MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	CTCTA	2	10	4540	4549	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_021503	CATTT	2	10	8017	8026	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_021503	TTATT	2	10	8036	8045	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021503	ATAAA	2	10	9826	9835	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021503	TATAA	2	10	10086	10095	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021503	AGTAA	2	10	14013	14022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021503	ATGAT	2	10	14188	14197	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021503	TACAA	2	10	14267	14276	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021503	TAATA	2	10	14445	14454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021503	ACCAA	2	10	14464	14473	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_021503	ATTTT	2	10	15103	15112	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021503	TTGTA	2	10	16101	16110	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021503	TGAAT	2	10	17862	17871	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021503	TAAAA	2	10	24597	24606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021503	ATCAG	2	10	24744	24753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_021503	CAATA	2	10	24833	24842	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_021503	TTGTT	2	10	27742	27751	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021503	ATTGA	2	10	29411	29420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021503	ATTTT	2	10	29464	29473	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021503	ACTTT	2	10	29626	29635	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.