MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 438

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021508	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_021508	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021508	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_021508	AG	3	6	9425	9430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021508	AC	3	6	9823	9828	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021508	AG	3	6	9886	9891	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021508	TC	3	6	9943	9948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_021508	GC	3	6	10083	10088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_021508	GA	3	6	12508	12513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021508	GT	3	6	12516	12521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021508	GA	4	8	24343	24350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021508	CA	3	6	24381	24386	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_021508	TC	3	6	24422	24427	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021508	GA	4	8	24487	24494	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021508	TC	3	6	24567	24572	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_021508	AT	3	6	28933	28938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021508	CG	3	6	33996	34001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_021508	GT	3	6	34189	34194	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021508	GC	3	6	35440	35445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_021508	TG	3	6	36892	36897	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021508	CA	3	6	41695	41700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_021508	CT	3	6	42794	42799	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_021508	AG	3	6	42858	42863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021508	GA	3	6	46726	46731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021508	CA	3	6	47032	47037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_021508	TC	4	8	47121	47128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_021508	CG	3	6	47551	47556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021508	CG	3	6	47563	47568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_021508	GT	3	6	55626	55631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021508	AC	3	6	55726	55731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_021508	CA	3	6	55781	55786	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_021508	GT	3	6	55793	55798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021508	GA	3	6	58192	58197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021508	TG	3	6	62905	62910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021508	CG	3	6	71067	71072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021508	TG	3	6	71098	71103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021508	AG	3	6	72829	72834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021508	CG	3	6	72914	72919	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_021508	TG	3	6	73947	73952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021508	GT	3	6	79040	79045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021508	GC	3	6	80799	80804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_021508	AG	3	6	82373	82378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021508	TG	3	6	90812	90817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021508	GC	3	6	91996	92001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_021508	CT	3	6	92482	92487	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021508	GA	3	6	92519	92524	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021508	CG	3	6	92561	92566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021508	GT	3	6	93077	93082	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021508	GC	3	6	93103	93108	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_021508	CA	3	6	94417	94422	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_021508	TG	3	6	97424	97429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021508	CG	3	6	102786	102791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021508	GC	3	6	105854	105859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_021508	CT	3	6	106676	106681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_021508	GA	3	6	106687	106692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021508	TG	3	6	108192	108197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021508	TA	3	6	113762	113767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021508	GA	3	6	121987	121992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021508	CA	3	6	122252	122257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_021508	GC	3	6	124687	124692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_021508	TG	3	6	124753	124758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021508	TG	4	8	124949	124956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021508	GT	3	6	125175	125180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021508	TG	3	6	129818	129823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021508	GT	3	6	129882	129887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021508	AG	3	6	132791	132796	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021508	GT	3	6	139645	139650	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021508	CG	3	6	140979	140984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_021508	CT	3	6	141024	141029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_021508	GC	3	6	142958	142963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_021508	CG	3	6	147605	147610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_021508	CG	3	6	148398	148403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_021508	CG	3	6	148414	148419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_021508	CG	3	6	149162	149167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_021508	CG	3	6	154364	154369	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021508	GC	3	6	157697	157702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_021508	GC	3	6	157752	157757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_021508	CG	4	8	157766	157773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_021508	GT	3	6	157958	157963	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021508	GA	4	8	163086	163093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021508	TC	3	6	169279	169284	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_021508	GC	3	6	169560	169565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_021508	TG	3	6	170109	170114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021508	GC	3	6	170172	170177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_021508	GC	3	6	170429	170434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_021508	GA	3	6	176486	176491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021508	TG	3	6	176517	176522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021508	CT	3	6	177072	177077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_021508	TG	3	6	177099	177104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021508	CG	3	6	184485	184490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021508	GC	3	6	186822	186827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021508	AC	3	6	196197	196202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_021508	CA	4	8	196405	196412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_021508	GC	3	6	196577	196582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_021508	GT	3	6	205778	205783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021508	GT	4	8	206145	206152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021508	TG	3	6	216367	216372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021508	TC	3	6	219104	219109	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_021508	GC	3	6	219891	219896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_021508	TG	3	6	221890	221895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021508	GT	3	6	223280	223285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021508	TG	3	6	228667	228672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021508	CT	3	6	228753	228758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_021508	GC	3	6	228763	228768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_021508	GC	3	6	228830	228835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_021508	TG	3	6	230300	230305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021508	TG	4	8	231176	231183	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021508	GC	3	6	231199	231204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_021508	AC	3	6	231612	231617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021508	CA	3	6	232108	232113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021508	AC	3	6	232526	232531	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_021508	AC	3	6	232695	232700	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_021508	TC	3	6	232934	232939	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_021508	AG	3	6	233369	233374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021508	CG	3	6	233441	233446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_021508	AG	3	6	233509	233514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021508	AG	3	6	234445	234450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021508	GA	3	6	234858	234863	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021508	AC	3	6	234890	234895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_021508	AC	3	6	237809	237814	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_021508	GA	3	6	241500	241505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021508	GT	3	6	242190	242195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021508	GT	3	6	242258	242263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021508	TG	3	6	243019	243024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021508	TG	3	6	246556	246561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021508	TG	3	6	246706	246711	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021508	TG	3	6	254629	254634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021508	GT	3	6	262132	262137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021508	CT	3	6	262142	262147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_021508	TG	3	6	262247	262252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021508	TA	3	6	262402	262407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021508	GT	3	6	262516	262521	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021508	CG	3	6	262537	262542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021508	GT	3	6	264112	264117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021508	GT	3	6	266703	266708	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021508	GT	3	6	268290	268295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021508	GT	3	6	271262	271267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021508	GC	3	6	271932	271937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_021508	CA	3	6	271985	271990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_021508	GC	3	6	273444	273449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
142	NC_021508	GC	3	6	276026	276031	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_021508	CG	3	6	276142	276147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
144	NC_021508	GC	3	6	278032	278037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_021508	TG	4	8	279611	279618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021508	GC	3	6	279634	279639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_021508	AC	3	6	280047	280052	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_021508	CA	3	6	280543	280548	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_021508	AC	3	6	280961	280966	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_021508	AC	3	6	281130	281135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_021508	TC	3	6	281369	281374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
152	NC_021508	AG	3	6	281814	281819	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021508	CG	3	6	281886	281891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_021508	AG	3	6	281954	281959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_021508	AG	3	6	282890	282895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
156	NC_021508	GA	3	6	283303	283308	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_021508	AC	3	6	283335	283340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.