MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16 plasmid Lp16A

Total Repeats: 51

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021515	ATG	2	6	4	9	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021515	GGT	2	6	106	111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021515	TAG	2	6	140	145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021515	TCC	2	6	156	161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021515	AGG	2	6	192	197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021515	AGT	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021515	CTT	2	6	313	318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021515	ATC	2	6	336	341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021515	ATT	2	6	357	362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021515	ATC	2	6	1996	2001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_021515	CTT	2	6	2168	2173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_021515	CAA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_021515	CCA	2	6	2476	2481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021515	TTG	2	6	2575	2580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021515	TTG	2	6	2614	2619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021515	ATT	2	6	2695	2700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021515	TAA	2	6	2778	2783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021515	TTG	2	6	2841	2846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021515	TCA	2	6	2894	2899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021515	TAT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021515	CAC	2	6	4101	4106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_021515	CAG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021515	CAA	2	6	4448	4453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021515	TAA	2	6	4598	4603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021515	TCT	2	6	4606	4611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_021515	TCA	2	6	4666	4671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021515	TCA	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_021515	AAT	2	6	4791	4796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021515	CAA	2	6	4991	4996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_021515	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021515	TTA	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021515	TGA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021515	AAT	2	6	5394	5399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021515	TTG	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021515	ATC	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021515	TGA	2	6	5826	5831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021515	GCA	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021515	GTT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021515	TTG	2	6	6116	6121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021515	GGT	2	6	6191	6196	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021515	AAG	2	6	6367	6372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021515	TTG	2	6	6439	6444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021515	GAT	3	9	6450	6458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021515	TAT	2	6	6553	6558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021515	TGA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021515	AGC	2	6	6571	6576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021515	CAA	3	9	6596	6604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021515	TGG	2	6	6717	6722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021515	TCT	2	6	7048	7053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021515	TAT	2	6	7063	7068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021515	TGT	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.