MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16C

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021516	TTAA	2	8	20	27	50 %	50 %	0 %	0 %	513843220
2	NC_021516	TTAA	2	8	193	200	50 %	50 %	0 %	0 %	513843220
3	NC_021516	CAAC	2	8	602	609	50 %	0 %	0 %	50 %	513843220
4	NC_021516	TTCT	2	8	837	844	0 %	75 %	0 %	25 %	513843220
5	NC_021516	CTTT	2	8	1155	1162	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_021516	CGTT	2	8	2229	2236	0 %	50 %	25 %	25 %	513843223
7	NC_021516	TCAA	2	8	2316	2323	50 %	25 %	0 %	25 %	513843223
8	NC_021516	TATC	2	8	2584	2591	25 %	50 %	0 %	25 %	513843223
9	NC_021516	ATTT	2	8	2800	2807	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021516	CCAA	2	8	4195	4202	50 %	0 %	0 %	50 %	513843226
11	NC_021516	TTTG	2	8	4421	4428	0 %	75 %	25 %	0 %	513843226
12	NC_021516	TGAC	2	8	4453	4460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_021516	CTAA	2	8	4527	4534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021516	CATT	2	8	4544	4551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_021516	ATCA	2	8	6052	6059	50 %	25 %	0 %	25 %	513843229
16	NC_021516	TTGG	2	8	6165	6172	0 %	50 %	50 %	0 %	513843229
17	NC_021516	TGTT	2	8	6623	6630	0 %	75 %	25 %	0 %	513843229
18	NC_021516	TTTC	2	8	6810	6817	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_021516	CTTA	2	8	7012	7019	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_021516	ATCA	2	8	7135	7142	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_021516	TTTC	2	8	7593	7600	0 %	75 %	0 %	25 %	513843230
22	NC_021516	AATG	2	8	8298	8305	50 %	25 %	25 %	0 %	513843230
23	NC_021516	TACA	2	8	8518	8525	50 %	25 %	0 %	25 %	513843230
24	NC_021516	TTCA	2	8	8540	8547	25 %	50 %	0 %	25 %	513843230
25	NC_021516	CCTA	2	8	8619	8626	25 %	25 %	0 %	50 %	513843231
26	NC_021516	TATT	2	8	9572	9579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021516	TTTC	2	8	9651	9658	0 %	75 %	0 %	25 %	513843232
28	NC_021516	TGCC	2	8	9719	9726	0 %	25 %	25 %	50 %	513843232
29	NC_021516	ATTG	2	8	11261	11268	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021516	TTGC	2	8	11595	11602	0 %	50 %	25 %	25 %	513843234
31	NC_021516	TTTG	2	8	12553	12560	0 %	75 %	25 %	0 %	513843234
32	NC_021516	TTTA	2	8	13115	13122	25 %	75 %	0 %	0 %	513843236
33	NC_021516	TGCT	2	8	13169	13176	0 %	50 %	25 %	25 %	513843236
34	NC_021516	TGAT	2	8	13182	13189	25 %	50 %	25 %	0 %	513843236
35	NC_021516	TGCT	2	8	13316	13323	0 %	50 %	25 %	25 %	513843236
36	NC_021516	GTTC	2	8	15041	15048	0 %	50 %	25 %	25 %	513843237
37	NC_021516	CCAC	2	8	15243	15250	25 %	0 %	0 %	75 %	513843237
38	NC_021516	AATT	2	8	15694	15701	50 %	50 %	0 %	0 %	513843238
39	NC_021516	TAGA	2	8	15769	15776	50 %	25 %	25 %	0 %	513843238
40	NC_021516	TACT	2	8	15926	15933	25 %	50 %	0 %	25 %	513843238
41	NC_021516	AAGA	2	8	16147	16154	75 %	0 %	25 %	0 %	513843238
42	NC_021516	CATT	2	8	16230	16237	25 %	50 %	0 %	25 %	513843238
43	NC_021516	CATT	2	8	16262	16269	25 %	50 %	0 %	25 %	513843238
44	NC_021516	CTGG	2	8	16561	16568	0 %	25 %	50 %	25 %	513843239
45	NC_021516	CGCC	2	8	17460	17467	0 %	0 %	25 %	75 %	513843239
46	NC_021516	GACT	2	8	17794	17801	25 %	25 %	25 %	25 %	513843239
47	NC_021516	AAAT	2	8	18126	18133	75 %	25 %	0 %	0 %	513843240
48	NC_021516	TAAT	2	8	18163	18170	50 %	50 %	0 %	0 %	513843240
49	NC_021516	GTTG	2	8	18415	18422	0 %	50 %	50 %	0 %	513843241
50	NC_021516	GATT	2	8	18504	18511	25 %	50 %	25 %	0 %	513843241
51	NC_021516	TAGC	2	8	18628	18635	25 %	25 %	25 %	25 %	513843241
52	NC_021516	TTAA	2	8	18741	18748	50 %	50 %	0 %	0 %	513843241
53	NC_021516	TAAC	2	8	18874	18881	50 %	25 %	0 %	25 %	513843242
54	NC_021516	TTTG	2	8	18981	18988	0 %	75 %	25 %	0 %	513843242
55	NC_021516	GTTG	2	8	19190	19197	0 %	50 %	50 %	0 %	513843242
56	NC_021516	GGGT	2	8	19779	19786	0 %	25 %	75 %	0 %	513843243
57	NC_021516	CCAC	2	8	20463	20470	25 %	0 %	0 %	75 %	513843243
58	NC_021516	CAAT	2	8	20479	20486	50 %	25 %	0 %	25 %	513843243
59	NC_021516	TGCT	2	8	20931	20938	0 %	50 %	25 %	25 %	513843244
60	NC_021516	CTTT	2	8	21221	21228	0 %	75 %	0 %	25 %	513843244
61	NC_021516	CTGC	2	8	21331	21338	0 %	25 %	25 %	50 %	513843244
62	NC_021516	CAAA	2	8	21494	21501	75 %	0 %	0 %	25 %	513843244
63	NC_021516	ACAA	2	8	22444	22451	75 %	0 %	0 %	25 %	513843245
64	NC_021516	CCCA	2	8	23001	23008	25 %	0 %	0 %	75 %	513843245
65	NC_021516	ATCA	2	8	23832	23839	50 %	25 %	0 %	25 %	513843245
66	NC_021516	CTTT	2	8	23902	23909	0 %	75 %	0 %	25 %	513843245
67	NC_021516	TTGG	2	8	23911	23918	0 %	50 %	50 %	0 %	513843245
68	NC_021516	CATA	2	8	24502	24509	50 %	25 %	0 %	25 %	513843246
69	NC_021516	TAAA	2	8	24651	24658	75 %	25 %	0 %	0 %	513843247
70	NC_021516	GCTT	2	8	25198	25205	0 %	50 %	25 %	25 %	513843248
71	NC_021516	CTGA	2	8	25493	25500	25 %	25 %	25 %	25 %	513843249
72	NC_021516	ACCA	2	8	25712	25719	50 %	0 %	0 %	50 %	513843249
73	NC_021516	AATT	2	8	26125	26132	50 %	50 %	0 %	0 %	513843250
74	NC_021516	TTTC	2	8	26433	26440	0 %	75 %	0 %	25 %	513843251
75	NC_021516	ATAA	2	8	26766	26773	75 %	25 %	0 %	0 %	513843251
76	NC_021516	TTGC	2	8	26820	26827	0 %	50 %	25 %	25 %	513843251
77	NC_021516	CGTT	2	8	27242	27249	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_021516	TGTT	2	8	27271	27278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.