MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	CATTT	2	10	806	815	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_021517	AACTA	2	10	1166	1175	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021517	GATAA	2	10	1523	1532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021517	ACACA	2	10	3225	3234	60 %	0 %	0 %	40 %	513843593
5	NC_021517	AACAG	2	10	3563	3572	60 %	0 %	20 %	20 %	513843594
6	NC_021517	TTGTA	2	10	4574	4583	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021517	AGCTG	2	10	5878	5887	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021517	CAAAG	2	10	7547	7556	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021517	TAGCT	2	10	9735	9744	20 %	40 %	20 %	20 %	513843603
10	NC_021517	TGATG	2	10	10784	10793	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021517	ACGTC	2	10	12376	12385	20 %	20 %	20 %	40 %	513843606
12	NC_021517	CACCG	2	10	13505	13514	20 %	0 %	20 %	60 %	513843606
13	NC_021517	GGTCC	2	10	16594	16603	0 %	20 %	40 %	40 %	513843608
14	NC_021517	TGATA	2	10	17390	17399	40 %	40 %	20 %	0 %	513843609
15	NC_021517	AACTT	2	10	17925	17934	40 %	40 %	0 %	20 %	513843610
16	NC_021517	CATTT	2	10	18914	18923	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021517	ACCAA	2	10	19392	19401	60 %	0 %	0 %	40 %	513843611
18	NC_021517	TAAAT	2	10	19659	19668	60 %	40 %	0 %	0 %	513843611
19	NC_021517	GCAGT	2	10	19860	19869	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_021517	CAGCA	2	10	20291	20300	40 %	0 %	20 %	40 %	513843612
21	NC_021517	AAACT	2	10	20425	20434	60 %	20 %	0 %	20 %	513843612
22	NC_021517	TATTT	2	10	23069	23078	20 %	80 %	0 %	0 %	513843615
23	NC_021517	ATTCA	2	10	24614	24623	40 %	40 %	0 %	20 %	513843617
24	NC_021517	TGGCC	2	10	24948	24957	0 %	20 %	40 %	40 %	513843618
25	NC_021517	TGTTT	2	10	25047	25056	0 %	80 %	20 %	0 %	513843618
26	NC_021517	TTTGA	2	10	26297	26306	20 %	60 %	20 %	0 %	513843620
27	NC_021517	TCTAA	2	10	26519	26528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021517	TACGA	2	10	27174	27183	40 %	20 %	20 %	20 %	513843621
29	NC_021517	ATTTT	2	10	31274	31283	20 %	80 %	0 %	0 %	513843623
30	NC_021517	TTTTA	2	10	31656	31665	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021517	GCACA	2	10	33699	33708	40 %	0 %	20 %	40 %	513843625
32	NC_021517	CAAAT	2	10	39167	39176	60 %	20 %	0 %	20 %	513843631
33	NC_021517	AACTT	2	10	39964	39973	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.