MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 855

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	AAAGT	2	10	1370	1379	60 %	20 %	20 %	0 %	512443504
2	NC_021508	AGCAC	2	10	1683	1692	40 %	0 %	20 %	40 %	512443505
3	NC_021508	CGAAG	2	10	4771	4780	40 %	0 %	40 %	20 %	512443508
4	NC_021508	ATCGG	2	10	7147	7156	20 %	20 %	40 %	20 %	512443509
5	NC_021508	AAGGA	2	10	9495	9504	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021508	GAAAG	2	10	11080	11089	60 %	0 %	40 %	0 %	512443510
7	NC_021508	CTGTG	2	10	11271	11280	0 %	40 %	40 %	20 %	512443510
8	NC_021508	AGGGA	2	10	12400	12409	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021508	CTGCG	2	10	15898	15907	0 %	20 %	40 %	40 %	512443513
10	NC_021508	GTTTT	2	10	18341	18350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021508	TTGCG	2	10	19717	19726	0 %	40 %	40 %	20 %	512443515
12	NC_021508	GTTTT	2	10	20296	20305	0 %	80 %	20 %	0 %	512443515
13	NC_021508	TGCGA	2	10	22060	22069	20 %	20 %	40 %	20 %	512443516
14	NC_021508	TACCG	2	10	22200	22209	20 %	20 %	20 %	40 %	512443516
15	NC_021508	GCCAC	2	10	22295	22304	20 %	0 %	20 %	60 %	512443516
16	NC_021508	AAGGG	2	10	22897	22906	40 %	0 %	60 %	0 %	512443516
17	NC_021508	CGGTG	2	10	23464	23473	0 %	20 %	60 %	20 %	512443516
18	NC_021508	GTATC	2	10	26074	26083	20 %	40 %	20 %	20 %	512443518
19	NC_021508	GGTGG	2	10	26981	26990	0 %	20 %	80 %	0 %	512443518
20	NC_021508	TATTT	2	10	27707	27716	20 %	80 %	0 %	0 %	512443519
21	NC_021508	CTGCG	2	10	27773	27782	0 %	20 %	40 %	40 %	512443519
22	NC_021508	TGCGC	2	10	29961	29970	0 %	20 %	40 %	40 %	512443521
23	NC_021508	TCCAG	2	10	30787	30796	20 %	20 %	20 %	40 %	512443521
24	NC_021508	TGGGG	2	10	31345	31354	0 %	20 %	80 %	0 %	512443521
25	NC_021508	AAGAT	2	10	33651	33660	60 %	20 %	20 %	0 %	512443522
26	NC_021508	AAAGT	2	10	36209	36218	60 %	20 %	20 %	0 %	512443524
27	NC_021508	GTTGT	2	10	36309	36318	0 %	60 %	40 %	0 %	512443524
28	NC_021508	GATGT	2	10	37372	37381	20 %	40 %	40 %	0 %	512443525
29	NC_021508	TGCAT	2	10	38012	38021	20 %	40 %	20 %	20 %	512443525
30	NC_021508	GGTCA	2	10	39199	39208	20 %	20 %	40 %	20 %	512443526
31	NC_021508	CGGGT	2	10	39309	39318	0 %	20 %	60 %	20 %	512443526
32	NC_021508	TTTTC	2	10	40335	40344	0 %	80 %	0 %	20 %	512443528
33	NC_021508	TGCTG	2	10	43276	43285	0 %	40 %	40 %	20 %	512443531
34	NC_021508	ACGTA	2	10	43477	43486	40 %	20 %	20 %	20 %	512443531
35	NC_021508	CGTCG	2	10	44169	44178	0 %	20 %	40 %	40 %	512443532
36	NC_021508	ACATA	2	10	45640	45649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021508	TTTTG	2	10	46794	46803	0 %	80 %	20 %	0 %	512443535
38	NC_021508	TGTTT	2	10	47641	47650	0 %	80 %	20 %	0 %	512443536
39	NC_021508	AGTTG	2	10	49265	49274	20 %	40 %	40 %	0 %	512443536
40	NC_021508	GCGCA	2	10	49576	49585	20 %	0 %	40 %	40 %	512443537
41	NC_021508	GCGCA	2	10	50736	50745	20 %	0 %	40 %	40 %	512443538
42	NC_021508	TGCAG	2	10	52867	52876	20 %	20 %	40 %	20 %	512443539
43	NC_021508	CGCTG	2	10	53791	53800	0 %	20 %	40 %	40 %	512443539
44	NC_021508	GCTAC	2	10	54155	54164	20 %	20 %	20 %	40 %	512443539
45	NC_021508	TCGCT	2	10	54192	54201	0 %	40 %	20 %	40 %	512443539
46	NC_021508	ATGCT	2	10	55483	55492	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_021508	CTGCA	2	10	56886	56895	20 %	20 %	20 %	40 %	512443542
48	NC_021508	ACCCA	2	10	58687	58696	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
49	NC_021508	GCAGG	2	10	58860	58869	20 %	0 %	60 %	20 %	512443545
50	NC_021508	TCGTG	2	10	59511	59520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_021508	CTGCA	2	10	59840	59849	20 %	20 %	20 %	40 %	512443546
52	NC_021508	TCAAA	2	10	60363	60372	60 %	20 %	0 %	20 %	512443546
