MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 4503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
2	NC_021508	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
3	NC_021508	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
4	NC_021508	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
5	NC_021508	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021508	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	512443505
7	NC_021508	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	512443505
8	NC_021508	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	512443506
9	NC_021508	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	512443506
10	NC_021508	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	512443506
11	NC_021508	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	512443506
12	NC_021508	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	512443507
13	NC_021508	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	512443507
14	NC_021508	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021508	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	512443508
16	NC_021508	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	512443508
17	NC_021508	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	512443508
18	NC_021508	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	512443508
19	NC_021508	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	512443508
20	NC_021508	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	512443509
21	NC_021508	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	512443509
22	NC_021508	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	512443509
23	NC_021508	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021508	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_021508	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021508	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021508	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021508	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021508	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021508	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	512443510
31	NC_021508	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	512443510
32	NC_021508	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	512443510
33	NC_021508	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	512443510
34	NC_021508	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	512443510
35	NC_021508	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	512443510
36	NC_021508	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	512443510
37	NC_021508	GA	3	6	12508	12513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021508	GT	3	6	12516	12521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021508	GC	3	6	12610	12615	0 %	0 %	50 %	50 %	512443511
40	NC_021508	GC	3	6	13057	13062	0 %	0 %	50 %	50 %	512443511
41	NC_021508	GT	3	6	13140	13145	0 %	50 %	50 %	0 %	512443511
42	NC_021508	CA	4	8	13232	13239	50 %	0 %	0 %	50 %	512443511
43	NC_021508	GA	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	512443511
44	NC_021508	GC	3	6	13527	13532	0 %	0 %	50 %	50 %	512443511
45	NC_021508	CT	4	8	13576	13583	0 %	50 %	0 %	50 %	512443511
46	NC_021508	GC	3	6	14263	14268	0 %	0 %	50 %	50 %	512443512
47	NC_021508	CG	3	6	14297	14302	0 %	0 %	50 %	50 %	512443512
48	NC_021508	AT	3	6	14540	14545	50 %	50 %	0 %	0 %	512443512
49	NC_021508	TG	3	6	15950	15955	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
50	NC_021508	CG	3	6	16385	16390	0 %	0 %	50 %	50 %	512443513
51	NC_021508	CG	3	6	16492	16497	0 %	0 %	50 %	50 %	512443513
52	NC_021508	GT	4	8	16823	16830	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
53	NC_021508	CA	3	6	16832	16837	50 %	0 %	0 %	50 %	512443513
54	NC_021508	GT	3	6	17213	17218	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
55	NC_021508	CG	3	6	17332	17337	0 %	0 %	50 %	50 %	512443513
56	NC_021508	AG	3	6	17365	17370	50 %	0 %	50 %	0 %	512443513
57	NC_021508	GT	3	6	17510	17515	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
58	NC_021508	CG	4	8	17519	17526	0 %	0 %	50 %	50 %	512443513
59	NC_021508	GT	3	6	18259	18264	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
60	NC_021508	AT	3	6	18646	18651	50 %	50 %	0 %	0 %	512443514
61	NC_021508	GT	3	6	18702	18707	0 %	50 %	50 %	0 %	512443514
62	NC_021508	GC	3	6	18752	18757	0 %	0 %	50 %	50 %	512443514
63	NC_021508	CG	3	6	19425	19430	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
64	NC_021508	CG	3	6	19907	19912	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
65	NC_021508	GT	3	6	20340	20345	0 %	50 %	50 %	0 %	512443515
66	NC_021508	CG	3	6	20759	20764	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
67	NC_021508	CT	4	8	21102	21109	0 %	50 %	0 %	50 %	512443515
68	NC_021508	GC	3	6	21121	21126	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
69	NC_021508	GA	3	6	21661	21666	50 %	0 %	50 %	0 %	512443515
70	NC_021508	CA	3	6	21855	21860	50 %	0 %	0 %	50 %	512443515
