MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 4065

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021508	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
2	NC_021508	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
3	NC_021508	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
4	NC_021508	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	512443504
5	NC_021508	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	512443505
6	NC_021508	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	512443505
7	NC_021508	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	512443506
8	NC_021508	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	512443506
9	NC_021508	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	512443506
10	NC_021508	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	512443506
11	NC_021508	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	512443507
12	NC_021508	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	512443507
13	NC_021508	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	512443508
14	NC_021508	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	512443508
15	NC_021508	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	512443508
16	NC_021508	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	512443508
17	NC_021508	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	512443508
18	NC_021508	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	512443509
19	NC_021508	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	512443509
20	NC_021508	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	512443509
21	NC_021508	TC	3	6	10700	10705	0 %	50 %	0 %	50 %	512443510
22	NC_021508	GC	3	6	11289	11294	0 %	0 %	50 %	50 %	512443510
23	NC_021508	GT	3	6	11330	11335	0 %	50 %	50 %	0 %	512443510
24	NC_021508	GT	3	6	11520	11525	0 %	50 %	50 %	0 %	512443510
25	NC_021508	TA	3	6	11907	11912	50 %	50 %	0 %	0 %	512443510
26	NC_021508	CA	3	6	12027	12032	50 %	0 %	0 %	50 %	512443510
27	NC_021508	GT	3	6	12353	12358	0 %	50 %	50 %	0 %	512443510
28	NC_021508	GC	3	6	12610	12615	0 %	0 %	50 %	50 %	512443511
29	NC_021508	GC	3	6	13057	13062	0 %	0 %	50 %	50 %	512443511
30	NC_021508	GT	3	6	13140	13145	0 %	50 %	50 %	0 %	512443511
31	NC_021508	CA	4	8	13232	13239	50 %	0 %	0 %	50 %	512443511
32	NC_021508	GA	3	6	13316	13321	50 %	0 %	50 %	0 %	512443511
33	NC_021508	GC	3	6	13527	13532	0 %	0 %	50 %	50 %	512443511
34	NC_021508	CT	4	8	13576	13583	0 %	50 %	0 %	50 %	512443511
35	NC_021508	GC	3	6	14263	14268	0 %	0 %	50 %	50 %	512443512
36	NC_021508	CG	3	6	14297	14302	0 %	0 %	50 %	50 %	512443512
37	NC_021508	AT	3	6	14540	14545	50 %	50 %	0 %	0 %	512443512
38	NC_021508	TG	3	6	15950	15955	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
39	NC_021508	CG	3	6	16385	16390	0 %	0 %	50 %	50 %	512443513
40	NC_021508	CG	3	6	16492	16497	0 %	0 %	50 %	50 %	512443513
41	NC_021508	GT	4	8	16823	16830	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
42	NC_021508	CA	3	6	16832	16837	50 %	0 %	0 %	50 %	512443513
43	NC_021508	GT	3	6	17213	17218	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
44	NC_021508	CG	3	6	17332	17337	0 %	0 %	50 %	50 %	512443513
45	NC_021508	AG	3	6	17365	17370	50 %	0 %	50 %	0 %	512443513
46	NC_021508	GT	3	6	17510	17515	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
47	NC_021508	CG	4	8	17519	17526	0 %	0 %	50 %	50 %	512443513
48	NC_021508	GT	3	6	18259	18264	0 %	50 %	50 %	0 %	512443513
49	NC_021508	AT	3	6	18646	18651	50 %	50 %	0 %	0 %	512443514
50	NC_021508	GT	3	6	18702	18707	0 %	50 %	50 %	0 %	512443514
51	NC_021508	GC	3	6	18752	18757	0 %	0 %	50 %	50 %	512443514
52	NC_021508	CG	3	6	19425	19430	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
