MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI04

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021504	GGAC	2	8	125	132	25 %	0 %	50 %	25 %	512657637
2	NC_021504	CTTC	2	8	182	189	0 %	50 %	0 %	50 %	512657637
3	NC_021504	GATG	2	8	690	697	25 %	25 %	50 %	0 %	512657637
4	NC_021504	TCTA	2	8	797	804	25 %	50 %	0 %	25 %	512657637
5	NC_021504	TCCA	2	8	888	895	25 %	25 %	0 %	50 %	512657637
6	NC_021504	GACA	2	8	912	919	50 %	0 %	25 %	25 %	512657637
7	NC_021504	TTCT	2	8	1160	1167	0 %	75 %	0 %	25 %	512657637
8	NC_021504	CCAT	2	8	1292	1299	25 %	25 %	0 %	50 %	512657637
9	NC_021504	CATC	2	8	1328	1335	25 %	25 %	0 %	50 %	512657637
10	NC_021504	CTGT	2	8	1339	1346	0 %	50 %	25 %	25 %	512657637
11	NC_021504	CCCG	2	8	1744	1751	0 %	0 %	25 %	75 %	512657637
12	NC_021504	GGCA	2	8	2108	2115	25 %	0 %	50 %	25 %	512657638
13	NC_021504	TTGG	2	8	3113	3120	0 %	50 %	50 %	0 %	512657639
14	NC_021504	CAAA	2	8	3716	3723	75 %	0 %	0 %	25 %	512657641
15	NC_021504	GAAT	2	8	3754	3761	50 %	25 %	25 %	0 %	512657641
16	NC_021504	AAAG	2	8	3823	3830	75 %	0 %	25 %	0 %	512657641
17	NC_021504	TTGA	2	8	4061	4068	25 %	50 %	25 %	0 %	512657641
18	NC_021504	GAAA	2	8	4147	4154	75 %	0 %	25 %	0 %	512657641
19	NC_021504	AGAA	2	8	4236	4243	75 %	0 %	25 %	0 %	512657641
20	NC_021504	GAAT	2	8	4811	4818	50 %	25 %	25 %	0 %	512657642
21	NC_021504	AGTG	2	8	4928	4935	25 %	25 %	50 %	0 %	512657642
22	NC_021504	TTAA	2	8	5751	5758	50 %	50 %	0 %	0 %	512657643
23	NC_021504	ACTG	2	8	6062	6069	25 %	25 %	25 %	25 %	512657643
24	NC_021504	ATTT	2	8	6845	6852	25 %	75 %	0 %	0 %	512657644
25	NC_021504	GAGT	2	8	7908	7915	25 %	25 %	50 %	0 %	512657645
26	NC_021504	CAAC	2	8	8794	8801	50 %	0 %	0 %	50 %	512657647
27	NC_021504	TCGC	2	8	8888	8895	0 %	25 %	25 %	50 %	512657647
28	NC_021504	TAAT	2	8	8908	8915	50 %	50 %	0 %	0 %	512657647
29	NC_021504	TTTA	2	8	9109	9116	25 %	75 %	0 %	0 %	512657647
30	NC_021504	AACC	2	8	10302	10309	50 %	0 %	0 %	50 %	512657649
31	NC_021504	TTAA	2	8	10365	10372	50 %	50 %	0 %	0 %	512657649
32	NC_021504	CATT	2	8	10487	10494	25 %	50 %	0 %	25 %	512657649
33	NC_021504	ACCA	2	8	11430	11437	50 %	0 %	0 %	50 %	512657649
34	NC_021504	GCCA	2	8	11632	11639	25 %	0 %	25 %	50 %	512657649
35	NC_021504	TTTC	2	8	13220	13227	0 %	75 %	0 %	25 %	512657651
36	NC_021504	ATAG	2	8	13266	13273	50 %	25 %	25 %	0 %	512657651
37	NC_021504	AAAT	2	8	13313	13320	75 %	25 %	0 %	0 %	512657651
38	NC_021504	TTCA	2	8	13483	13490	25 %	50 %	0 %	25 %	512657651
39	NC_021504	CATA	2	8	13696	13703	50 %	25 %	0 %	25 %	512657651
40	NC_021504	AATT	2	8	13938	13945	50 %	50 %	0 %	0 %	512657652
41	NC_021504	ACCC	2	8	14949	14956	25 %	0 %	0 %	75 %	512657653
42	NC_021504	CTAA	2	8	15093	15100	50 %	25 %	0 %	25 %	512657653
43	NC_021504	CGTC	2	8	15424	15431	0 %	25 %	25 %	50 %	512657653
44	NC_021504	TTGG	2	8	15638	15645	0 %	50 %	50 %	0 %	512657653

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.