MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16C

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021516	T	6	6	78	83	0 %	100 %	0 %	0 %	513843220
2	NC_021516	T	6	6	123	128	0 %	100 %	0 %	0 %	513843220
3	NC_021516	T	7	7	523	529	0 %	100 %	0 %	0 %	513843220
4	NC_021516	T	6	6	581	586	0 %	100 %	0 %	0 %	513843220
5	NC_021516	T	6	6	588	593	0 %	100 %	0 %	0 %	513843220
6	NC_021516	A	6	6	1465	1470	100 %	0 %	0 %	0 %	513843221
7	NC_021516	A	7	7	1480	1486	100 %	0 %	0 %	0 %	513843221
8	NC_021516	A	6	6	1694	1699	100 %	0 %	0 %	0 %	513843222
9	NC_021516	A	6	6	1899	1904	100 %	0 %	0 %	0 %	513843222
10	NC_021516	A	6	6	2743	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	513843224
11	NC_021516	C	7	7	3114	3120	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_021516	T	6	6	3903	3908	0 %	100 %	0 %	0 %	513843226
13	NC_021516	T	6	6	3963	3968	0 %	100 %	0 %	0 %	513843226
14	NC_021516	T	6	6	4166	4171	0 %	100 %	0 %	0 %	513843226
15	NC_021516	A	6	6	4375	4380	100 %	0 %	0 %	0 %	513843226
16	NC_021516	T	6	6	4396	4401	0 %	100 %	0 %	0 %	513843226
17	NC_021516	T	6	6	4613	4618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021516	A	6	6	4632	4637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021516	A	6	6	5207	5212	100 %	0 %	0 %	0 %	513843227
20	NC_021516	T	6	6	5232	5237	0 %	100 %	0 %	0 %	513843227
21	NC_021516	T	6	6	5724	5729	0 %	100 %	0 %	0 %	513843229
22	NC_021516	A	6	6	6739	6744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021516	A	6	6	7189	7194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021516	A	6	6	7196	7201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021516	T	6	6	7955	7960	0 %	100 %	0 %	0 %	513843230
26	NC_021516	A	7	7	9342	9348	100 %	0 %	0 %	0 %	513843231
27	NC_021516	T	6	6	10079	10084	0 %	100 %	0 %	0 %	513843232
28	NC_021516	T	6	6	10144	10149	0 %	100 %	0 %	0 %	513843232
29	NC_021516	A	8	8	11290	11297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021516	T	6	6	11657	11662	0 %	100 %	0 %	0 %	513843234
31	NC_021516	T	6	6	12968	12973	0 %	100 %	0 %	0 %	513843236
32	NC_021516	T	6	6	13929	13934	0 %	100 %	0 %	0 %	513843236
33	NC_021516	T	7	7	14195	14201	0 %	100 %	0 %	0 %	513843236
34	NC_021516	T	6	6	14780	14785	0 %	100 %	0 %	0 %	513843236
35	NC_021516	T	7	7	14963	14969	0 %	100 %	0 %	0 %	513843236
36	NC_021516	T	6	6	15080	15085	0 %	100 %	0 %	0 %	513843237
37	NC_021516	T	6	6	15427	15432	0 %	100 %	0 %	0 %	513843237
38	NC_021516	C	6	6	15454	15459	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_021516	T	6	6	15482	15487	0 %	100 %	0 %	0 %	513843238
40	NC_021516	C	6	6	15636	15641	0 %	0 %	0 %	100 %	513843238
41	NC_021516	T	6	6	15896	15901	0 %	100 %	0 %	0 %	513843238
42	NC_021516	T	8	8	16495	16502	0 %	100 %	0 %	0 %	513843239
43	NC_021516	T	6	6	17554	17559	0 %	100 %	0 %	0 %	513843239
44	NC_021516	T	6	6	17718	17723	0 %	100 %	0 %	0 %	513843239
45	NC_021516	T	6	6	21815	21820	0 %	100 %	0 %	0 %	513843244
46	NC_021516	T	6	6	23682	23687	0 %	100 %	0 %	0 %	513843245
47	NC_021516	T	6	6	24085	24090	0 %	100 %	0 %	0 %	513843246
48	NC_021516	A	6	6	25608	25613	100 %	0 %	0 %	0 %	513843249
49	NC_021516	T	7	7	26083	26089	0 %	100 %	0 %	0 %	513843250
50	NC_021516	A	6	6	26683	26688	100 %	0 %	0 %	0 %	513843251

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.