MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16A

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021515	ATTA	2	8	167	174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021515	GTTA	2	8	2047	2054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021515	CCAA	2	8	2395	2402	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_021515	CTTT	2	8	2550	2557	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_021515	AGTA	2	8	2560	2567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021515	TGTT	2	8	2734	2741	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021515	GTTT	2	8	2873	2880	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021515	CGTT	2	8	4205	4212	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_021515	AGCA	2	8	4725	4732	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_021515	CTTT	2	8	4754	4761	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_021515	TTAG	2	8	4947	4954	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021515	ATTT	2	8	5106	5113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021515	AATC	2	8	5167	5174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_021515	AGCC	2	8	5527	5534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021515	TAAT	2	8	5715	5722	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021515	GGAA	2	8	5798	5805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021515	TTAA	2	8	6405	6412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021515	TTAT	2	8	6842	6849	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021515	GATT	2	8	7177	7184	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021515	GTTT	2	8	7215	7222	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.