MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	ACACA	2	10	3225	3234	60 %	0 %	0 %	40 %	513843593
2	NC_021517	AACAG	2	10	3563	3572	60 %	0 %	20 %	20 %	513843594
3	NC_021517	TAGCT	2	10	9735	9744	20 %	40 %	20 %	20 %	513843603
4	NC_021517	ACGTC	2	10	12376	12385	20 %	20 %	20 %	40 %	513843606
5	NC_021517	CACCG	2	10	13505	13514	20 %	0 %	20 %	60 %	513843606
6	NC_021517	GGTCC	2	10	16594	16603	0 %	20 %	40 %	40 %	513843608
7	NC_021517	TGATA	2	10	17390	17399	40 %	40 %	20 %	0 %	513843609
8	NC_021517	AACTT	2	10	17925	17934	40 %	40 %	0 %	20 %	513843610
9	NC_021517	ACCAA	2	10	19392	19401	60 %	0 %	0 %	40 %	513843611
10	NC_021517	TAAAT	2	10	19659	19668	60 %	40 %	0 %	0 %	513843611
11	NC_021517	CAGCA	2	10	20291	20300	40 %	0 %	20 %	40 %	513843612
12	NC_021517	AAACT	2	10	20425	20434	60 %	20 %	0 %	20 %	513843612
13	NC_021517	TATTT	2	10	23069	23078	20 %	80 %	0 %	0 %	513843615
14	NC_021517	ATTCA	2	10	24614	24623	40 %	40 %	0 %	20 %	513843617
15	NC_021517	TGGCC	2	10	24948	24957	0 %	20 %	40 %	40 %	513843618
16	NC_021517	TGTTT	2	10	25047	25056	0 %	80 %	20 %	0 %	513843618
17	NC_021517	TTTGA	2	10	26297	26306	20 %	60 %	20 %	0 %	513843620
18	NC_021517	TACGA	2	10	27174	27183	40 %	20 %	20 %	20 %	513843621
19	NC_021517	ATTTT	2	10	31274	31283	20 %	80 %	0 %	0 %	513843623
20	NC_021517	GCACA	2	10	33699	33708	40 %	0 %	20 %	40 %	513843625
21	NC_021517	CAAAT	2	10	39167	39176	60 %	20 %	0 %	20 %	513843631

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.