MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 3026

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	512443504
2	NC_021508	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	512443504
3	NC_021508	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
4	NC_021508	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	512443504
5	NC_021508	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	512443504
6	NC_021508	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021508	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021508	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	512443505
9	NC_021508	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	512443505
10	NC_021508	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	512443506
11	NC_021508	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	512443507
12	NC_021508	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	512443507
13	NC_021508	GCCC	2	8	4382	4389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_021508	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	512443508
15	NC_021508	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	512443508
16	NC_021508	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	512443508
17	NC_021508	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	512443508
18	NC_021508	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	512443508
19	NC_021508	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	512443508
20	NC_021508	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	512443508
21	NC_021508	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	512443508
22	NC_021508	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	512443508
23	NC_021508	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	512443509
24	NC_021508	TTAC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	512443509
25	NC_021508	TTGC	2	8	7317	7324	0 %	50 %	25 %	25 %	512443509
26	NC_021508	GTCA	2	8	7488	7495	25 %	25 %	25 %	25 %	512443509
27	NC_021508	GGTT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021508	CCGT	2	8	9126	9133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021508	GGTA	2	8	9207	9214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021508	GCAT	2	8	10132	10139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021508	ATGT	2	8	10211	10218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021508	GTGG	2	8	10238	10245	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021508	GCTT	2	8	10621	10628	0 %	50 %	25 %	25 %	512443510
34	NC_021508	TGGA	2	8	11618	11625	25 %	25 %	50 %	0 %	512443510
35	NC_021508	AAGT	2	8	11842	11849	50 %	25 %	25 %	0 %	512443510
36	NC_021508	GAGC	2	8	12343	12350	25 %	0 %	50 %	25 %	512443510
37	NC_021508	GCGT	2	8	13217	13224	0 %	25 %	50 %	25 %	512443511
38	NC_021508	GTTT	2	8	13594	13601	0 %	75 %	25 %	0 %	512443511
39	NC_021508	GAAG	2	8	13652	13659	50 %	0 %	50 %	0 %	512443511
40	NC_021508	ACAT	2	8	13687	13694	50 %	25 %	0 %	25 %	512443511
41	NC_021508	AGGG	2	8	14105	14112	25 %	0 %	75 %	0 %	512443512
42	NC_021508	TTTC	2	8	14320	14327	0 %	75 %	0 %	25 %	512443512
43	NC_021508	AGAT	2	8	14978	14985	50 %	25 %	25 %	0 %	512443512
44	NC_021508	GCTC	2	8	15780	15787	0 %	25 %	25 %	50 %	512443512