53	NC_021508	CCGCG	2	10	61705	61714	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_021508	GCCAC	2	10	63807	63816	20 %	0 %	20 %	60 %	512443549
55	NC_021508	TGCCT	2	10	65580	65589	0 %	40 %	20 %	40 %	512443551
56	NC_021508	TGAAG	2	10	66057	66066	40 %	20 %	40 %	0 %	512443551
57	NC_021508	TGGGG	2	10	66659	66668	0 %	20 %	80 %	0 %	512443552
58	NC_021508	CGTTG	2	10	67714	67723	0 %	40 %	40 %	20 %	512443553
59	NC_021508	TGAGT	2	10	67735	67744	20 %	40 %	40 %	0 %	512443553
60	NC_021508	CACGG	2	10	68033	68042	20 %	0 %	40 %	40 %	512443553
61	NC_021508	CAGAG	2	10	68852	68861	40 %	0 %	40 %	20 %	512443553
62	NC_021508	CGCTT	2	10	69197	69206	0 %	40 %	20 %	40 %	512443555
63	NC_021508	AGCGT	2	10	71083	71092	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_021508	AGTGT	2	10	72708	72717	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021508	GAAAA	2	10	76669	76678	80 %	0 %	20 %	0 %	512443565
66	NC_021508	AATAA	2	10	77723	77732	80 %	20 %	0 %	0 %	512443565
67	NC_021508	GCGCC	2	10	79358	79367	0 %	0 %	40 %	60 %	512443567
68	NC_021508	TGGTG	2	10	80872	80881	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021508	CGTGT	2	10	81014	81023	0 %	40 %	40 %	20 %	512443568
70	NC_021508	ATGCA	2	10	83679	83688	40 %	20 %	20 %	20 %	512443570
71	NC_021508	GCACC	2	10	86619	86628	20 %	0 %	20 %	60 %	512443572
72	NC_021508	CGCAC	2	10	87080	87089	20 %	0 %	20 %	60 %	512443572
73	NC_021508	GTACC	2	10	88956	88965	20 %	20 %	20 %	40 %	512443573
74	NC_021508	TTTGC	2	10	90658	90667	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_021508	TGGTG	2	10	92028	92037	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021508	CGTGT	2	10	92284	92293	0 %	40 %	40 %	20 %	512443576
77	NC_021508	GGTAT	2	10	92298	92307	20 %	40 %	40 %	0 %	512443576
78	NC_021508	TCGCT	2	10	93134	93143	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_021508	GCACA	2	10	94774	94783	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_021508	CGTAT	2	10	96113	96122	20 %	40 %	20 %	20 %	512443580
81	NC_021508	CGTAC	2	10	96404	96413	20 %	20 %	20 %	40 %	512443581
82	NC_021508	CCCGT	2	10	96571	96580	0 %	20 %	20 %	60 %	512443581
83	NC_021508	AAGGA	2	10	98356	98365	60 %	0 %	40 %	0 %	512443583
84	NC_021508	ACTGC	2	10	100331	100340	20 %	20 %	20 %	40 %	512443585
85	NC_021508	TCCTC	2	10	102364	102373	0 %	40 %	0 %	60 %	512443587
86	NC_021508	CTGCT	2	10	103460	103469	0 %	40 %	20 %	40 %	512443588
87	NC_021508	CTACT	2	10	103523	103532	20 %	40 %	0 %	40 %	512443588
88	NC_021508	GCGGT	2	10	104031	104040	0 %	20 %	60 %	20 %	512443589
89	NC_021508	GTGCT	2	10	105713	105722	0 %	40 %	40 %	20 %	512443589
90	NC_021508	GCGTC	2	10	107121	107130	0 %	20 %	40 %	40 %	512443592
91	NC_021508	ACCTG	2	10	107736	107745	20 %	20 %	20 %	40 %	512443593
92	NC_021508	GAACG	2	10	108052	108061	40 %	0 %	40 %	20 %	512443593
93	NC_021508	GTTCC	2	10	108381	108390	0 %	40 %	20 %	40 %	512443594
94	NC_021508	CCTCG	2	10	110527	110536	0 %	20 %	20 %	60 %	512443596
95	NC_021508	CTGCG	2	10	112601	112610	0 %	20 %	40 %	40 %	512443597
96	NC_021508	TTCGT	2	10	112683	112692	0 %	60 %	20 %	20 %	512443597
97	NC_021508	GGACG	2	10	113200	113209	20 %	0 %	60 %	20 %	512443597
98	NC_021508	GATGT	2	10	113381	113390	20 %	40 %	40 %	0 %	512443597
99	NC_021508	GATTT	2	10	114212	114221	20 %	60 %	20 %	0 %	512443598
100	NC_021508	TCAGA	2	10	117439	117448	40 %	20 %	20 %	20 %	512443599
101	NC_021508	GCAGA	2	10	118439	118448	40 %	0 %	40 %	20 %	512443599
102	NC_021508	ACAGA	2	10	119794	119803	60 %	0 %	20 %	20 %	512443600
103	NC_021508	GGGAG	2	10	120000	120009	20 %	0 %	80 %	0 %	512443600
104	NC_021508	GTGCG	2	10	120131	120140	0 %	20 %	60 %	20 %	512443600
105	NC_021508	AGGAA	2	10	120288	120297	60 %	0 %	40 %	0 %	512443600
106	NC_021508	TACTG	2	10	120825	120834	20 %	40 %	20 %	20 %	512443601
