MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	TCT	2	6	81	86	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843591
2	NC_021517	AAG	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843591
3	NC_021517	AAG	2	6	174	179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843591
4	NC_021517	CTG	2	6	230	235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843591
5	NC_021517	TGT	2	6	270	275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843591
6	NC_021517	TGA	2	6	372	377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843591
7	NC_021517	GCC	2	6	437	442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	513843591
8	NC_021517	AGC	2	6	451	456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843591
9	NC_021517	CAA	2	6	481	486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843591
10	NC_021517	CCA	2	6	560	565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843591
11	NC_021517	TAA	2	6	610	615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843591
12	NC_021517	CAC	2	6	628	633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843591
13	NC_021517	CCA	2	6	634	639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843591
14	NC_021517	CAT	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843591
15	NC_021517	AAC	2	6	1010	1015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021517	ATT	2	6	1240	1245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021517	ATA	2	6	1248	1253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021517	GCT	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021517	AAG	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021517	CTT	2	6	1303	1308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_021517	ACC	2	6	1459	1464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021517	AAT	2	6	1513	1518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021517	GTA	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843592
24	NC_021517	GTT	3	9	1745	1753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843592
25	NC_021517	GAT	2	6	1836	1841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843592
26	NC_021517	AGA	2	6	1922	1927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843592
27	NC_021517	TAA	2	6	2112	2117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843592
28	NC_021517	AAT	2	6	2122	2127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843592
29	NC_021517	CCT	2	6	2146	2151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_021517	ACC	2	6	2225	2230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_021517	AGC	2	6	2426	2431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021517	TAA	2	6	2533	2538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021517	TTA	2	6	2588	2593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021517	GAG	2	6	2633	2638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021517	ATT	2	6	2653	2658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843593
36	NC_021517	GGC	2	6	2677	2682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843593
37	NC_021517	ACC	2	6	2762	2767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843593
38	NC_021517	ACA	2	6	2789	2794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843593
39	NC_021517	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843593
40	NC_021517	AGA	2	6	3126	3131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843593
41	NC_021517	AAG	2	6	3152	3157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843593
42	NC_021517	CTA	2	6	3170	3175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843593
43	NC_021517	ATT	2	6	3198	3203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843593
44	NC_021517	ATC	2	6	3237	3242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843593
45	NC_021517	TTA	2	6	3250	3255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843593
46	NC_021517	AGG	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021517	GTT	2	6	3768	3773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021517	TAT	2	6	3922	3927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843595
49	NC_021517	CGT	2	6	3948	3953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843595
50	NC_021517	TCT	2	6	4095	4100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843595
51	NC_021517	AAC	2	6	4194	4199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021517	GTT	2	6	4457	4462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021517	TAT	2	6	4650	4655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843596
54	NC_021517	CAA	2	6	4664	4669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843596
55	NC_021517	AAT	2	6	4822	4827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843596
56	NC_021517	TCA	2	6	4910	4915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843596
57	NC_021517	ACA	2	6	5186	5191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843596
58	NC_021517	CTT	2	6	5373	5378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843596
59	NC_021517	TGA	2	6	5382	5387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843596
60	NC_021517	ACT	2	6	5430	5435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843596
61	NC_021517	CAA	2	6	5458	5463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843596
62	NC_021517	GCG	2	6	5466	5471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843596
63	NC_021517	ATC	2	6	5516	5521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843596
64	NC_021517	GAC	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843596
65	NC_021517	GAA	2	6	5554	5559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843596
66	NC_021517	TGA	2	6	5570	5575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843596
67	NC_021517	AAG	2	6	5607	5612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843596
68	NC_021517	ACT	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843596
69	NC_021517	TGG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843596
70	NC_021517	GAA	2	6	5725	5730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843596
71	NC_021517	TTG	2	6	5952	5957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843597
72	NC_021517	CAT	2	6	6132	6137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843598
73	NC_021517	GCG	2	6	6152	6157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	513843598
