MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI04

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021504	AAT	2	6	6	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657637
2	NC_021504	GAC	2	6	48	53	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657637
3	NC_021504	CAA	2	6	381	386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657637
4	NC_021504	CCG	2	6	446	451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
5	NC_021504	ATC	2	6	457	462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657637
6	NC_021504	GGA	2	6	498	503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512657637
7	NC_021504	ATT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657637
8	NC_021504	GGA	2	6	606	611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512657637
9	NC_021504	GCG	2	6	615	620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512657637
10	NC_021504	TAT	2	6	649	654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657637
11	NC_021504	GCC	2	6	739	744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
12	NC_021504	GCG	2	6	789	794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512657637
13	NC_021504	TGC	2	6	1034	1039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657637
14	NC_021504	GCT	2	6	1080	1085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657637
15	NC_021504	GTT	2	6	1192	1197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657637
16	NC_021504	AGC	2	6	1278	1283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657637
17	NC_021504	GCC	2	6	1308	1313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
18	NC_021504	TTA	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657637
19	NC_021504	CGG	2	6	1538	1543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512657637
20	NC_021504	CTG	2	6	1603	1608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657637
21	NC_021504	ATG	2	6	1667	1672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657637
22	NC_021504	CCA	2	6	1688	1693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512657637
23	NC_021504	CCG	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
24	NC_021504	GCC	2	6	1877	1882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657637
25	NC_021504	AGA	2	6	1907	1912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657637
26	NC_021504	ACA	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657638
27	NC_021504	GAA	2	6	2077	2082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657638
28	NC_021504	GCT	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
29	NC_021504	TGC	2	6	2395	2400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
30	NC_021504	AAG	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657639
31	NC_021504	ATT	2	6	2429	2434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657639
32	NC_021504	TTC	2	6	2519	2524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512657639
33	NC_021504	CCG	2	6	2601	2606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657639
34	NC_021504	TGG	2	6	2776	2781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512657639
35	NC_021504	GCT	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
36	NC_021504	CGC	2	6	2956	2961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657639
37	NC_021504	GTT	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657639
38	NC_021504	CTG	2	6	2970	2975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
39	NC_021504	TAC	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657639
40	NC_021504	GTC	2	6	3024	3029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657639
41	NC_021504	TTG	2	6	3099	3104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657639
42	NC_021504	ACA	2	6	3234	3239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657639
43	NC_021504	GTT	2	6	3242	3247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657639
44	NC_021504	GTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657639
45	NC_021504	TAA	2	6	3901	3906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657641
46	NC_021504	GAT	2	6	3995	4000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657641
47	NC_021504	TAA	2	6	4024	4029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657641
48	NC_021504	ATG	2	6	4244	4249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657641
49	NC_021504	CAT	2	6	4313	4318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657641
50	NC_021504	TGT	2	6	4342	4347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657641
51	NC_021504	TAA	2	6	4378	4383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657641
52	NC_021504	GAT	2	6	4588	4593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657642
53	NC_021504	ATT	2	6	4655	4660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657642
54	NC_021504	AAT	2	6	4735	4740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657642
55	NC_021504	TGA	2	6	4827	4832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657642
56	NC_021504	CAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657642
57	NC_021504	ATG	2	6	4876	4881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657642
58	NC_021504	GAT	2	6	4888	4893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657642
59	NC_021504	AGT	2	6	5070	5075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657643
60	NC_021504	ATG	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657643
61	NC_021504	AAC	2	6	5428	5433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657643
62	NC_021504	AAG	2	6	5472	5477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657643
63	NC_021504	TTG	2	6	5619	5624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657643
64	NC_021504	ATA	2	6	5637	5642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657643
65	NC_021504	GAA	2	6	5647	5652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657643
66	NC_021504	GAA	2	6	5874	5879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657643
67	NC_021504	GAA	2	6	6012	6017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657643
68	NC_021504	CAA	2	6	6222	6227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657643
69	NC_021504	CAA	2	6	6231	6236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657643
70	NC_021504	AAT	2	6	6239	6244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657643
71	NC_021504	CAA	2	6	6279	6284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657643
72	NC_021504	TAA	2	6	6698	6703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657644
73	NC_021504	ATT	2	6	6745	6750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657644
74	NC_021504	CAA	2	6	6756	6761	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657644
75	NC_021504	AAG	2	6	6820	6825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657644
76	NC_021504	AAT	3	9	7158	7166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657644
77	NC_021504	TCT	2	6	7175	7180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512657644
78	NC_021504	ATT	2	6	7185	7190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657644
79	NC_021504	CAG	2	6	7192	7197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657644
80	NC_021504	TAA	2	6	7208	7213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657644
81	NC_021504	CAT	2	6	7251	7256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657644
82	NC_021504	TCC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512657645
83	NC_021504	CTC	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512657645
84	NC_021504	TGA	2	6	8262	8267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657645
85	NC_021504	TCT	2	6	8633	8638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512657646
86	NC_021504	TCA	2	6	8693	8698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657646
87	NC_021504	TGA	2	6	8713	8718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657646
