MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	GATTT	2	10	1742	1751	20 %	60 %	20 %	0 %	512656347
2	NC_021503	TCCTT	2	10	1766	1775	0 %	60 %	0 %	40 %	512656347
3	NC_021503	ACTAT	2	10	2188	2197	40 %	40 %	0 %	20 %	512656348
4	NC_021503	GGCAA	2	10	2208	2217	40 %	0 %	40 %	20 %	512656348
5	NC_021503	CTCTA	2	10	4540	4549	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_021503	CATTT	2	10	4762	4771	20 %	60 %	0 %	20 %	512656351
7	NC_021503	CATTT	2	10	8017	8026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021503	TTATT	2	10	8036	8045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021503	ATAAA	2	10	9826	9835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021503	TATAA	2	10	10086	10095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021503	AATTC	2	10	10849	10858	40 %	40 %	0 %	20 %	512656357
12	NC_021503	GAGAA	2	10	12207	12216	60 %	0 %	40 %	0 %	512656358
13	NC_021503	AGTAA	2	10	14013	14022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021503	ATGAT	2	10	14188	14197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021503	TACAA	2	10	14267	14276	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021503	TAATA	2	10	14445	14454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021503	ACCAA	2	10	14464	14473	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_021503	ATTTT	2	10	15103	15112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021503	TTGTA	2	10	16101	16110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021503	TGAAT	2	10	17862	17871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021503	ATTTG	2	10	18881	18890	20 %	60 %	20 %	0 %	512656365
22	NC_021503	AGAGA	2	10	18984	18993	60 %	0 %	40 %	0 %	512656365
23	NC_021503	AAAGG	2	10	20320	20329	60 %	0 %	40 %	0 %	512656365
24	NC_021503	ATGTA	2	10	21582	21591	40 %	40 %	20 %	0 %	512656368
25	NC_021503	GGAAA	2	10	22513	22522	60 %	0 %	40 %	0 %	512656369
26	NC_021503	TTATG	2	10	23514	23523	20 %	60 %	20 %	0 %	512656370
27	NC_021503	TAAAA	2	10	24597	24606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021503	ATCAG	2	10	24744	24753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_021503	CAATA	2	10	24833	24842	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_021503	TTGCT	2	10	26941	26950	0 %	60 %	20 %	20 %	512656373
31	NC_021503	TTGTT	2	10	27742	27751	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021503	TGGAT	2	10	28505	28514	20 %	40 %	40 %	0 %	512656375
33	NC_021503	ATTGA	2	10	29411	29420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021503	ATTTT	2	10	29464	29473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021503	ACTTT	2	10	29626	29635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021503	TCGAT	2	10	31896	31905	20 %	40 %	20 %	20 %	512656378
37	NC_021503	CATTT	2	10	32100	32109	20 %	60 %	0 %	20 %	512656378
38	NC_021503	TATCT	2	10	33159	33168	20 %	60 %	0 %	20 %	512656378
39	NC_021503	TCATG	2	10	33908	33917	20 %	40 %	20 %	20 %	512656378
40	NC_021503	AAATA	2	10	34696	34705	80 %	20 %	0 %	0 %	512656380
41	NC_021503	TTTCG	2	10	35685	35694	0 %	60 %	20 %	20 %	512656382
42	NC_021503	TTGGA	2	10	35811	35820	20 %	40 %	40 %	0 %	512656382
43	NC_021503	GTGAT	2	10	40489	40498	20 %	40 %	40 %	0 %	512656385
44	NC_021503	TCTTG	2	10	41286	41295	0 %	60 %	20 %	20 %	512656386
45	NC_021503	ATTGA	2	10	42671	42680	40 %	40 %	20 %	0 %	512656388
46	NC_021503	ATATA	2	10	44821	44830	60 %	40 %	0 %	0 %	512656389
47	NC_021503	ATATA	2	10	45171	45180	60 %	40 %	0 %	0 %	512656391
48	NC_021503	CAACA	2	10	45639	45648	60 %	0 %	0 %	40 %	512656393
49	NC_021503	AAAGT	2	10	47196	47205	60 %	20 %	20 %	0 %	512656393
50	NC_021503	CCGTT	2	10	51158	51167	0 %	40 %	20 %	40 %	512656398

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.