MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus plantarum 16

Total Repeats: 1465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021514	GAAAC	2	10	346	355	60 %	0 %	20 %	20 %	513839885
2	NC_021514	CACCG	2	10	3597	3606	20 %	0 %	20 %	60 %	513839888
3	NC_021514	GTTGC	2	10	5366	5375	0 %	40 %	40 %	20 %	513839889
4	NC_021514	TTAAC	2	10	10035	10044	40 %	40 %	0 %	20 %	513839891
5	NC_021514	TCGTA	2	10	11443	11452	20 %	40 %	20 %	20 %	513839894
6	NC_021514	GACCA	2	10	11515	11524	40 %	0 %	20 %	40 %	513839894
7	NC_021514	GCTGA	2	10	11731	11740	20 %	20 %	40 %	20 %	513839894
8	NC_021514	CCTTG	2	10	12099	12108	0 %	40 %	20 %	40 %	513839894
9	NC_021514	AAAAC	2	10	16985	16994	80 %	0 %	0 %	20 %	513839898
10	NC_021514	TTCAC	2	10	20676	20685	20 %	40 %	0 %	40 %	513839901
11	NC_021514	GGCGT	2	10	25767	25776	0 %	20 %	60 %	20 %	513839905
12	NC_021514	TCAAA	2	10	28236	28245	60 %	20 %	0 %	20 %	513839906
13	NC_021514	TCCGC	2	10	30275	30284	0 %	20 %	20 %	60 %	513839907
14	NC_021514	CGCAC	2	10	31606	31615	20 %	0 %	20 %	60 %	513839908
15	NC_021514	TGATT	2	10	31969	31978	20 %	60 %	20 %	0 %	513839908
16	NC_021514	TTAGT	2	10	32133	32142	20 %	60 %	20 %	0 %	513839909
17	NC_021514	GAAAC	2	10	34236	34245	60 %	0 %	20 %	20 %	513839910
18	NC_021514	ACTGG	2	10	34364	34373	20 %	20 %	40 %	20 %	513839910
19	NC_021514	GGTTT	2	10	36617	36626	0 %	60 %	40 %	0 %	513839912
20	NC_021514	TGATT	2	10	37804	37813	20 %	60 %	20 %	0 %	513839914
21	NC_021514	TGATT	2	10	39365	39374	20 %	60 %	20 %	0 %	513839915
22	NC_021514	GTATG	2	10	43032	43041	20 %	40 %	40 %	0 %	513839918
23	NC_021514	ATGTC	2	10	43110	43119	20 %	40 %	20 %	20 %	513839918
24	NC_021514	TTTAT	2	10	46985	46994	20 %	80 %	0 %	0 %	513839922
25	NC_021514	GAAAT	2	10	49036	49045	60 %	20 %	20 %	0 %	513839925
26	NC_021514	TTATC	2	10	49242	49251	20 %	60 %	0 %	20 %	513839925
27	NC_021514	AAACT	2	10	50407	50416	60 %	20 %	0 %	20 %	513839926
28	NC_021514	TGAAT	2	10	51340	51349	40 %	40 %	20 %	0 %	513839927
29	NC_021514	AATTC	2	10	51764	51773	40 %	40 %	0 %	20 %	513839927
30	NC_021514	TTTGA	2	10	58784	58793	20 %	60 %	20 %	0 %	513839931
31	NC_021514	CAGAA	2	10	58929	58938	60 %	0 %	20 %	20 %	513839931
32	NC_021514	TTGTT	2	10	60166	60175	0 %	80 %	20 %	0 %	513839932
33	NC_021514	GAAAT	2	10	61372	61381	60 %	20 %	20 %	0 %	513839933
34	NC_021514	TGCGG	2	10	64502	64511	0 %	20 %	60 %	20 %	513839937
35	NC_021514	GATTG	2	10	65371	65380	20 %	40 %	40 %	0 %	513839938
36	NC_021514	TTACA	2	10	69832	69841	40 %	40 %	0 %	20 %	513839940
37	NC_021514	GGCAA	2	10	70644	70653	40 %	0 %	40 %	20 %	513839941
38	NC_021514	GACCT	2	10	72151	72160	20 %	20 %	20 %	40 %	513839943