88	NC_021504	CTT	3	9	8745	8753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512657646
89	NC_021504	AAG	2	6	8808	8813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657647
90	NC_021504	AGA	2	6	8830	8835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657647
91	NC_021504	ATG	2	6	8926	8931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657647
92	NC_021504	ATT	2	6	8944	8949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657647
93	NC_021504	ATG	2	6	9175	9180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657648
94	NC_021504	AAG	2	6	9220	9225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657648
95	NC_021504	AGA	2	6	9246	9251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657648
96	NC_021504	TCA	2	6	9349	9354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657648
97	NC_021504	GAT	2	6	9385	9390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657648
98	NC_021504	AAG	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657648
99	NC_021504	AGC	2	6	9506	9511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657648
100	NC_021504	ATA	2	6	9533	9538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657648
101	NC_021504	AAC	2	6	9884	9889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
102	NC_021504	AGC	2	6	10031	10036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657649
103	NC_021504	AAG	2	6	10158	10163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657649
104	NC_021504	CAA	2	6	10215	10220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
105	NC_021504	GAA	2	6	10245	10250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657649
106	NC_021504	TAC	2	6	10265	10270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657649
107	NC_021504	ATA	2	6	10318	10323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657649
108	NC_021504	GCT	2	6	10348	10353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657649
109	NC_021504	CCA	2	6	10375	10380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512657649
110	NC_021504	ATT	2	6	10432	10437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657649
111	NC_021504	CCA	2	6	10456	10461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512657649
112	NC_021504	ATG	2	6	10465	10470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657649
113	NC_021504	GCA	2	6	10539	10544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657649
114	NC_021504	ACC	2	6	10813	10818	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512657649
115	NC_021504	ATG	2	6	10873	10878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657649
116	NC_021504	GCC	2	6	10929	10934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657649
117	NC_021504	CCA	2	6	10940	10945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512657649
118	NC_021504	GCT	2	6	11007	11012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657649
119	NC_021504	CAA	2	6	11034	11039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
120	NC_021504	TGC	2	6	11057	11062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657649
121	NC_021504	GCC	2	6	11079	11084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512657649
122	NC_021504	CAA	2	6	11109	11114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
123	NC_021504	TCA	2	6	11120	11125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657649
124	NC_021504	CAA	2	6	11130	11135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
125	NC_021504	AGC	2	6	11182	11187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657649
126	NC_021504	CAA	2	6	11214	11219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
127	NC_021504	AAC	2	6	11247	11252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
128	NC_021504	AAG	2	6	11320	11325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657649
129	NC_021504	ACT	2	6	11394	11399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657649
130	NC_021504	TAC	2	6	11405	11410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657649
131	NC_021504	ACC	2	6	11445	11450	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512657649
132	NC_021504	TCA	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657649
133	NC_021504	TTA	2	6	11599	11604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657649
134	NC_021504	GAC	2	6	11614	11619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657649
135	NC_021504	TGT	2	6	11714	11719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657649
136	NC_021504	AAC	2	6	11893	11898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
137	NC_021504	ACA	2	6	11936	11941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512657649
138	NC_021504	CTG	3	9	12167	12175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657650
139	NC_021504	TCA	2	6	12179	12184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657650
140	NC_021504	TTA	2	6	13078	13083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657651
141	NC_021504	ATA	2	6	13150	13155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657651
142	NC_021504	ATT	2	6	13182	13187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657651
143	NC_021504	TAA	2	6	13256	13261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657651
144	NC_021504	TAA	2	6	13289	13294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657651
145	NC_021504	CCA	2	6	13344	13349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512657651
146	NC_021504	ATT	2	6	13398	13403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512657651
147	NC_021504	TCC	2	6	13510	13515	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512657651
148	NC_021504	TCA	2	6	13688	13693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657651
149	NC_021504	ACT	2	6	13753	13758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657652
150	NC_021504	ATA	2	6	13764	13769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657652
151	NC_021504	TGA	2	6	13819	13824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657652
152	NC_021504	TGC	2	6	13897	13902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657652
153	NC_021504	AGA	2	6	13984	13989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512657652
154	NC_021504	ATA	2	6	14009	14014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657652
155	NC_021504	CTG	2	6	14722	14727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657653
156	NC_021504	ATC	2	6	14729	14734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512657653
157	NC_021504	TAG	2	6	14764	14769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657653
158	NC_021504	GGC	2	6	14875	14880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512657653
159	NC_021504	TAA	2	6	14900	14905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657653
160	NC_021504	GAC	2	6	14971	14976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657653
161	NC_021504	CTG	2	6	15079	15084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512657653
162	NC_021504	GAT	2	6	15204	15209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657653
163	NC_021504	TGT	2	6	15237	15242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512657653
164	NC_021504	AGT	2	6	15245	15250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512657653
165	NC_021504	AAT	2	6	15268	15273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657653
166	NC_021504	AAT	2	6	15391	15396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657653
167	NC_021504	GCA	2	6	15417	15422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657653
168	NC_021504	AAT	2	6	15608	15613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512657653
169	NC_021504	GAC	2	6	15625	15630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657653
170	NC_021504	CAG	2	6	15631	15636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512657653

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.