MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	GATTT	2	10	1742	1751	20 %	60 %	20 %	0 %	512656347
2	NC_021503	TCCTT	2	10	1766	1775	0 %	60 %	0 %	40 %	512656347
3	NC_021503	ACTAT	2	10	2188	2197	40 %	40 %	0 %	20 %	512656348
4	NC_021503	GGCAA	2	10	2208	2217	40 %	0 %	40 %	20 %	512656348
5	NC_021503	CATTT	2	10	4762	4771	20 %	60 %	0 %	20 %	512656351
6	NC_021503	AATTC	2	10	10849	10858	40 %	40 %	0 %	20 %	512656357
7	NC_021503	GAGAA	2	10	12207	12216	60 %	0 %	40 %	0 %	512656358
8	NC_021503	ATTTG	2	10	18881	18890	20 %	60 %	20 %	0 %	512656365
9	NC_021503	AGAGA	2	10	18984	18993	60 %	0 %	40 %	0 %	512656365
10	NC_021503	AAAGG	2	10	20320	20329	60 %	0 %	40 %	0 %	512656365
11	NC_021503	ATGTA	2	10	21582	21591	40 %	40 %	20 %	0 %	512656368
12	NC_021503	GGAAA	2	10	22513	22522	60 %	0 %	40 %	0 %	512656369
13	NC_021503	TTATG	2	10	23514	23523	20 %	60 %	20 %	0 %	512656370
14	NC_021503	TTGCT	2	10	26941	26950	0 %	60 %	20 %	20 %	512656373
15	NC_021503	TGGAT	2	10	28505	28514	20 %	40 %	40 %	0 %	512656375
16	NC_021503	TCGAT	2	10	31896	31905	20 %	40 %	20 %	20 %	512656378
17	NC_021503	CATTT	2	10	32100	32109	20 %	60 %	0 %	20 %	512656378
18	NC_021503	TATCT	2	10	33159	33168	20 %	60 %	0 %	20 %	512656378
19	NC_021503	TCATG	2	10	33908	33917	20 %	40 %	20 %	20 %	512656378
20	NC_021503	AAATA	2	10	34696	34705	80 %	20 %	0 %	0 %	512656380
21	NC_021503	TTTCG	2	10	35685	35694	0 %	60 %	20 %	20 %	512656382
22	NC_021503	TTGGA	2	10	35811	35820	20 %	40 %	40 %	0 %	512656382
23	NC_021503	GTGAT	2	10	40489	40498	20 %	40 %	40 %	0 %	512656385
24	NC_021503	TCTTG	2	10	41286	41295	0 %	60 %	20 %	20 %	512656386
25	NC_021503	ATTGA	2	10	42671	42680	40 %	40 %	20 %	0 %	512656388
26	NC_021503	ATATA	2	10	44821	44830	60 %	40 %	0 %	0 %	512656389
27	NC_021503	ATATA	2	10	45171	45180	60 %	40 %	0 %	0 %	512656391
28	NC_021503	CAACA	2	10	45639	45648	60 %	0 %	0 %	40 %	512656393
29	NC_021503	AAAGT	2	10	47196	47205	60 %	20 %	20 %	0 %	512656393
30	NC_021503	CCGTT	2	10	51158	51167	0 %	40 %	20 %	40 %	512656398

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.