53	NC_021508	CG	3	6	19907	19912	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
54	NC_021508	GT	3	6	20340	20345	0 %	50 %	50 %	0 %	512443515
55	NC_021508	CG	3	6	20759	20764	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
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57	NC_021508	GC	3	6	21121	21126	0 %	0 %	50 %	50 %	512443515
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59	NC_021508	CA	3	6	21855	21860	50 %	0 %	0 %	50 %	512443515
60	NC_021508	CG	3	6	22420	22425	0 %	0 %	50 %	50 %	512443516
61	NC_021508	AC	3	6	22427	22432	50 %	0 %	0 %	50 %	512443516
62	NC_021508	GT	3	6	22590	22595	0 %	50 %	50 %	0 %	512443516
63	NC_021508	CG	3	6	23210	23215	0 %	0 %	50 %	50 %	512443516
64	NC_021508	GA	3	6	23678	23683	50 %	0 %	50 %	0 %	512443516
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68	NC_021508	GC	3	6	26468	26473	0 %	0 %	50 %	50 %	512443518
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70	NC_021508	GA	3	6	27239	27244	50 %	0 %	50 %	0 %	512443518
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81	NC_021508	TC	3	6	30391	30396	0 %	50 %	0 %	50 %	512443521
82	NC_021508	TG	3	6	30631	30636	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
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91	NC_021508	AG	3	6	33104	33109	50 %	0 %	50 %	0 %	512443522
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93	NC_021508	AC	3	6	33730	33735	50 %	0 %	0 %	50 %	512443522
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103	NC_021508	GC	3	6	36015	36020	0 %	0 %	50 %	50 %	512443524
104	NC_021508	CA	4	8	36064	36071	50 %	0 %	0 %	50 %	512443524
105	NC_021508	AC	3	6	36092	36097	50 %	0 %	0 %	50 %	512443524
106	NC_021508	TG	3	6	36108	36113	0 %	50 %	50 %	0 %	512443524
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109	NC_021508	CA	3	6	37016	37021	50 %	0 %	0 %	50 %	512443525
110	NC_021508	GC	3	6	37521	37526	0 %	0 %	50 %	50 %	512443525
111	NC_021508	TG	3	6	37975	37980	0 %	50 %	50 %	0 %	512443525
112	NC_021508	GC	3	6	38085	38090	0 %	0 %	50 %	50 %	512443525
113	NC_021508	CT	3	6	39421	39426	0 %	50 %	0 %	50 %	512443526
114	NC_021508	GT	3	6	40575	40580	0 %	50 %	50 %	0 %	512443528
115	NC_021508	GT	3	6	40600	40605	0 %	50 %	50 %	0 %	512443528
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118	NC_021508	CA	3	6	41616	41621	50 %	0 %	0 %	50 %	512443529
119	NC_021508	CA	3	6	41648	41653	50 %	0 %	0 %	50 %	512443529
120	NC_021508	GT	3	6	42368	42373	0 %	50 %	50 %	0 %	512443530
121	NC_021508	CG	3	6	43006	43011	0 %	0 %	50 %	50 %	512443531
122	NC_021508	CT	3	6	43331	43336	0 %	50 %	0 %	50 %	512443531
123	NC_021508	GC	3	6	43884	43889	0 %	0 %	50 %	50 %	512443532
124	NC_021508	CG	3	6	44130	44135	0 %	0 %	50 %	50 %	512443532
125	NC_021508	CA	3	6	44430	44435	50 %	0 %	0 %	50 %	512443532
126	NC_021508	GA	3	6	45140	45145	50 %	0 %	50 %	0 %	512443533
127	NC_021508	CG	3	6	45195	45200	0 %	0 %	50 %	50 %	512443533
128	NC_021508	TC	3	6	45683	45688	0 %	50 %	0 %	50 %	512443534
129	NC_021508	CG	3	6	45778	45783	0 %	0 %	50 %	50 %	512443534
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134	NC_021508	TG	3	6	50545	50550	0 %	50 %	50 %	0 %	512443538
135	NC_021508	CG	4	8	50551	50558	0 %	0 %	50 %	50 %	512443538
136	NC_021508	GA	3	6	50590	50595	50 %	0 %	50 %	0 %	512443538
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138	NC_021508	GA	3	6	51101	51106	50 %	0 %	50 %	0 %	512443538
139	NC_021508	TC	3	6	51163	51168	0 %	50 %	0 %	50 %	512443538
140	NC_021508	CG	4	8	51625	51632	0 %	0 %	50 %	50 %	512443538
141	NC_021508	GC	3	6	51677	51682	0 %	0 %	50 %	50 %	512443538
142	NC_021508	CA	3	6	51945	51950	50 %	0 %	0 %	50 %	512443538
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