MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16C

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021516	TTCTT	2	10	420	429	0 %	80 %	0 %	20 %	513843220
2	NC_021516	TTGAG	2	10	2325	2334	20 %	40 %	40 %	0 %	513843223
3	NC_021516	GTTTT	2	10	2494	2503	0 %	80 %	20 %	0 %	513843223
4	NC_021516	GTTCT	2	10	3361	3370	0 %	60 %	20 %	20 %	513843226
5	NC_021516	TATCG	2	10	6402	6411	20 %	40 %	20 %	20 %	513843229
6	NC_021516	ATTAA	2	10	7485	7494	60 %	40 %	0 %	0 %	513843230
7	NC_021516	AGCAT	2	10	8778	8787	40 %	20 %	20 %	20 %	513843231
8	NC_021516	AAAAT	2	10	10870	10879	80 %	20 %	0 %	0 %	513843233
9	NC_021516	ATTTA	2	10	11554	11563	40 %	60 %	0 %	0 %	513843234
10	NC_021516	TAAAT	2	10	12407	12416	60 %	40 %	0 %	0 %	513843234
11	NC_021516	TTTGG	2	10	17846	17855	0 %	60 %	40 %	0 %	513843239
12	NC_021516	ACGCT	2	10	19345	19354	20 %	20 %	20 %	40 %	513843242
13	NC_021516	TTTGG	2	10	20771	20780	0 %	60 %	40 %	0 %	513843244
14	NC_021516	TTCTT	2	10	22177	22186	0 %	80 %	0 %	20 %	513843245
15	NC_021516	GCGTA	2	10	23074	23083	20 %	20 %	40 %	20 %	513843245
16	NC_021516	TCATT	2	10	25616	25625	20 %	60 %	0 %	20 %	513843249
17	NC_021516	TTTGT	2	10	26254	26263	0 %	80 %	20 %	0 %	513843250
18	NC_021516	CTAAG	2	10	26748	26757	40 %	20 %	20 %	20 %	513843251

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.