39	NC_021514	GATCA	2	10	72322	72331	40 %	20 %	20 %	20 %	513839943
40	NC_021514	GCTTG	2	10	77630	77639	0 %	40 %	40 %	20 %	513839948
41	NC_021514	ACTTC	2	10	77758	77767	20 %	40 %	0 %	40 %	513839948
42	NC_021514	AACGG	2	10	77975	77984	40 %	0 %	40 %	20 %	513839949
43	NC_021514	AGTTA	2	10	78007	78016	40 %	40 %	20 %	0 %	513839949
44	NC_021514	GCTTA	2	10	79985	79994	20 %	40 %	20 %	20 %	513839950
45	NC_021514	TTGAC	2	10	80234	80243	20 %	40 %	20 %	20 %	513839950
46	NC_021514	ATGCC	2	10	84764	84773	20 %	20 %	20 %	40 %	513839954
47	NC_021514	GTTAG	2	10	93289	93298	20 %	40 %	40 %	0 %	513839964
48	NC_021514	CTAAG	2	10	93719	93728	40 %	20 %	20 %	20 %	513839964
49	NC_021514	AGGTG	2	10	97073	97082	20 %	20 %	60 %	0 %	513839966
50	NC_021514	GGGGC	2	10	100337	100346	0 %	0 %	80 %	20 %	513839969
51	NC_021514	GCACG	2	10	101586	101595	20 %	0 %	40 %	40 %	513839970
52	NC_021514	TGATT	2	10	106912	106921	20 %	60 %	20 %	0 %	513839976
53	NC_021514	TGGGA	2	10	109598	109607	20 %	20 %	60 %	0 %	513839980
54	NC_021514	TAAGC	2	10	111140	111149	40 %	20 %	20 %	20 %	513839982
55	NC_021514	GATCA	2	10	111187	111196	40 %	20 %	20 %	20 %	513839982
56	NC_021514	TTGAT	2	10	112911	112920	20 %	60 %	20 %	0 %	513839983
57	NC_021514	CACGT	2	10	113092	113101	20 %	20 %	20 %	40 %	513839984
58	NC_021514	GGCGG	2	10	113340	113349	0 %	0 %	80 %	20 %	513839984
59	NC_021514	CACGG	2	10	113634	113643	20 %	0 %	40 %	40 %	513839984
60	NC_021514	TTCAT	2	10	116292	116301	20 %	60 %	0 %	20 %	513839986
61	NC_021514	GGTTA	2	10	118438	118447	20 %	40 %	40 %	0 %	513839988
62	NC_021514	ATTGA	2	10	119772	119781	40 %	40 %	20 %	0 %	513839989
63	NC_021514	GCTGG	2	10	121266	121275	0 %	20 %	60 %	20 %	513839990
64	NC_021514	ACCGT	2	10	121972	121981	20 %	20 %	20 %	40 %	513839991
65	NC_021514	TCATT	2	10	124011	124020	20 %	60 %	0 %	20 %	513839992
66	NC_021514	AGCTA	2	10	125462	125471	40 %	20 %	20 %	20 %	513839993
67	NC_021514	TTCGA	2	10	129820	129829	20 %	40 %	20 %	20 %	513839999
68	NC_021514	ATGTT	2	10	129986	129995	20 %	60 %	20 %	0 %	513839999
69	NC_021514	CGGCG	2	10	131823	131832	0 %	0 %	60 %	40 %	513840001
70	NC_021514	CATGC	2	10	133008	133017	20 %	20 %	20 %	40 %	513840002
71	NC_021514	CAACC	2	10	133271	133280	40 %	0 %	0 %	60 %	513840002
72	NC_021514	TAATC	2	10	139913	139922	40 %	40 %	0 %	20 %	513840007
73	NC_021514	TCGAT	2	10	141111	141120	20 %	40 %	20 %	20 %	513840008
74	NC_021514	AAATT	2	10	141402	141411	60 %	40 %	0 %	0 %	513840008
75	NC_021514	GTACC	2	10	143195	143204	20 %	20 %	20 %	40 %	513840009
76	NC_021514	GAATT	2	10	144006	144015	40 %	40 %	20 %	0 %	513840010
77	NC_021514	AATCA	2	10	147186	147195	60 %	20 %	0 %	20 %	513840015
