MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI04

Total Repeats: 13

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021504	AAGGT	2	10	3162	3171	40 %	20 %	40 %	0 %	512657639
2	NC_021504	TAATT	2	10	4216	4225	40 %	60 %	0 %	0 %	512657641
3	NC_021504	ATTTG	2	10	5171	5180	20 %	60 %	20 %	0 %	512657643
4	NC_021504	CAAAA	2	10	5443	5452	80 %	0 %	0 %	20 %	512657643
5	NC_021504	GAGTT	2	10	6289	6298	20 %	40 %	40 %	0 %	512657643
6	NC_021504	CTTGT	2	10	6366	6375	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_021504	AAGTT	2	10	8349	8358	40 %	40 %	20 %	0 %	512657645
8	NC_021504	AGGTT	2	10	8396	8405	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021504	TAACT	2	10	10853	10862	40 %	40 %	0 %	20 %	512657649
10	NC_021504	TTGAT	2	10	13195	13204	20 %	60 %	20 %	0 %	512657651
11	NC_021504	AAAGT	2	10	14049	14058	60 %	20 %	20 %	0 %	512657652
12	NC_021504	TGGTC	2	10	14921	14930	0 %	40 %	40 %	20 %	512657653
13	NC_021504	CACTA	2	10	15777	15786	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.