MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16E

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021517	A	6	6	1384	1389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021517	T	6	6	1443	1448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021517	A	6	6	1531	1536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021517	A	6	6	1544	1549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021517	T	6	6	1936	1941	0 %	100 %	0 %	0 %	513843592
6	NC_021517	T	6	6	1971	1976	0 %	100 %	0 %	0 %	513843592
7	NC_021517	T	8	8	2009	2016	0 %	100 %	0 %	0 %	513843592
8	NC_021517	T	8	8	2066	2073	0 %	100 %	0 %	0 %	513843592
9	NC_021517	A	6	6	2727	2732	100 %	0 %	0 %	0 %	513843593
10	NC_021517	T	6	6	3202	3207	0 %	100 %	0 %	0 %	513843593
11	NC_021517	A	6	6	3331	3336	100 %	0 %	0 %	0 %	513843593
12	NC_021517	T	6	6	3388	3393	0 %	100 %	0 %	0 %	513843593
13	NC_021517	A	6	6	3539	3544	100 %	0 %	0 %	0 %	513843594
14	NC_021517	A	7	7	3553	3559	100 %	0 %	0 %	0 %	513843594
15	NC_021517	A	6	6	3737	3742	100 %	0 %	0 %	0 %	513843594
16	NC_021517	G	6	6	3761	3766	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021517	A	6	6	3851	3856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021517	T	6	6	3876	3881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021517	T	6	6	4451	4456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021517	A	6	6	4470	4475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021517	A	6	6	5066	5071	100 %	0 %	0 %	0 %	513843596
22	NC_021517	A	6	6	5103	5108	100 %	0 %	0 %	0 %	513843596
23	NC_021517	A	6	6	5157	5162	100 %	0 %	0 %	0 %	513843596
24	NC_021517	A	6	6	5223	5228	100 %	0 %	0 %	0 %	513843596
25	NC_021517	A	6	6	5888	5893	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021517	A	6	6	6236	6241	100 %	0 %	0 %	0 %	513843598
27	NC_021517	A	6	6	6438	6443	100 %	0 %	0 %	0 %	513843599
28	NC_021517	A	6	6	6445	6450	100 %	0 %	0 %	0 %	513843599
29	NC_021517	T	6	6	7014	7019	0 %	100 %	0 %	0 %	513843600
30	NC_021517	T	7	7	7226	7232	0 %	100 %	0 %	0 %	513843601
31	NC_021517	A	6	6	7732	7737	100 %	0 %	0 %	0 %	513843602
32	NC_021517	A	6	6	8124	8129	100 %	0 %	0 %	0 %	513843602
33	NC_021517	A	6	6	8143	8148	100 %	0 %	0 %	0 %	513843602
34	NC_021517	A	7	7	8181	8187	100 %	0 %	0 %	0 %	513843602
35	NC_021517	A	6	6	8275	8280	100 %	0 %	0 %	0 %	513843602
36	NC_021517	A	7	7	9894	9900	100 %	0 %	0 %	0 %	513843603
37	NC_021517	G	10	10	15700	15709	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021517	T	6	6	17028	17033	0 %	100 %	0 %	0 %	513843608
39	NC_021517	T	6	6	17311	17316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021517	A	6	6	17414	17419	100 %	0 %	0 %	0 %	513843609
41	NC_021517	T	8	8	17443	17450	0 %	100 %	0 %	0 %	513843609
42	NC_021517	A	6	6	19018	19023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021517	A	8	8	19219	19226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021517	A	7	7	19240	19246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021517	A	7	7	19332	19338	100 %	0 %	0 %	0 %	513843611
46	NC_021517	T	6	6	19691	19696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021517	A	7	7	20017	20023	100 %	0 %	0 %	0 %	513843612
48	NC_021517	T	7	7	20462	20468	0 %	100 %	0 %	0 %	513843612
49	NC_021517	T	8	8	20498	20505	0 %	100 %	0 %	0 %	513843612