78	NC_021514	TAAAC	2	10	149842	149851	60 %	20 %	0 %	20 %	513840018
79	NC_021514	ATGAA	2	10	152405	152414	60 %	20 %	20 %	0 %	513840020
80	NC_021514	GGAAT	2	10	152915	152924	40 %	20 %	40 %	0 %	513840021
81	NC_021514	ATTAA	2	10	154450	154459	60 %	40 %	0 %	0 %	513840021
82	NC_021514	TGACG	2	10	155676	155685	20 %	20 %	40 %	20 %	513840024
83	NC_021514	TCACC	2	10	157278	157287	20 %	20 %	0 %	60 %	513840026
84	NC_021514	AACTA	2	10	158228	158237	60 %	20 %	0 %	20 %	513840027
85	NC_021514	GCAAA	2	10	158319	158328	60 %	0 %	20 %	20 %	513840027
86	NC_021514	ACCGA	2	10	158502	158511	40 %	0 %	20 %	40 %	513840027
87	NC_021514	TTTTA	2	10	160239	160248	20 %	80 %	0 %	0 %	513840030
88	NC_021514	TATCT	2	10	162172	162181	20 %	60 %	0 %	20 %	513840032
89	NC_021514	CAACG	2	10	164178	164187	40 %	0 %	20 %	40 %	513840033
90	NC_021514	ATTGG	3	15	165676	165690	20 %	40 %	40 %	0 %	513840034
91	NC_021514	AAAAC	2	10	167404	167413	80 %	0 %	0 %	20 %	513840036
92	NC_021514	TCCGG	2	10	167423	167432	0 %	20 %	40 %	40 %	513840036
93	NC_021514	TTAAC	2	10	168040	168049	40 %	40 %	0 %	20 %	513840036
94	NC_021514	GTTGT	2	10	168153	168162	0 %	60 %	40 %	0 %	513840036
95	NC_021514	AGGTC	2	10	169406	169415	20 %	20 %	40 %	20 %	513840037
96	NC_021514	GATCG	2	10	170291	170300	20 %	20 %	40 %	20 %	513840038
97	NC_021514	TTCGT	2	10	182907	182916	0 %	60 %	20 %	20 %	513840045
98	NC_021514	TCTGG	2	10	183090	183099	0 %	40 %	40 %	20 %	513840045
99	NC_021514	GGTTA	2	10	187531	187540	20 %	40 %	40 %	0 %	513840048
100	NC_021514	AACTG	2	10	189237	189246	40 %	20 %	20 %	20 %	513840049
101	NC_021514	GGCGT	2	10	197070	197079	0 %	20 %	60 %	20 %	513840053
102	NC_021514	TGTGA	2	10	197169	197178	20 %	40 %	40 %	0 %	513840053
103	NC_021514	TTTGG	2	10	198229	198238	0 %	60 %	40 %	0 %	513840054
104	NC_021514	ATCTG	2	10	200100	200109	20 %	40 %	20 %	20 %	513840055
105	NC_021514	AACCC	2	10	210596	210605	40 %	0 %	0 %	60 %	513840067
106	NC_021514	TCCAA	2	10	213968	213977	40 %	20 %	0 %	40 %	513840071
107	NC_021514	AGGAC	2	10	214115	214124	40 %	0 %	40 %	20 %	513840071
108	NC_021514	AGTTG	2	10	214852	214861	20 %	40 %	40 %	0 %	513840072
109	NC_021514	TTGTG	2	10	215130	215139	0 %	60 %	40 %	0 %	513840072
110	NC_021514	ACTTG	2	10	216958	216967	20 %	40 %	20 %	20 %	513840074
111	NC_021514	TACGT	2	10	217455	217464	20 %	40 %	20 %	20 %	513840075
112	NC_021514	AAAAT	2	10	219736	219745	80 %	20 %	0 %	0 %	513840077
113	NC_021514	CTTTG	2	10	222533	222542	0 %	60 %	20 %	20 %	513840081
114	NC_021514	ACCAT	2	10	225693	225702	40 %	20 %	0 %	40 %	513840083
115	NC_021514	ATGCA	2	10	230893	230902	40 %	20 %	20 %	20 %	513840086