107	NC_021508	CGTCA	2	10	121738	121747	20 %	20 %	20 %	40 %	512443601
108	NC_021508	TCTTT	2	10	122593	122602	0 %	80 %	0 %	20 %	512443602
109	NC_021508	CGCAG	2	10	124397	124406	20 %	0 %	40 %	40 %	512443603
110	NC_021508	AGCAC	2	10	124433	124442	40 %	0 %	20 %	40 %	512443603
111	NC_021508	CATTG	2	10	126727	126736	20 %	40 %	20 %	20 %	512443604
112	NC_021508	CCGTG	2	10	127088	127097	0 %	20 %	40 %	40 %	512443605
113	NC_021508	AACCA	2	10	128812	128821	60 %	0 %	0 %	40 %	512443606
114	NC_021508	AAAAG	2	10	129463	129472	80 %	0 %	20 %	0 %	512443606
115	NC_021508	TTATC	2	10	130078	130087	20 %	60 %	0 %	20 %	512443607
116	NC_021508	CGCGC	2	10	132213	132222	0 %	0 %	40 %	60 %	512443609
117	NC_021508	TATCG	2	10	133500	133509	20 %	40 %	20 %	20 %	512443610
118	NC_021508	GCGAT	2	10	134536	134545	20 %	20 %	40 %	20 %	512443610
119	NC_021508	TGTTT	2	10	135958	135967	0 %	80 %	20 %	0 %	512443611
120	NC_021508	GTCTT	2	10	137144	137153	0 %	60 %	20 %	20 %	512443612
121	NC_021508	GGTGC	2	10	139681	139690	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
122	NC_021508	ACCAA	2	10	142270	142279	60 %	0 %	0 %	40 %	512443616
123	NC_021508	AGCCA	2	10	142742	142751	40 %	0 %	20 %	40 %	512443616
124	NC_021508	GCAGC	2	10	145456	145465	20 %	0 %	40 %	40 %	512443617
125	NC_021508	TCCGT	2	10	146699	146708	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_021508	GGATC	2	10	147517	147526	20 %	20 %	40 %	20 %	512443619
127	NC_021508	CTTGC	2	10	148905	148914	0 %	40 %	20 %	40 %	512443621
128	NC_021508	GTTTG	2	10	150975	150984	0 %	60 %	40 %	0 %	512443624
129	NC_021508	TGCGC	2	10	153137	153146	0 %	20 %	40 %	40 %	512443627
130	NC_021508	TGTTT	2	10	153411	153420	0 %	80 %	20 %	0 %	512443627
131	NC_021508	GGTCT	2	10	154486	154495	0 %	40 %	40 %	20 %	512443628
132	NC_021508	GGTCT	2	10	155715	155724	0 %	40 %	40 %	20 %	512443629
133	NC_021508	CGGGG	2	10	157089	157098	0 %	0 %	80 %	20 %	512443630
134	NC_021508	AACGG	2	10	159352	159361	40 %	0 %	40 %	20 %	512443631
135	NC_021508	GCAAG	2	10	159630	159639	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021508	TGCCT	2	10	164156	164165	0 %	40 %	20 %	40 %	512443636
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189	NC_021508	GCATG	2	10	232864	232873	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_021508	TTTGT	2	10	233051	233060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
192	NC_021508	GGGTG	2	10	233105	233114	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_021508	TTGAA	2	10	235068	235077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_021508	GTGTG	2	10	328471	328480	0 %	40 %	60 %	0 %	512443788
265	NC_021508	ACACT	2	10	329560	329569	40 %	20 %	0 %	40 %	512443789
266	NC_021508	AAACG	2	10	331599	331608	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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400	NC_021508	TGCAG	2	10	502014	502023	20 %	20 %	40 %	20 %	512443938
401	NC_021508	GTATG	2	10	502274	502283	20 %	40 %	40 %	0 %	512443938
402	NC_021508	AAGAA	2	10	502764	502773	80 %	0 %	20 %	0 %	512443938
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432	NC_021508	AAGGA	2	10	538926	538935	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_021508	TCCAC	2	10	578845	578854	20 %	20 %	0 %	60 %	512443995
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464	NC_021508	CGGTA	2	10	587736	587745	20 %	20 %	40 %	20 %	512444005
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498	NC_021508	CCACC	2	10	637317	637326	20 %	0 %	0 %	80 %	512444044
499	NC_021508	ATTGG	2	10	639123	639132	20 %	40 %	40 %	0 %	512444045
500	NC_021508	CAATC	2	10	639418	639427	40 %	20 %	0 %	40 %	512444045

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