MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 14

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	AACTGA	2	12	459	470	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	513843591
2	NC_021517	ATGTAT	2	12	2551	2562	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021517	TCAGGG	2	12	11603	11614	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	513843606
4	NC_021517	CCTGAC	2	12	13829	13840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	513843606
5	NC_021517	CAATGC	2	12	14333	14344	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	513843606
6	NC_021517	GGATGC	2	12	14948	14959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	513843606
7	NC_021517	AACTGA	2	12	18567	18578	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	513843610
8	NC_021517	TAATTG	2	12	21247	21258	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	513843613
9	NC_021517	GAAGCC	2	12	24501	24512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843617
10	NC_021517	CGATAA	2	12	24732	24743	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_021517	TGGCGC	2	12	25956	25967	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	513843620
12	NC_021517	TTTAAT	2	12	27892	27903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843621
13	NC_021517	TGACCA	2	12	28718	28729	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	513843622
14	NC_021517	AACGAA	2	12	38770	38781	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.