116	NC_021514	GGCGC	2	10	236441	236450	0 %	0 %	60 %	40 %	513840094
117	NC_021514	AGCGC	2	10	240520	240529	20 %	0 %	40 %	40 %	513840098
118	NC_021514	TCTAT	2	10	243156	243165	20 %	60 %	0 %	20 %	513840100
119	NC_021514	GGTCA	2	10	247506	247515	20 %	20 %	40 %	20 %	513840105
120	NC_021514	GTGAC	2	10	247795	247804	20 %	20 %	40 %	20 %	513840105
121	NC_021514	TAATT	2	10	248216	248225	40 %	60 %	0 %	0 %	513840105
122	NC_021514	GTGCA	2	10	255617	255626	20 %	20 %	40 %	20 %	513840110
123	NC_021514	AATAT	2	10	255818	255827	60 %	40 %	0 %	0 %	513840110
124	NC_021514	GTGAC	2	10	258198	258207	20 %	20 %	40 %	20 %	513840112
125	NC_021514	ACAAT	2	10	258936	258945	60 %	20 %	0 %	20 %	513840113
126	NC_021514	TAAGA	2	10	266415	266424	60 %	20 %	20 %	0 %	513840121
127	NC_021514	CTGGC	2	10	268413	268422	0 %	20 %	40 %	40 %	513840124
128	NC_021514	CCGTT	2	10	270115	270124	0 %	40 %	20 %	40 %	513840125
129	NC_021514	AACGG	2	10	271138	271147	40 %	0 %	40 %	20 %	513840127
130	NC_021514	AGTGA	2	10	271831	271840	40 %	20 %	40 %	0 %	513840128
131	NC_021514	GCCTT	2	10	272949	272958	0 %	40 %	20 %	40 %	513840129
132	NC_021514	AAGTT	2	10	273360	273369	40 %	40 %	20 %	0 %	513840129
133	NC_021514	GAATT	2	10	274394	274403	40 %	40 %	20 %	0 %	513840130
134	NC_021514	CGTTA	2	10	274798	274807	20 %	40 %	20 %	20 %	513840131
135	NC_021514	AATTA	2	10	275245	275254	60 %	40 %	0 %	0 %	513840131
136	NC_021514	GGCGT	2	10	275923	275932	0 %	20 %	60 %	20 %	513840132
137	NC_021514	AAGTC	2	10	276540	276549	40 %	20 %	20 %	20 %	513840133
138	NC_021514	TAAGT	2	10	278970	278979	40 %	40 %	20 %	0 %	513840133
139	NC_021514	ACGAA	2	10	280531	280540	60 %	0 %	20 %	20 %	513840133
140	NC_021514	AATAA	2	10	280547	280556	80 %	20 %	0 %	0 %	513840133
141	NC_021514	TTACG	2	10	283117	283126	20 %	40 %	20 %	20 %	513840135
142	NC_021514	GTACC	2	10	283573	283582	20 %	20 %	20 %	40 %	513840135
143	NC_021514	CAAGC	2	10	285192	285201	40 %	0 %	20 %	40 %	513840136
144	NC_021514	ATCAC	2	10	294136	294145	40 %	20 %	0 %	40 %	513840145
145	NC_021514	ACATT	2	10	296755	296764	40 %	40 %	0 %	20 %	513840147
146	NC_021514	TTCGT	2	10	302804	302813	0 %	60 %	20 %	20 %	513840154
147	NC_021514	AGATG	2	10	306199	306208	40 %	20 %	40 %	0 %	513840158
148	NC_021514	GTTTG	2	10	308310	308319	0 %	60 %	40 %	0 %	513840162
149	NC_021514	ACGAA	2	10	308824	308833	60 %	0 %	20 %	20 %	513840163
150	NC_021514	AATCC	2	10	310792	310801	40 %	20 %	0 %	40 %	513840164
151	NC_021514	GTTGG	2	10	310943	310952	0 %	40 %	60 %	0 %	513840164
152	NC_021514	ACTGG	2	10	312283	312292	20 %	20 %	40 %	20 %	513840165
153	NC_021514	ACCAA	2	10	313184	313193	60 %	0 %	0 %	40 %	513840166
