MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 12042

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	GAA	2	6	397	402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443504
2	NC_021508	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443504
3	NC_021508	ACA	2	6	538	543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443504
4	NC_021508	CTT	2	6	658	663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443504
5	NC_021508	AAG	2	6	704	709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443504
6	NC_021508	TGT	2	6	945	950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443504
7	NC_021508	TTC	2	6	972	977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443504
8	NC_021508	TTC	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443504
9	NC_021508	TTC	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443504
10	NC_021508	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443504
11	NC_021508	ACT	2	6	1249	1254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443504
12	NC_021508	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443504
13	NC_021508	AAG	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
14	NC_021508	GCT	2	6	1746	1751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443505
15	NC_021508	TGT	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443505
16	NC_021508	CAA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443505
17	NC_021508	GAA	2	6	1914	1919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
18	NC_021508	AGG	2	6	2009	2014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443505
19	NC_021508	AGA	2	6	2081	2086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
20	NC_021508	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443505
21	NC_021508	GCA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443505
22	NC_021508	TCT	2	6	2337	2342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443505
23	NC_021508	ATC	2	6	2389	2394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443505
24	NC_021508	GTT	2	6	2453	2458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443505
25	NC_021508	TTA	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443505
26	NC_021508	CAG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443505
27	NC_021508	TTG	2	6	2505	2510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443505
28	NC_021508	GAA	2	6	2562	2567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
29	NC_021508	GAA	2	6	2625	2630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443505
30	NC_021508	AGG	2	6	2653	2658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443505
31	NC_021508	CAT	2	6	2729	2734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443505
32	NC_021508	TGC	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443506
33	NC_021508	CAG	2	6	3087	3092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443506
34	NC_021508	CTT	2	6	3159	3164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443506
35	NC_021508	TAT	2	6	3373	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443506
36	NC_021508	CTC	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443506
37	NC_021508	GAG	2	6	3445	3450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443506
38	NC_021508	GAT	2	6	3667	3672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443506
39	NC_021508	ATG	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443506
40	NC_021508	AAT	2	6	3830	3835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443506
41	NC_021508	CGT	2	6	4080	4085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443507
42	NC_021508	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443507
43	NC_021508	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443507
44	NC_021508	GAA	2	6	4394	4399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443508
45	NC_021508	GGA	2	6	4558	4563	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443508
46	NC_021508	TTC	2	6	4875	4880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443508
47	NC_021508	TCT	2	6	4897	4902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443508
48	NC_021508	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443508
49	NC_021508	ATT	2	6	5174	5179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443508
50	NC_021508	TAC	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443508
51	NC_021508	ACG	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443508
52	NC_021508	GTA	2	6	5345	5350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443508
53	NC_021508	ATC	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443508
54	NC_021508	TCT	2	6	5756	5761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443508
55	NC_021508	GGA	2	6	5764	5769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443508
56	NC_021508	GTT	2	6	5801	5806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443508
57	NC_021508	GAT	2	6	5843	5848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443508
58	NC_021508	AGA	2	6	5893	5898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443508
59	NC_021508	GGA	2	6	5990	5995	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443508
60	NC_021508	GGC	2	6	6019	6024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443508
61	NC_021508	TTA	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443508
62	NC_021508	TAA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443508
63	NC_021508	ACT	2	6	6278	6283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443508
64	NC_021508	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443508
65	NC_021508	TTA	2	6	6390	6395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443508
66	NC_021508	AAC	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443508
67	NC_021508	AGA	2	6	6615	6620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443508
68	NC_021508	GTG	2	6	6753	6758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443508
69	NC_021508	TAG	3	9	6798	6806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443508
70	NC_021508	GGA	2	6	7135	7140	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443509
71	NC_021508	CTT	2	6	7141	7146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443509
72	NC_021508	GAT	2	6	7188	7193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443509
73	NC_021508	TGC	2	6	7462	7467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443509
74	NC_021508	ACT	2	6	7498	7503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443509
75	NC_021508	TGA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443509
76	NC_021508	GCA	2	6	7626	7631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443509
77	NC_021508	TCA	2	6	7801	7806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443509
78	NC_021508	TTG	2	6	7812	7817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443509
79	NC_021508	GAT	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443509
80	NC_021508	TCC	2	6	10496	10501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443510
81	NC_021508	CTG	2	6	10518	10523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443510
82	NC_021508	GTC	2	6	10538	10543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443510
83	NC_021508	AGC	2	6	10610	10615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443510
84	NC_021508	TTG	2	6	10634	10639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443510
85	NC_021508	GAC	2	6	10765	10770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443510
86	NC_021508	GAA	2	6	10794	10799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443510
87	NC_021508	TAC	2	6	10906	10911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443510
88	NC_021508	TGG	2	6	10951	10956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443510
89	NC_021508	TCG	2	6	11033	11038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443510