45	NC_021508	GCTG	2	8	16210	16217	0 %	25 %	50 %	25 %	512443513
46	NC_021508	GTAC	2	8	16308	16315	25 %	25 %	25 %	25 %	512443513
47	NC_021508	TGCG	2	8	16692	16699	0 %	25 %	50 %	25 %	512443513
48	NC_021508	TTGG	2	8	17144	17151	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
49	NC_021508	GCAG	2	8	17499	17506	25 %	0 %	50 %	25 %	512443513
50	NC_021508	AAGG	2	8	17678	17685	50 %	0 %	50 %	0 %	512443513
51	NC_021508	GTGC	2	8	18152	18159	0 %	25 %	50 %	25 %	512443513
52	NC_021508	TTTA	2	8	18323	18330	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021508	CGAT	2	8	18413	18420	25 %	25 %	25 %	25 %	512443514
54	NC_021508	CGTT	2	8	18636	18643	0 %	50 %	25 %	25 %	512443514
55	NC_021508	TATG	2	8	18682	18689	25 %	50 %	25 %	0 %	512443514
56	NC_021508	GTTA	2	8	19787	19794	25 %	50 %	25 %	0 %	512443515
57	NC_021508	GAAA	2	8	20639	20646	75 %	0 %	25 %	0 %	512443515
58	NC_021508	TGCG	2	8	20851	20858	0 %	25 %	50 %	25 %	512443515
59	NC_021508	GCTT	2	8	21171	21178	0 %	50 %	25 %	25 %	512443515
60	NC_021508	ACAA	2	8	22717	22724	75 %	0 %	0 %	25 %	512443516
61	NC_021508	GCAC	2	8	22856	22863	25 %	0 %	25 %	50 %	512443516
62	NC_021508	ATGT	2	8	23077	23084	25 %	50 %	25 %	0 %	512443516
63	NC_021508	CTTC	2	8	24288	24295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021508	AAAG	2	8	25258	25265	75 %	0 %	25 %	0 %	512443517
65	NC_021508	TTAT	2	8	25311	25318	25 %	75 %	0 %	0 %	512443517
66	NC_021508	GATT	2	8	25857	25864	25 %	50 %	25 %	0 %	512443518
67	NC_021508	AGCG	2	8	25995	26002	25 %	0 %	50 %	25 %	512443518
68	NC_021508	CCTT	2	8	26831	26838	0 %	50 %	0 %	50 %	512443518
69	NC_021508	GCAC	2	8	26937	26944	25 %	0 %	25 %	50 %	512443518
70	NC_021508	AGCG	2	8	27250	27257	25 %	0 %	50 %	25 %	512443518
71	NC_021508	CAGT	2	8	27341	27348	25 %	25 %	25 %	25 %	512443518
72	NC_021508	TGCG	2	8	27789	27796	0 %	25 %	50 %	25 %	512443519
73	NC_021508	CATC	2	8	27818	27825	25 %	25 %	0 %	50 %	512443519
74	NC_021508	AGTG	2	8	28051	28058	25 %	25 %	50 %	0 %	512443519
75	NC_021508	TTTG	2	8	28435	28442	0 %	75 %	25 %	0 %	512443519
76	NC_021508	AAAG	2	8	30935	30942	75 %	0 %	25 %	0 %	512443521
77	NC_021508	GCGG	2	8	31111	31118	0 %	0 %	75 %	25 %	512443521
78	NC_021508	TCGT	2	8	31277	31284	0 %	50 %	25 %	25 %	512443521
79	NC_021508	TGTC	2	8	31417	31424	0 %	50 %	25 %	25 %	512443521
80	NC_021508	ATCC	2	8	32107	32114	25 %	25 %	0 %	50 %	512443521
81	NC_021508	CTCG	2	8	32116	32123	0 %	25 %	25 %	50 %	512443521
82	NC_021508	GTAC	2	8	32140	32147	25 %	25 %	25 %	25 %	512443521
83	NC_021508	TTCA	2	8	32452	32459	25 %	50 %	0 %	25 %	512443521
84	NC_021508	GTTG	2	8	32481	32488	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
85	NC_021508	CAAA	2	8	32790	32797	75 %	0 %	0 %	25 %	512443521
86	NC_021508	TGCG	2	8	33237	33244	0 %	25 %	50 %	25 %	512443522
87	NC_021508	CCGC	2	8	33640	33647	0 %	0 %	25 %	75 %	512443522
88	NC_021508	GCCG	2	8	34513	34520	0 %	0 %	50 %	50 %	512443523
89	NC_021508	ATTG	2	8	34799	34806	25 %	50 %	25 %	0 %	512443523
90	NC_021508	GACG	2	8	34950	34957	25 %	0 %	50 %	25 %	512443523
91	NC_021508	CGTG	2	8	35744	35751	0 %	25 %	50 %	25 %	512443524
92	NC_021508	GGGT	2	8	36287	36294	0 %	25 %	75 %	0 %	512443524
93	NC_021508	GACA	2	8	36429	36436	50 %	0 %	25 %	25 %	512443524
94	NC_021508	TAAG	2	8	36812	36819	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021508	GTGC	2	8	37188	37195	0 %	25 %	50 %	25 %	512443525
