MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	TGAT	2	8	293	300	25 %	50 %	25 %	0 %	512656347
2	NC_021503	GTTA	2	8	330	337	25 %	50 %	25 %	0 %	512656347
3	NC_021503	ATTG	2	8	361	368	25 %	50 %	25 %	0 %	512656347
4	NC_021503	AGAA	2	8	729	736	75 %	0 %	25 %	0 %	512656347
5	NC_021503	GAAT	2	8	1583	1590	50 %	25 %	25 %	0 %	512656347
6	NC_021503	TTAA	2	8	1876	1883	50 %	50 %	0 %	0 %	512656347
7	NC_021503	GAGT	2	8	2227	2234	25 %	25 %	50 %	0 %	512656348
8	NC_021503	CTTA	2	8	2588	2595	25 %	50 %	0 %	25 %	512656348
9	NC_021503	TTAT	2	8	3231	3238	25 %	75 %	0 %	0 %	512656349
10	NC_021503	AATG	2	8	3253	3260	50 %	25 %	25 %	0 %	512656349
11	NC_021503	CTTA	2	8	4187	4194	25 %	50 %	0 %	25 %	512656350
12	NC_021503	GTTC	2	8	4276	4283	0 %	50 %	25 %	25 %	512656350
13	NC_021503	ACTG	2	8	4327	4334	25 %	25 %	25 %	25 %	512656350
14	NC_021503	CTTC	2	8	4391	4398	0 %	50 %	0 %	50 %	512656350
15	NC_021503	ATTA	2	8	4428	4435	50 %	50 %	0 %	0 %	512656350
16	NC_021503	TCTT	2	8	4438	4445	0 %	75 %	0 %	25 %	512656350
17	NC_021503	ACTT	2	8	4863	4870	25 %	50 %	0 %	25 %	512656351
18	NC_021503	TGTT	2	8	5615	5622	0 %	75 %	25 %	0 %	512656352
19	NC_021503	GAAT	2	8	6588	6595	50 %	25 %	25 %	0 %	512656353
20	NC_021503	TGAT	2	8	6868	6875	25 %	50 %	25 %	0 %	512656353
21	NC_021503	CTAT	2	8	8866	8873	25 %	50 %	0 %	25 %	512656354
22	NC_021503	CTTT	2	8	8957	8964	0 %	75 %	0 %	25 %	512656354
23	NC_021503	TCAA	2	8	9399	9406	50 %	25 %	0 %	25 %	512656355
24	NC_021503	TAAT	2	8	9506	9513	50 %	50 %	0 %	0 %	512656355
25	NC_021503	AAGA	2	8	10328	10335	75 %	0 %	25 %	0 %	512656356
26	NC_021503	AAAG	2	8	10386	10393	75 %	0 %	25 %	0 %	512656356
27	NC_021503	TAAA	2	8	10478	10485	75 %	25 %	0 %	0 %	512656356
28	NC_021503	GAAA	2	8	11932	11939	75 %	0 %	25 %	0 %	512656357
29	NC_021503	GTAA	2	8	12257	12264	50 %	25 %	25 %	0 %	512656358
30	NC_021503	TTAA	2	8	12924	12931	50 %	50 %	0 %	0 %	512656359
31	NC_021503	TGTT	2	8	15088	15095	0 %	75 %	25 %	0 %	512656360
32	NC_021503	CAAT	2	8	15852	15859	50 %	25 %	0 %	25 %	512656362
33	NC_021503	GTTA	2	8	16558	16565	25 %	50 %	25 %	0 %	512656363
34	NC_021503	TTAA	2	8	16935	16942	50 %	50 %	0 %	0 %	512656364
35	NC_021503	ACAA	2	8	16960	16967	75 %	0 %	0 %	25 %	512656364
36	NC_021503	TTAA	2	8	16995	17002	50 %	50 %	0 %	0 %	512656364
37	NC_021503	CATA	2	8	17386	17393	50 %	25 %	0 %	25 %	512656364
38	NC_021503	ACCT	2	8	17521	17528	25 %	25 %	0 %	50 %	512656364
39	NC_021503	TTAT	2	8	18161	18168	25 %	75 %	0 %	0 %	512656365
40	NC_021503	CAAA	2	8	18498	18505	75 %	0 %	0 %	25 %	512656365
41	NC_021503	ATTT	2	8	18577	18584	25 %	75 %	0 %	0 %	512656365
