MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16C

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021516	TC	3	6	2077	2082	0 %	50 %	0 %	50 %	513843223
2	NC_021516	TA	3	6	2570	2575	50 %	50 %	0 %	0 %	513843223
3	NC_021516	TA	3	6	2649	2654	50 %	50 %	0 %	0 %	513843224
4	NC_021516	AC	3	6	4459	4464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021516	AG	3	6	4476	4481	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021516	TA	3	6	6150	6155	50 %	50 %	0 %	0 %	513843229
7	NC_021516	GT	3	6	6512	6517	0 %	50 %	50 %	0 %	513843229
8	NC_021516	TA	3	6	6690	6695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021516	TC	3	6	8425	8430	0 %	50 %	0 %	50 %	513843230
10	NC_021516	CT	3	6	10179	10184	0 %	50 %	0 %	50 %	513843232
11	NC_021516	TA	3	6	12117	12122	50 %	50 %	0 %	0 %	513843234
12	NC_021516	GC	3	6	12242	12247	0 %	0 %	50 %	50 %	513843234
13	NC_021516	TA	3	6	14488	14493	50 %	50 %	0 %	0 %	513843236
14	NC_021516	GT	3	6	15561	15566	0 %	50 %	50 %	0 %	513843238
15	NC_021516	CT	3	6	16427	16432	0 %	50 %	0 %	50 %	513843239
16	NC_021516	CT	3	6	16775	16780	0 %	50 %	0 %	50 %	513843239
17	NC_021516	CT	3	6	22010	22015	0 %	50 %	0 %	50 %	513843245
18	NC_021516	CT	3	6	23293	23298	0 %	50 %	0 %	50 %	513843245
19	NC_021516	AT	3	6	23656	23661	50 %	50 %	0 %	0 %	513843245
20	NC_021516	CA	3	6	25130	25135	50 %	0 %	0 %	50 %	513843248

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.