %	513843970
3	NC_021518	A	6	6	1519	1524	100 %	0 %	0 %	0 %	513843970
4	NC_021518	A	6	6	3163	3168	100 %	0 %	0 %	0 %	513843971
5	NC_021518	A	6	6	3347	3352	100 %	0 %	0 %	0 %	513843971
6	NC_021518	T	6	6	3664	3669	0 %	100 %	0 %	0 %	513843971
7	NC_021518	A	6	6	3732	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	513843971
8	NC_021518	T	8	8	4713	4720	0 %	100 %	0 %	0 %	513843973
9	NC_021518	T	6	6	5408	5413	0 %	100 %	0 %	0 %	513843974
10	NC_021518	A	6	6	6048	6053	100 %	0 %	0 %	0 %	513843974
11	NC_021518	T	6	6	6631	6636	0 %	100 %	0 %	0 %	513843975
12	NC_021518	T	6	6	6705	6710	0 %	100 %	0 %	0 %	513843975
13	NC_021518	A	7	7	8039	8045	100 %	0 %	0 %	0 %	513843976
14	NC_021518	A	6	6	12708	12713	100 %	0 %	0 %	0 %	513843979
15	NC_021518	T	8	8	12827	12834	0 %	100 %	0 %	0 %	513843979
16	NC_021518	T	6	6	12910	12915	0 %	100 %	0 %	0 %	513843979
17	NC_021518	T	7	7	13548	13554	0 %	100 %	0 %	0 %	513843979
18	NC_021518	T	6	6	13657	13662	0 %	100 %	0 %	0 %	513843979
19	NC_021518	A	6	6	13763	13768	100 %	0 %	0 %	0 %	513843979
20	NC_021518	T	6	6	14768	14773	0 %	100 %	0 %	0 %	513843981
21	NC_021518	T	7	7	14861	14867	0 %	100 %	0 %	0 %	513843981
22	NC_021518	A	6	6	14987	14992	100 %	0 %	0 %	0 %	513843981
23	NC_021518	T	7	7	15329	15335	0 %	100 %	0 %	0 %	513843981
24	NC_021518	A	7	7	15429	15435	100 %	0 %	0 %	0 %	513843981
25	NC_021518	T	6	6	15799	15804	0 %	100 %	0 %	0 %	513843981
26	NC_021518	A	6	6	15809	15814	100 %	0 %	0 %	0 %	513843981
27	NC_021518	A	6	6	16898	16903	100 %	0 %	0 %	0 %	513843983
28	NC_021518	T	7	7	17127	17133	0 %	100 %	0 %	0 %	513843983
29	NC_021518	T	7	7	17215	17221	0 %	100 %	0 %	0 %	513843983
30	NC_021518	T	7	7	17320	17326	0 %	100 %	0 %	0 %	513843983
31	NC_021518	T	6	6	17822	17827	0 %	100 %	0 %	0 %	513843983
32	NC_021518	A	6	6	18022	18027	100 %	0 %	0 %	0 %	513843984
33	NC_021518	A	6	6	18633	18638	100 %	0 %	0 %	0 %	513843985
34	NC_021518	T	6	6	19048	19053	0 %	100 %	0 %	0 %	513843985
35	NC_021518	A	7	7	19342	19348	100 %	0 %	0 %	0 %	513843985
36	NC_021518	A	6	6	20091	20096	100 %	0 %	0 %	0 %	513843986
37	NC_021518	T	6	6	20144	20149	0 %	100 %	0 %	0 %	513843986
38	NC_021518	T	6	6	20373	20378	0 %	100 %	0 %	0 %	513843987
39	NC_021518	T	6	6	20466	20471	0 %	100 %	0 %	0 %	513843987
40	NC_021518	T	7	7	21518	21524	0 %	100 %	0 %	0 %	513843989
41	NC_021518	A	7	7	23502	23508	100 %	0 %	0 %	0 %	513843994
42	NC_021518	A	8	8	23915	23922	100 %	0 %	0 %	0 %	513843995
43	NC_021518	T	7	7	23984	23990	0 %	100 %	0 %	0 %	513843995
44	NC_021518	A	6	6	24566	24571	100 %	0 %	0 %	0 %	513843996
45	NC_021518	A	7	7	24824	24830	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
46	NC_021518	A	6	6	24834	24839	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
47	NC_021518	A	6	6	24886	24891	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
48	NC_021518	A	6	6	25532	25537	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
49	NC_021518	A	6	6	25552	25557	100 %	0 %	0 %	0 %	513843997
50	NC_021518	A	6	6	26932	26937	100 %	0 %	0 %	0 %	513843998
51	NC_021518	A	6	6	27352	27357	100 %	0 %	0 %	0 %	513843998
52	NC_021518	A	7	7	28653	28659	100 %	0 %	0 %	0 %	513843999
53	NC_021518	T	8	8	28721	28728	0 %	100 %	0 %	0 %	513843999
54	NC_021518	T	7	7	29135	29141	0 %	100 %	0 %	0 %	513844000
55	NC_021518	C	6	6	29417	29422	0 %	0 %	0 %	100 %	513844001
56	NC_021518	T	7	7	30846	30852	0 %	100 %	0 %	0 %	513844001
57	NC_021518	T	6	6	30904	30909	0 %	100 %	0 %	0 %	513844001
58	NC_021518	A	6	6	31787	31792	100 %	0 %	0 %	0 %	513844002
59	NC_021518	A	7	7	31802	31808	100 %	0 %	0 %	0 %	513844002
60	NC_021518	A	6	6	32016	32021	100 %	0 %	0 %	0 %	513844003
61	NC_021518	A	6	6	32221	32226	100 %	0 %	0 %	0 %	513844003
62	NC_021518	T	7	7	36017	36023	0 %	100 %	0 %	0 %	513844009
63	NC_021518	T	7	7	36952	36958	0 %	100 %	0 %	0 %	513844012
64	NC_021518	T	9	9	38567	38575	0 %	100 %	0 %	0 %	513844014
65	NC_021518	T	6	6	38582	38587	0 %	100 %	0 %	0 %	513844014
66	NC_021518	A	7	7	39234	39240	100 %	0 %	0 %	0 %	513844015
67	NC_021518	A	6	6	39955	39960	100 %	0 %	0 %	0 %	513844016
68	NC_021518	A	6	6	39984	39989	100 %	0 %	0 %	0 %	513844016
69	NC_021518	A	6	6	39994	39999	100 %	0 %	0 %	0 %	513844016
70	NC_021518	T	6	6	40906	40911	0 %	100 %	0 %	0 %	513844017
71	NC_021518	A	6	6	42234	42239	100 %	0 %	0 %	0 %	513844018
72	NC_021518	T	6	6	42499	42504	0 %	100 %	0 %	0 %	513844019
73	NC_021518	T	7	7	42803	42809	0 %	100 %	0 %	0 %	513844019
74	NC_021518	A	6	6	43807	43812	100 %	0 %	0 %	0 %	513844020
75	NC_021518	A	6	6	44179	44184	100 %	0 %	0 %	0 %	513844020
76	NC_021518	T	6	6	44810	44815	0 %	100 %	0 %	0 %	513844021
77	NC_021518	T	7	7	45381	45387	0 %	100 %	0 %	0 %	513844021
78	NC_021518	T	6	6	46826	46831	0 %	100 %	0 %	0 %	513844022
79	NC_021518	T	6	6	49399	49404	0 %	100 %	0 %	0 %	513844024

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.