42	NC_021503	AAGG	2	8	19062	19069	50 %	0 %	50 %	0 %	512656365
43	NC_021503	GATG	2	8	20045	20052	25 %	25 %	50 %	0 %	512656365
44	NC_021503	GATT	2	8	20111	20118	25 %	50 %	25 %	0 %	512656365
45	NC_021503	ATGC	2	8	20205	20212	25 %	25 %	25 %	25 %	512656365
46	NC_021503	GAAA	2	8	20338	20345	75 %	0 %	25 %	0 %	512656366
47	NC_021503	ATTT	2	8	20348	20355	25 %	75 %	0 %	0 %	512656366
48	NC_021503	CTTT	2	8	20745	20752	0 %	75 %	0 %	25 %	512656367
49	NC_021503	CCAA	2	8	20917	20924	50 %	0 %	0 %	50 %	512656367
50	NC_021503	TAAA	2	8	20959	20966	75 %	25 %	0 %	0 %	512656367
51	NC_021503	GTTC	2	8	21152	21159	0 %	50 %	25 %	25 %	512656367
52	NC_021503	GATT	2	8	21438	21445	25 %	50 %	25 %	0 %	512656368
53	NC_021503	CTTA	2	8	21612	21619	25 %	50 %	0 %	25 %	512656368
54	NC_021503	TCAT	2	8	21622	21629	25 %	50 %	0 %	25 %	512656368
55	NC_021503	CTTT	2	8	22163	22170	0 %	75 %	0 %	25 %	512656369
56	NC_021503	GATA	2	8	22210	22217	50 %	25 %	25 %	0 %	512656369
57	NC_021503	CATT	2	8	22395	22402	25 %	50 %	0 %	25 %	512656369
58	NC_021503	CAAT	2	8	22891	22898	50 %	25 %	0 %	25 %	512656369
59	NC_021503	GATA	2	8	22948	22955	50 %	25 %	25 %	0 %	512656369
60	NC_021503	ATGG	2	8	23436	23443	25 %	25 %	50 %	0 %	512656370
61	NC_021503	CGAA	2	8	23797	23804	50 %	0 %	25 %	25 %	512656371
62	NC_021503	CAGT	2	8	24205	24212	25 %	25 %	25 %	25 %	512656371
63	NC_021503	CTAG	2	8	24236	24243	25 %	25 %	25 %	25 %	512656371
64	NC_021503	ATTA	2	8	25054	25061	50 %	50 %	0 %	0 %	512656372
65	NC_021503	TACT	2	8	25078	25085	25 %	50 %	0 %	25 %	512656372
66	NC_021503	TTAC	2	8	25200	25207	25 %	50 %	0 %	25 %	512656372
67	NC_021503	CTTC	2	8	25834	25841	0 %	50 %	0 %	50 %	512656372
68	NC_021503	TTTG	2	8	26340	26347	0 %	75 %	25 %	0 %	512656373
69	NC_021503	TGCT	2	8	26542	26549	0 %	50 %	25 %	25 %	512656373
70	NC_021503	GGCT	2	8	27275	27282	0 %	25 %	50 %	25 %	512656373
71	NC_021503	TTCA	2	8	28228	28235	25 %	50 %	0 %	25 %	512656375
72	NC_021503	ATCC	2	8	28347	28354	25 %	25 %	0 %	50 %	512656375
73	NC_021503	ATTG	2	8	28414	28421	25 %	50 %	25 %	0 %	512656375
74	NC_021503	TTCA	2	8	28489	28496	25 %	50 %	0 %	25 %	512656375
75	NC_021503	GAAA	2	8	28968	28975	75 %	0 %	25 %	0 %	512656376
76	NC_021503	ATCG	2	8	29314	29321	25 %	25 %	25 %	25 %	512656376
77	NC_021503	GTAA	2	8	29399	29406	50 %	25 %	25 %	0 %	512656376
78	NC_021503	AGTA	2	8	30893	30900	50 %	25 %	25 %	0 %	512656377
79	NC_021503	AACA	2	8	31032	31039	75 %	0 %	0 %	25 %	512656377
80	NC_021503	TAAA	2	8	31529	31536	75 %	25 %	0 %	0 %	512656378
81	NC_021503	TTCA	2	8	32484	32491	25 %	50 %	0 %	25 %	512656378
82	NC_021503	AGTT	2	8	32588	32595	25 %	50 %	25 %	0 %	512656378