154	NC_021514	ATAAA	2	10	313500	313509	80 %	20 %	0 %	0 %	513840166
155	NC_021514	GTTTG	2	10	314436	314445	0 %	60 %	40 %	0 %	513840167
156	NC_021514	AACGA	2	10	318093	318102	60 %	0 %	20 %	20 %	513840170
157	NC_021514	TTCCA	2	10	318265	318274	20 %	40 %	0 %	40 %	513840170
158	NC_021514	TCGAA	2	10	318428	318437	40 %	20 %	20 %	20 %	513840170
159	NC_021514	ACGCT	2	10	320437	320446	20 %	20 %	20 %	40 %	513840173
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161	NC_021514	GACCT	2	10	323231	323240	20 %	20 %	20 %	40 %	513840176
162	NC_021514	GATTT	2	10	325031	325040	20 %	60 %	20 %	0 %	513840177
163	NC_021514	TTGCC	2	10	327678	327687	0 %	40 %	20 %	40 %	513840181
164	NC_021514	CGGGG	2	10	328183	328192	0 %	0 %	80 %	20 %	513840181
165	NC_021514	TTGCA	2	10	337049	337058	20 %	40 %	20 %	20 %	513840189
166	NC_021514	TCAAA	2	10	337330	337339	60 %	20 %	0 %	20 %	513840190
167	NC_021514	GGCTG	2	10	338152	338161	0 %	20 %	60 %	20 %	513840190
168	NC_021514	CCACG	2	10	344334	344343	20 %	0 %	20 %	60 %	513840197
169	NC_021514	GATCG	2	10	345864	345873	20 %	20 %	40 %	20 %	513840198
170	NC_021514	CGAGC	2	10	345967	345976	20 %	0 %	40 %	40 %	513840198
171	NC_021514	AGGGC	2	10	346495	346504	20 %	0 %	60 %	20 %	513840199
172	NC_021514	TGTCT	2	10	348256	348265	0 %	60 %	20 %	20 %	513840200
173	NC_021514	TGATT	2	10	348454	348463	20 %	60 %	20 %	0 %	513840200
174	NC_021514	TGGTT	2	10	351781	351790	0 %	60 %	40 %	0 %	513840202
175	NC_021514	AGTGA	2	10	351891	351900	40 %	20 %	40 %	0 %	513840202
176	NC_021514	CCCGG	2	10	352040	352049	0 %	0 %	40 %	60 %	513840202
177	NC_021514	CAACG	2	10	353386	353395	40 %	0 %	20 %	40 %	513840203
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179	NC_021514	AACTT	2	10	359974	359983	40 %	40 %	0 %	20 %	513840209
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181	NC_021514	CTTTT	2	10	361984	361993	0 %	80 %	0 %	20 %	513840211
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183	NC_021514	TAATA	2	10	363508	363517	60 %	40 %	0 %	0 %	513840212
184	NC_021514	ATCAT	2	10	366402	366411	40 %	40 %	0 %	20 %	513840215
185	NC_021514	TTCGT	2	10	368452	368461	0 %	60 %	20 %	20 %	513840217
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191	NC_021514	ATATA	2	10	380627	380636	60 %	40 %	0 %	0 %	513840230
192	NC_021514	ACGCT	2	10	383175	383184	20 %	20 %	20 %	40 %	513840234
193	NC_021514	CATGT	2	10	383332	383341	20 %	40 %	20 %	20 %	513840234
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198	NC_021514	ATTTT	2	10	390848	390857	20 %	80 %	0 %	0 %	513840240
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201	NC_021514	AACTT	2	10	398012	398021	40 %	40 %	0 %	20 %	513840247