74	NC_021517	ATT	2	6	6192	6197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843598
75	NC_021517	TCC	2	6	6230	6235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513843598
76	NC_021517	GAA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843599
77	NC_021517	AAC	2	6	6299	6304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843599
78	NC_021517	AAC	2	6	6345	6350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843599
79	NC_021517	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843599
80	NC_021517	AGC	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843599
81	NC_021517	ATA	2	6	6589	6594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021517	AAT	2	6	6645	6650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021517	AAT	2	6	6729	6734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021517	TCG	2	6	6937	6942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843600
85	NC_021517	TCT	2	6	7001	7006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843600
86	NC_021517	TTG	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843600
87	NC_021517	CTT	2	6	7269	7274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843601
88	NC_021517	TGC	2	6	7292	7297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843601
89	NC_021517	TCC	2	6	7306	7311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021517	ATC	2	6	7313	7318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_021517	AAT	2	6	7323	7328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021517	CAG	2	6	7423	7428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021517	TGT	2	6	7477	7482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021517	ACA	2	6	7523	7528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021517	GTG	2	6	7647	7652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843602
96	NC_021517	ATT	2	6	7657	7662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843602
97	NC_021517	TGA	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
98	NC_021517	AAG	2	6	7671	7676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	513843602
99	NC_021517	CAA	2	6	8297	8302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843602
100	NC_021517	GAT	2	6	8468	8473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
101	NC_021517	TTA	2	6	8507	8512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843602
102	NC_021517	ACT	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	513843602
103	NC_021517	GTT	2	6	8596	8601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843602
104	NC_021517	GTG	2	6	8609	8614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	513843602
105	NC_021517	ACG	2	6	8674	8679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843602
106	NC_021517	TTA	2	6	8765	8770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843602
107	NC_021517	ATT	2	6	8779	8784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843602
108	NC_021517	CAG	2	6	8828	8833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843602
109	NC_021517	CCA	2	6	8881	8886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843602
110	NC_021517	ACA	2	6	9018	9023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843602
111	NC_021517	GAT	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
112	NC_021517	ACA	2	6	9157	9162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843602
113	NC_021517	ACC	2	6	9249	9254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	513843602
114	NC_021517	ATG	2	6	9276	9281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
115	NC_021517	ACA	2	6	9367	9372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	513843602
116	NC_021517	TGA	2	6	9459	9464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843602
117	NC_021517	AGC	2	6	9573	9578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	513843602
118	NC_021517	ATA	2	6	9685	9690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021517	GTA	2	6	9770	9775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843603
120	NC_021517	CCT	2	6	9972	9977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	513843603
121	NC_021517	GTT	2	6	10015	10020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	513843603
122	NC_021517	TAT	2	6	10092	10097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	513843604
123	NC_021517	GCT	2	6	10098	10103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843604
124	NC_021517	TGC	2	6	10108	10113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843604
125	NC_021517	TGA	2	6	10153	10158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843604
126	NC_021517	TCT	2	6	10198	10203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843604
127	NC_021517	TGA	2	6	10204	10209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843604
128	NC_021517	TGA	2	6	10261	10266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	513843604
129	NC_021517	CTT	2	6	10280	10285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	513843604
130	NC_021517	TGC	2	6	10406	10411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	513843604
131	NC_021517	AAT	2	6	10624	10629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021517	TCC	2	6	10661	10666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_021517	GCG	2	6	10717	10722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_021517	TTG	2	6	10807	10812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_021517	GTC	2	6	11117	11122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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257	NC_021517	TAA	2	6	19064	19069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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260	NC_021517	GTG	2	6	19199	19204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
261	NC_021517	TAA	2	6	19257	19262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
262	NC_021517	AAT	2	6	19320	19325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	513843611
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267	NC_021517	AAT	2	6	19706	19711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_021517	ATT	2	6	19783	19788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_021517	AGT	2	6	19892	19897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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