96	NC_021508	GCGA	2	8	37470	37477	25 %	0 %	50 %	25 %	512443525
97	NC_021508	ACGT	2	8	37678	37685	25 %	25 %	25 %	25 %	512443525
98	NC_021508	GAGC	2	8	37733	37740	25 %	0 %	50 %	25 %	512443525
99	NC_021508	TGCG	2	8	38047	38054	0 %	25 %	50 %	25 %	512443525
100	NC_021508	CTTG	2	8	38421	38428	0 %	50 %	25 %	25 %	512443526
101	NC_021508	ACGA	2	8	38548	38555	50 %	0 %	25 %	25 %	512443526
102	NC_021508	GACT	2	8	39605	39612	25 %	25 %	25 %	25 %	512443526
103	NC_021508	GGTT	2	8	39624	39631	0 %	50 %	50 %	0 %	512443526
104	NC_021508	GTAT	2	8	39935	39942	25 %	50 %	25 %	0 %	512443526
105	NC_021508	TTTC	2	8	40095	40102	0 %	75 %	0 %	25 %	512443527
106	NC_021508	TCGG	2	8	40168	40175	0 %	25 %	50 %	25 %	512443527
107	NC_021508	TCCA	2	8	40472	40479	25 %	25 %	0 %	50 %	512443528
108	NC_021508	GAAA	2	8	41025	41032	75 %	0 %	25 %	0 %	512443528
109	NC_021508	AGAA	2	8	41216	41223	75 %	0 %	25 %	0 %	512443529
110	NC_021508	GAAA	2	8	41624	41631	75 %	0 %	25 %	0 %	512443529
111	NC_021508	CATC	2	8	43821	43828	25 %	25 %	0 %	50 %	512443532
112	NC_021508	GCTC	2	8	44237	44244	0 %	25 %	25 %	50 %	512443532
113	NC_021508	GGGT	2	8	44279	44286	0 %	25 %	75 %	0 %	512443532
114	NC_021508	ACCC	2	8	44488	44495	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_021508	GCAC	2	8	45358	45365	25 %	0 %	25 %	50 %	512443533
116	NC_021508	AGGA	2	8	45740	45747	50 %	0 %	50 %	0 %	512443534
117	NC_021508	TTAC	2	8	47157	47164	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021508	TCCC	2	8	47201	47208	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_021508	TGGG	2	8	47825	47832	0 %	25 %	75 %	0 %	512443536
120	NC_021508	GTCG	2	8	48718	48725	0 %	25 %	50 %	25 %	512443536
121	NC_021508	GGAC	2	8	48768	48775	25 %	0 %	50 %	25 %	512443536
122	NC_021508	CGCC	2	8	49292	49299	0 %	0 %	25 %	75 %	512443536
123	NC_021508	AGCG	2	8	49425	49432	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021508	CGGG	2	8	49493	49500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021508	GAGG	2	8	49930	49937	25 %	0 %	75 %	0 %	512443537
126	NC_021508	GCAG	2	8	50846	50853	25 %	0 %	50 %	25 %	512443538
127	NC_021508	TTCT	2	8	51460	51467	0 %	75 %	0 %	25 %	512443538
128	NC_021508	GGGC	2	8	52164	52171	0 %	0 %	75 %	25 %	512443538
129	NC_021508	ATGC	2	8	52821	52828	25 %	25 %	25 %	25 %	512443539
130	NC_021508	AATC	2	8	53323	53330	50 %	25 %	0 %	25 %	512443539
131	NC_021508	ATTA	2	8	53351	53358	50 %	50 %	0 %	0 %	512443539
132	NC_021508	CAAA	2	8	53693	53700	75 %	0 %	0 %	25 %	512443539
133	NC_021508	GGAA	2	8	54316	54323	50 %	0 %	50 %	0 %	512443539
134	NC_021508	CAGG	2	8	54520	54527	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021508	GTAC	2	8	54533	54540	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021508	CATC	2	8	54677	54684	25 %	25 %	0 %	50 %	512443540
137	NC_021508	TTTC	2	8	54766	54773	0 %	75 %	0 %	25 %	512443540
138	NC_021508	CTTT	2	8	54896	54903	0 %	75 %	0 %	25 %	512443540
139	NC_021508	TCGT	2	8	55362	55369	0 %	50 %	25 %	25 %	512443540
140	NC_021508	CTAA	2	8	56042	56049	50 %	25 %	0 %	25 %	512443541
141	NC_021508	TATG	2	8	56199	56206	25 %	50 %	25 %	0 %	512443541
142	NC_021508	TCCT	2	8	56416	56423	0 %	50 %	0 %	50 %	512443541
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