MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021514	CAACTA	2	12	68582	68593	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_021514	TATCAA	4	24	120578	120601	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_021514	GTTAAC	2	12	163723	163734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_021514	AAAGAT	2	12	210050	210061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021514	AAAAGT	2	12	220334	220345	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021514	ATTAGA	2	12	356813	356824	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021514	AGAAGC	2	12	357101	357112	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_021514	TATGAA	2	12	362620	362631	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021514	AAAGCT	2	12	369785	369796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_021514	AATTAT	2	12	370189	370200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021514	AAGTTA	2	12	382769	382780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021514	AATTTT	2	12	399576	399587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021514	TTTTAA	2	12	456335	456346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021514	TAATTT	2	12	480223	480234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021514	ACTAAT	2	12	518798	518809	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_021514	TTTTTA	2	12	519241	519252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021514	ATTAAG	2	12	519752	519763	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021514	TTAAAA	2	12	558614	558625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021514	TCTAAT	2	12	563538	563549	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_021514	TTGAGG	2	12	612658	612669	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021514	AAATTA	2	12	623230	623241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021514	ATAATT	2	12	716165	716176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021514	TTCTCT	2	12	716450	716461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021514	ATTAAA	2	12	734152	734163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021514	TCAATT	2	12	743660	743671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_021514	TATCAT	2	12	749528	749539	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_021514	ATGATT	2	12	754706	754717	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021514	TGAAAC	2	12	796185	796196	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_021514	AATTAT	2	12	829858	829869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021514	TCAATT	2	12	837259	837270	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_021514	TTAAAC	2	12	859586	859597	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021514	TTACAT	2	12	934456	934467	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_021514	ATAATT	2	12	1002045	1002056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021514	AAATCA	2	12	1002975	1002986	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_021514	TTTTTA	2	12	1010541	1010552	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021514	GTGAAG	2	12	1050541	1050552	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021514	ACTAAT	2	12	1079791	1079802	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_021514	ACCATG	2	12	1088795	1088806	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021514	TAATTG	2	12	1148696	1148707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021514	TTTGAT	2	12	1177083	1177094	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021514	TTTGCT	2	12	1215740	1215751	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_021514	AAAGCT	2	12	1318818	1318829	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_021514	GTTATA	2	12	1324285	1324296	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021514	TTAATG	2	12	1377748	1377759	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021514	TTATGA	2	12	1454752	1454763	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021514	ACCGTT	2	12	1494468	1494479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_021514	CATAAC	2	12	1503047	1503058	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021514	AATCAT	2	12	1524767	1524778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_021514	TCATTA	2	12	1543592	1543603	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_021514	TTGACG	2	12	1581542	1581553	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_021514	CAAACT	2	12	1645169	1645180	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021514	GCACAA	2	12	1686231	1686242	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021514	TGGCCT	2	12	1693665	1693676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_021514	TACAGA	2	12	1736840	1736851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_021514	AATTCA	2	12	1743915	1743926	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_021514	TAAATT	2	12	1770170	1770181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021514	TGCCAA	2	12	1821901	1821912	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_021514	ATTAGT	2	12	1881529	1881540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021514	ACAACC	2	12	1903510	1903521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_021514	CCAAAA	2	12	1904748	1904759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021514	CTTTAA	2	12	1927149	1927160	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_021514	TTTTAT	2	12	1982182	1982193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021514	TTTCAT	2	12	2007164	2007175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_021514	TTAAAA	2	12	2007429	2007440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021514	TAACCT	2	12	2008201	2008212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021514	CAATAT	2	12	2097842	2097853	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_021514	TTACCG	2	12	2106052	2106063	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021514	AATTCA	2	12	2115905	2115916	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_021514	AATTTA	2	12	2118455	2118466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021514	TTTGAT	2	12	2118737	2118748	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021514	GGCTAA	2	12	2153704	2153715	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_021514	AAACTG	2	12	2157603	2157614	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_021514	CTTTGT	2	12	2168345	2168356	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_021514	TTCATC	2	12	2207024	2207035	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021514	ATTTTG	2	12	2209942	2209953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021514	AAACTA	2	12	2230640	2230651	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_021514	TTAATA	2	12	2236710	2236721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021514	TTTTCA	2	12	2266748	2266759	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_021514	GAATAT	2	12	2304368	2304379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021514	AATCAC	2	12	2339204	2339215	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_021514	TTTCAT	2	12	2346875	2346886	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_021514	TCTTAA	2	12	2352448	2352459	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_021514	ATTAGT	2	12	2352923	2352934	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021514	CTCATT	2	12	2373762	2373773	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021514	CCCTGT	2	12	2376243	2376254	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021514	TAGGAC	2	12	2382721	2382732	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_021514	CACTGA	2	12	2403986	2403997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021514	TAAAAT	2	12	2430467	2430478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021514	GAGCCG	2	12	2435495	2435506	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021514	GTATTT	2	12	2498974	2498985	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021514	CTATTT	2	12	2536018	2536029	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_021514	TACTTT	2	12	2536039	2536050	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_021514	TAATTA	2	12	2601725	2601736	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021514	AACCTA	2	12	2606423	2606434	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021514	TTCAAT	2	12	2649586	2649597	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_021514	ACTAAT	2	12	2673812	2673823	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_021514	TAGTTT	2	12	2679775	2679786	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021514	TTTTTA	2	12	2685003	2685014	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021514	AGCGAC	2	12	2697499	2697510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021514	ATAATC	2	12	2757784	2757795	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_021514	TAATCG	2	12	2762965	2762976	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_021514	ATTAGT	2	12	2780009	2780020	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021514	ATTAAT	2	12	2805205	2805216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021514	CGTAAA	2	12	2827432	2827443	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_021514	TTCTCT	2	12	2835293	2835304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021514	ACAAAG	2	12	2836434	2836445	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_021514	AGAAAA	2	12	2845843	2845854	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021514	ATACCA	2	12	2863586	2863597	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021514	TTATTT	2	12	2863739	2863750	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021514	TAATCA	2	12	2870554	2870565	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_021514	AAAGCA	2	12	2882203	2882214	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_021514	ACTTCA	2	12	2896330	2896341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021514	TCTATT	2	12	2974308	2974319	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_021514	TACGTC	2	12	2977453	2977464	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021514	ATTAAA	2	12	2987649	2987660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021514	TTAAAA	2	12	3025466	3025477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021514	GCCATC	2	12	3032954	3032965	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_021514	TAACGG	2	12	3040293	3040304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_021514	TTAACT	2	12	3044594	3044605	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.