202	NC_021514	GCAAA	2	10	398855	398864	60 %	0 %	20 %	20 %	513840248
203	NC_021514	TCATT	2	10	400799	400808	20 %	60 %	0 %	20 %	513840250
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210	NC_021514	GGAAT	2	10	420817	420826	40 %	20 %	40 %	0 %	513840269
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227	NC_021514	CTTTG	2	10	444532	444541	0 %	60 %	20 %	20 %	513840292
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230	NC_021514	TCAAA	2	10	451097	451106	60 %	20 %	0 %	20 %	513840298
231	NC_021514	AGGTG	2	10	453369	453378	20 %	20 %	60 %	0 %	513840300
232	NC_021514	GTGAT	2	10	453580	453589	20 %	40 %	40 %	0 %	513840301
233	NC_021514	AAACA	2	10	455038	455047	80 %	0 %	0 %	20 %	513840302
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236	NC_021514	TTGTC	2	10	458173	458182	0 %	60 %	20 %	20 %	513840304
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241	NC_021514	GTTAT	2	10	463392	463401	20 %	60 %	20 %	0 %	513840309
242	NC_021514	TCGAA	2	10	464044	464053	40 %	20 %	20 %	20 %	513840309
243	NC_021514	AATTA	2	10	466612	466621	60 %	40 %	0 %	0 %	513840312
244	NC_021514	TGATT	2	10	468792	468801	20 %	60 %	20 %	0 %	513840314
245	NC_021514	AAAAT	2	10	472579	472588	80 %	20 %	0 %	0 %	513840317
246	NC_021514	ATCAA	2	10	473449	473458	60 %	20 %	0 %	20 %	513840318
247	NC_021514	GTTGT	2	10	477577	477586	0 %	60 %	40 %	0 %	513840321
248	NC_021514	TTAGT	2	10	481881	481890	20 %	60 %	20 %	0 %	513840324
249	NC_021514	GGTTT	2	10	482422	482431	0 %	60 %	40 %	0 %	513840324
250	NC_021514	ATTGA	2	10	483164	483173	40 %	40 %	20 %	0 %	513840325
251	NC_021514	ATCTT	2	10	484397	484406	20 %	60 %	0 %	20 %	513840326
252	NC_021514	TAAAC	2	10	489488	489497	60 %	20 %	0 %	20 %	513840329
253	NC_021514	AATGT	2	10	490018	490027	40 %	40 %	20 %	0 %	513840329
254	NC_021514	TGACT	2	10	490334	490343	20 %	40 %	20 %	20 %	513840329
255	NC_021514	TTAGC	2	10	493519	493528	20 %	40 %	20 %	20 %	513840333
256	NC_021514	CAATT	2	10	493537	493546	40 %	40 %	0 %	20 %	513840333
257	NC_021514	ATAGC	2	10	494850	494859	40 %	20 %	20 %	20 %	513840334
258	NC_021514	GTTTG	2	10	495967	495976	0 %	60 %	40 %	0 %	513840335
259	NC_021514	AACGC	2	10	497108	497117	40 %	0 %	20 %	40 %	513840336
260	NC_021514	ACGTT	2	10	498018	498027	20 %	40 %	20 %	20 %	513840337
261	NC_021514	AAGCG	2	10	500206	500215	40 %	0 %	40 %	20 %	513840338
262	NC_021514	TTACT	2	10	501287	501296	20 %	60 %	0 %	20 %	513840338
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387	NC_021514	GCTTC	2	10	755464	755473	0 %	40 %	20 %	40 %	513840557
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