MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	AT	3	6	3369	3374	50 %	50 %	0 %	0 %	513843593
2	NC_021517	TG	4	8	3475	3482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021517	CT	3	6	4607	4612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021517	GT	3	6	4624	4629	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021517	TA	3	6	5240	5245	50 %	50 %	0 %	0 %	513843596
6	NC_021517	AC	3	6	6047	6052	50 %	0 %	0 %	50 %	513843597
7	NC_021517	CG	3	6	6178	6183	0 %	0 %	50 %	50 %	513843598
8	NC_021517	AT	3	6	7079	7084	50 %	50 %	0 %	0 %	513843600
9	NC_021517	AC	3	6	8410	8415	50 %	0 %	0 %	50 %	513843602
10	NC_021517	CT	3	6	10332	10337	0 %	50 %	0 %	50 %	513843604
11	NC_021517	TA	3	6	10963	10968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021517	CA	3	6	11042	11047	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_021517	AC	3	6	15354	15359	50 %	0 %	0 %	50 %	513843606
14	NC_021517	AC	3	6	15585	15590	50 %	0 %	0 %	50 %	513843606
15	NC_021517	GC	3	6	15772	15777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_021517	CT	3	6	15791	15796	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021517	CT	3	6	16294	16299	0 %	50 %	0 %	50 %	513843607
18	NC_021517	AG	3	6	17593	17598	50 %	0 %	50 %	0 %	513843609
19	NC_021517	TC	3	6	19580	19585	0 %	50 %	0 %	50 %	513843611
20	NC_021517	TA	3	6	19591	19596	50 %	50 %	0 %	0 %	513843611
21	NC_021517	AT	4	8	19608	19615	50 %	50 %	0 %	0 %	513843611
22	NC_021517	TA	5	10	19633	19642	50 %	50 %	0 %	0 %	513843611
23	NC_021517	GA	3	6	19719	19724	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021517	TA	3	6	19743	19748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021517	AT	3	6	21235	21240	50 %	50 %	0 %	0 %	513843613
26	NC_021517	TA	3	6	21391	21396	50 %	50 %	0 %	0 %	513843614
27	NC_021517	CT	3	6	21586	21591	0 %	50 %	0 %	50 %	513843614
28	NC_021517	TG	3	6	23250	23255	0 %	50 %	50 %	0 %	513843615
29	NC_021517	TA	3	6	25032	25037	50 %	50 %	0 %	0 %	513843618
30	NC_021517	GA	3	6	25103	25108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021517	CT	3	6	25127	25132	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021517	AC	3	6	25780	25785	50 %	0 %	0 %	50 %	513843620
33	NC_021517	AC	3	6	27632	27637	50 %	0 %	0 %	50 %	513843621
34	NC_021517	TG	3	6	30841	30846	0 %	50 %	50 %	0 %	513843623
35	NC_021517	AT	3	6	31966	31971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021517	TA	3	6	33253	33258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021517	TA	4	8	33285	33292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021517	AC	3	6	34098	34103	50 %	0 %	0 %	50 %	513843626
39	NC_021517	CG	3	6	35088	35093	0 %	0 %	50 %	50 %	513843627
40	NC_021517	CA	3	6	35579	35584	50 %	0 %	0 %	50 %	513843627
41	NC_021517	TC	3	6	36576	36581	0 %	50 %	0 %	50 %	513843628
42	NC_021517	AC	3	6	37191	37196	50 %	0 %	0 %	50 %	513843629
43	NC_021517	GA	3	6	39424	39429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.