50	NC_021517	T	7	7	20699	20705	0 %	100 %	0 %	0 %	513843612
51	NC_021517	T	7	7	20830	20836	0 %	100 %	0 %	0 %	513843612
52	NC_021517	T	6	6	21020	21025	0 %	100 %	0 %	0 %	513843612
53	NC_021517	A	6	6	21348	21353	100 %	0 %	0 %	0 %	513843613
54	NC_021517	A	7	7	21370	21376	100 %	0 %	0 %	0 %	513843614
55	NC_021517	A	6	6	21446	21451	100 %	0 %	0 %	0 %	513843614
56	NC_021517	A	7	7	21657	21663	100 %	0 %	0 %	0 %	513843614
57	NC_021517	A	6	6	21698	21703	100 %	0 %	0 %	0 %	513843614
58	NC_021517	A	6	6	21904	21909	100 %	0 %	0 %	0 %	513843614
59	NC_021517	A	6	6	22030	22035	100 %	0 %	0 %	0 %	513843614
60	NC_021517	A	6	6	22116	22121	100 %	0 %	0 %	0 %	513843614
61	NC_021517	T	8	8	22313	22320	0 %	100 %	0 %	0 %	513843615
62	NC_021517	A	7	7	23099	23105	100 %	0 %	0 %	0 %	513843615
63	NC_021517	A	7	7	23728	23734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021517	T	6	6	24321	24326	0 %	100 %	0 %	0 %	513843617
65	NC_021517	T	7	7	24859	24865	0 %	100 %	0 %	0 %	513843618
66	NC_021517	A	6	6	25229	25234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021517	T	6	6	25289	25294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021517	T	8	8	25446	25453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021517	T	6	6	26269	26274	0 %	100 %	0 %	0 %	513843620
70	NC_021517	T	6	6	26285	26290	0 %	100 %	0 %	0 %	513843620
71	NC_021517	T	6	6	26470	26475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021517	A	7	7	26656	26662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021517	T	7	7	28429	28435	0 %	100 %	0 %	0 %	513843621
74	NC_021517	T	8	8	29133	29140	0 %	100 %	0 %	0 %	513843622
75	NC_021517	T	6	6	29821	29826	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
76	NC_021517	T	6	6	30727	30732	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
77	NC_021517	T	8	8	30993	31000	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
78	NC_021517	T	6	6	31111	31116	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
79	NC_021517	T	6	6	31153	31158	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
80	NC_021517	T	6	6	31440	31445	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
81	NC_021517	T	7	7	31560	31566	0 %	100 %	0 %	0 %	513843623
82	NC_021517	T	6	6	32539	32544	0 %	100 %	0 %	0 %	513843624
83	NC_021517	A	6	6	33073	33078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021517	T	6	6	33112	33117	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021517	T	6	6	33124	33129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021517	A	7	7	34436	34442	100 %	0 %	0 %	0 %	513843626
87	NC_021517	A	6	6	34589	34594	100 %	0 %	0 %	0 %	513843626
88	NC_021517	A	6	6	34608	34613	100 %	0 %	0 %	0 %	513843626
89	NC_021517	A	6	6	34793	34798	100 %	0 %	0 %	0 %	513843626
90	NC_021517	A	8	8	36502	36509	100 %	0 %	0 %	0 %	513843628
91	NC_021517	A	6	6	37635	37640	100 %	0 %	0 %	0 %	513843629
92	NC_021517	A	6	6	37646	37651	100 %	0 %	0 %	0 %	513843629
93	NC_021517	T	6	6	38008	38013	0 %	100 %	0 %	0 %	513843630
94	NC_021517	G	6	6	38807	38812	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021517	T	7	7	38931	38937	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021517	T	6	6	39049	39054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021517	A	6	6	39203	39208	100 %	0 %	0 %	0 %	513843631

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.