71	NC_021508	CG	3	6	22420	22425	0 %	0 %	50 %	50 %	512443516
72	NC_021508	AC	3	6	22427	22432	50 %	0 %	0 %	50 %	512443516
73	NC_021508	GT	3	6	22590	22595	0 %	50 %	50 %	0 %	512443516
74	NC_021508	CG	3	6	23210	23215	0 %	0 %	50 %	50 %	512443516
75	NC_021508	GA	3	6	23678	23683	50 %	0 %	50 %	0 %	512443516
76	NC_021508	GA	4	8	24343	24350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021508	CA	3	6	24381	24386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021508	TC	3	6	24422	24427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021508	GA	4	8	24487	24494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021508	TC	3	6	24567	24572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_021508	AG	3	6	25788	25793	50 %	0 %	50 %	0 %	512443518
82	NC_021508	TG	3	6	26024	26029	0 %	50 %	50 %	0 %	512443518
83	NC_021508	GT	3	6	26251	26256	0 %	50 %	50 %	0 %	512443518
84	NC_021508	GC	3	6	26468	26473	0 %	0 %	50 %	50 %	512443518
85	NC_021508	CG	3	6	26737	26742	0 %	0 %	50 %	50 %	512443518
86	NC_021508	GA	3	6	27239	27244	50 %	0 %	50 %	0 %	512443518
87	NC_021508	GT	4	8	27410	27417	0 %	50 %	50 %	0 %	512443518
88	NC_021508	GC	4	8	27452	27459	0 %	0 %	50 %	50 %	512443518
89	NC_021508	GT	4	8	27804	27811	0 %	50 %	50 %	0 %	512443519
90	NC_021508	GT	3	6	28045	28050	0 %	50 %	50 %	0 %	512443519
91	NC_021508	AT	4	8	28138	28145	50 %	50 %	0 %	0 %	512443519
92	NC_021508	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	512443519
93	NC_021508	TG	3	6	28506	28511	0 %	50 %	50 %	0 %	512443519
94	NC_021508	AT	3	6	28933	28938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021508	GC	3	6	29211	29216	0 %	0 %	50 %	50 %	512443520
96	NC_021508	TC	3	6	29582	29587	0 %	50 %	0 %	50 %	512443520
97	NC_021508	AG	3	6	29862	29867	50 %	0 %	50 %	0 %	512443521
98	NC_021508	TC	3	6	30391	30396	0 %	50 %	0 %	50 %	512443521
99	NC_021508	TG	3	6	30631	30636	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
100	NC_021508	CA	3	6	30957	30962	50 %	0 %	0 %	50 %	512443521
101	NC_021508	GT	3	6	31050	31055	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
102	NC_021508	GC	3	6	31456	31461	0 %	0 %	50 %	50 %	512443521
103	NC_021508	GA	3	6	31729	31734	50 %	0 %	50 %	0 %	512443521
104	NC_021508	GT	3	6	32398	32403	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
105	NC_021508	AC	3	6	32439	32444	50 %	0 %	0 %	50 %	512443521
106	NC_021508	GC	3	6	32983	32988	0 %	0 %	50 %	50 %	512443522
107	NC_021508	AG	3	6	33095	33100	50 %	0 %	50 %	0 %	512443522
108	NC_021508	AG	3	6	33104	33109	50 %	0 %	50 %	0 %	512443522
109	NC_021508	CG	3	6	33305	33310	0 %	0 %	50 %	50 %	512443522
110	NC_021508	AC	3	6	33730	33735	50 %	0 %	0 %	50 %	512443522
111	NC_021508	CG	3	6	33996	34001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021508	GT	3	6	34189	34194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021508	CG	4	8	34813	34820	0 %	0 %	50 %	50 %	512443523
114	NC_021508	GC	3	6	34996	35001	0 %	0 %	50 %	50 %	512443523
115	NC_021508	GC	3	6	35051	35056	0 %	0 %	50 %	50 %	512443523
116	NC_021508	AT	3	6	35125	35130	50 %	50 %	0 %	0 %	512443523
117	NC_021508	TA	3	6	35214	35219	50 %	50 %	0 %	0 %	512443523
118	NC_021508	TG	3	6	35370	35375	0 %	50 %	50 %	0 %	512443523
119	NC_021508	GC	3	6	35440	35445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_021508	TG	3	6	35490	35495	0 %	50 %	50 %	0 %	512443524
121	NC_021508	CT	3	6	35668	35673	0 %	50 %	0 %	50 %	512443524
122	NC_021508	GT	4	8	35868	35875	0 %	50 %	50 %	0 %	512443524
123	NC_021508	GC	3	6	36015	36020	0 %	0 %	50 %	50 %	512443524
124	NC_021508	CA	4	8	36064	36071	50 %	0 %	0 %	50 %	512443524
125	NC_021508	AC	3	6	36092	36097	50 %	0 %	0 %	50 %	512443524
126	NC_021508	TG	3	6	36108	36113	0 %	50 %	50 %	0 %	512443524
127	NC_021508	CG	3	6	36635	36640	0 %	0 %	50 %	50 %	512443524
128	NC_021508	TG	3	6	36892	36897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021508	GT	3	6	36966	36971	0 %	50 %	50 %	0 %	512443525
130	NC_021508	CA	3	6	37016	37021	50 %	0 %	0 %	50 %	512443525
131	NC_021508	GC	3	6	37521	37526	0 %	0 %	50 %	50 %	512443525
132	NC_021508	TG	3	6	37975	37980	0 %	50 %	50 %	0 %	512443525
133	NC_021508	GC	3	6	38085	38090	0 %	0 %	50 %	50 %	512443525
134	NC_021508	CT	3	6	39421	39426	0 %	50 %	0 %	50 %	512443526
135	NC_021508	GT	3	6	40575	40580	0 %	50 %	50 %	0 %	512443528
136	NC_021508	GT	3	6	40600	40605	0 %	50 %	50 %	0 %	512443528
137	NC_021508	TG	3	6	41096	41101	0 %	50 %	50 %	0 %	512443529
138	NC_021508	AT	3	6	41279	41284	50 %	50 %	0 %	0 %	512443529
139	NC_021508	CA	3	6	41616	41621	50 %	0 %	0 %	50 %	512443529
140	NC_021508	CA	3	6	41648	41653	50 %	0 %	0 %	50 %	512443529
141	NC_021508	CA	3	6	41695	41700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021508	GT	3	6	42368	42373	0 %	50 %	50 %	0 %	512443530
143	NC_021508	CT	3	6	42794	42799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021508	AG	3	6	42858	42863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021508	CG	3	6	43006	43011	0 %	0 %	50 %	50 %	512443531
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