90	NC_021508	GCA	2	6	11198	11203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443510
91	NC_021508	CAT	2	6	11252	11257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443510
92	NC_021508	AAG	2	6	11360	11365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443510
93	NC_021508	TTG	2	6	11457	11462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443510
94	NC_021508	CTG	2	6	11463	11468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443510
95	NC_021508	CGC	2	6	11488	11493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443510
96	NC_021508	CAC	2	6	11511	11516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443510
97	NC_021508	CCT	2	6	11558	11563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443510
98	NC_021508	CGT	2	6	11584	11589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443510
99	NC_021508	GGT	2	6	11678	11683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443510
100	NC_021508	AGT	2	6	11801	11806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443510
101	NC_021508	AAG	2	6	11975	11980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443510
102	NC_021508	TCC	2	6	11998	12003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443510
103	NC_021508	TGT	2	6	12043	12048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443510
104	NC_021508	TGC	2	6	12082	12087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443510
105	NC_021508	GGT	2	6	12161	12166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443510
106	NC_021508	TAT	2	6	12218	12223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443510
107	NC_021508	CGT	2	6	12296	12301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443510
108	NC_021508	GGT	2	6	12572	12577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443511
109	NC_021508	TGT	2	6	12592	12597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443511
110	NC_021508	GGA	2	6	12650	12655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443511
111	NC_021508	ATG	2	6	12700	12705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443511
112	NC_021508	TGA	2	6	12842	12847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443511
113	NC_021508	TTG	2	6	12865	12870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443511
114	NC_021508	CAT	2	6	12932	12937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443511
115	NC_021508	CTG	2	6	12985	12990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443511
116	NC_021508	TGA	2	6	13004	13009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443511
117	NC_021508	TGG	2	6	13019	13024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443511
118	NC_021508	GAG	2	6	13173	13178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443511
119	NC_021508	GAA	2	6	13265	13270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443511
120	NC_021508	TGA	2	6	13312	13317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443511
121	NC_021508	CGG	2	6	13438	13443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443511
122	NC_021508	AGA	2	6	13445	13450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443511
123	NC_021508	TCT	2	6	13640	13645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443511
124	NC_021508	GTC	2	6	13765	13770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443511
125	NC_021508	GTT	2	6	13992	13997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443512
126	NC_021508	GCT	2	6	14004	14009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443512
127	NC_021508	CGA	2	6	14022	14027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443512
128	NC_021508	AGG	2	6	14124	14129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443512
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133	NC_021508	TTA	2	6	14698	14703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443512
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252	NC_021508	TGT	2	6	26721	26726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443518
253	NC_021508	TGC	2	6	26947	26952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443518
254	NC_021508	CAA	2	6	27134	27139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443518
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256	NC_021508	GTT	2	6	27655	27660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443519
257	NC_021508	TGG	2	6	27672	27677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
258	NC_021508	TGG	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
259	NC_021508	GGT	2	6	27855	27860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
260	NC_021508	GTA	2	6	27929	27934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443519
261	NC_021508	ATG	2	6	28097	28102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443519
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265	NC_021508	TGA	2	6	28482	28487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443519
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267	NC_021508	TGA	2	6	28731	28736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443519
268	NC_021508	GGT	2	6	28880	28885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
269	NC_021508	GCT	2	6	29127	29132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443520
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283	NC_021508	TGT	2	6	30533	30538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443521
284	NC_021508	GTG	2	6	30562	30567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443521
285	NC_021508	TTC	2	6	30799	30804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
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313	NC_021508	GCA	2	6	33418	33423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443522
314	NC_021508	CTT	2	6	33470	33475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443522
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333	NC_021508	AGA	2	6	34940	34945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443523
334	NC_021508	AGA	2	6	34964	34969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443523
335	NC_021508	GCA	2	6	35039	35044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443523
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342	NC_021508	ATT	2	6	35752	35757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443524
343	NC_021508	ACG	2	6	35923	35928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443524
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362	NC_021508	ATC	2	6	37968	37973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443525
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374	NC_021508	GCG	3	9	39574	39582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443526
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377	NC_021508	TTG	2	6	39850	39855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443526
378	NC_021508	TGC	2	6	39873	39878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443526
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380	NC_021508	GGT	2	6	40078	40083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443527
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393	NC_021508	GTA	2	6	41862	41867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443530
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401	NC_021508	ACT	2	6	42724	42729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443530
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413	NC_021508	CAT	2	6	43903	43908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443532
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499	NC_021508	CAC	2	6	51489	51494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443538
500	NC_021508	GCA	2	6	51556	51561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443538

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