83	NC_021503	AAAC	2	8	32597	32604	75 %	0 %	0 %	25 %	512656378
84	NC_021503	AATA	2	8	32891	32898	75 %	25 %	0 %	0 %	512656378
85	NC_021503	CATT	2	8	33070	33077	25 %	50 %	0 %	25 %	512656378
86	NC_021503	GTTG	2	8	33194	33201	0 %	50 %	50 %	0 %	512656378
87	NC_021503	TCTT	2	8	34054	34061	0 %	75 %	0 %	25 %	512656378
88	NC_021503	CTAT	2	8	34715	34722	25 %	50 %	0 %	25 %	512656380
89	NC_021503	TTTC	2	8	34852	34859	0 %	75 %	0 %	25 %	512656380
90	NC_021503	TTGC	2	8	35257	35264	0 %	50 %	25 %	25 %	512656381
91	NC_021503	TTGC	2	8	35873	35880	0 %	50 %	25 %	25 %	512656382
92	NC_021503	GAAA	2	8	36165	36172	75 %	0 %	25 %	0 %	512656382
93	NC_021503	TGTT	2	8	37203	37210	0 %	75 %	25 %	0 %	512656383
94	NC_021503	TTGC	2	8	37325	37332	0 %	50 %	25 %	25 %	512656383
95	NC_021503	CTAA	2	8	38292	38299	50 %	25 %	0 %	25 %	512656384
96	NC_021503	CGTC	2	8	38623	38630	0 %	25 %	25 %	50 %	512656384
97	NC_021503	GCCA	2	8	38851	38858	25 %	0 %	25 %	50 %	512656384
98	NC_021503	TGAT	2	8	39009	39016	25 %	50 %	25 %	0 %	512656384
99	NC_021503	GAAC	2	8	39099	39106	50 %	0 %	25 %	25 %	512656384
100	NC_021503	TTGC	2	8	39186	39193	0 %	50 %	25 %	25 %	512656384
101	NC_021503	GTTA	2	8	40416	40423	25 %	50 %	25 %	0 %	512656385
102	NC_021503	TCAC	2	8	41796	41803	25 %	25 %	0 %	50 %	512656387
103	NC_021503	CTTA	2	8	41840	41847	25 %	50 %	0 %	25 %	512656387
104	NC_021503	TGTT	2	8	42024	42031	0 %	75 %	25 %	0 %	512656387
105	NC_021503	AAGT	2	8	42077	42084	50 %	25 %	25 %	0 %	512656387
106	NC_021503	TTAG	2	8	42730	42737	25 %	50 %	25 %	0 %	512656388
107	NC_021503	AGTT	2	8	42836	42843	25 %	50 %	25 %	0 %	512656388
108	NC_021503	AGTT	3	12	42926	42937	25 %	50 %	25 %	0 %	512656388
109	NC_021503	CCAC	2	8	42960	42967	25 %	0 %	0 %	75 %	512656388
110	NC_021503	CTTT	2	8	43043	43050	0 %	75 %	0 %	25 %	512656388
111	NC_021503	TAGA	2	8	43317	43324	50 %	25 %	25 %	0 %	512656388
112	NC_021503	TTGT	2	8	45063	45070	0 %	75 %	25 %	0 %	512656391
113	NC_021503	ACCA	2	8	45738	45745	50 %	0 %	0 %	50 %	512656393
114	NC_021503	TAAT	2	8	45917	45924	50 %	50 %	0 %	0 %	512656393
115	NC_021503	AATT	2	8	46217	46224	50 %	50 %	0 %	0 %	512656393
116	NC_021503	ATGC	2	8	46448	46455	25 %	25 %	25 %	25 %	512656393
117	NC_021503	GCAA	2	8	46458	46465	50 %	0 %	25 %	25 %	512656393
118	NC_021503	AAAG	2	8	46524	46531	75 %	0 %	25 %	0 %	512656393
119	NC_021503	TTCA	2	8	46773	46780	25 %	50 %	0 %	25 %	512656393
120	NC_021503	CATT	2	8	46970	46977	25 %	50 %	0 %	25 %	512656393
121	NC_021503	CGAA	2	8	47024	47031	50 %	0 %	25 %	25 %	512656393
122	NC_021503	CAAA	2	8	47213	47220	75 %	0 %	0 %	25 %	512656393
123	NC_021503	CAAA	2	8	47961	47968	75 %	0 %	0 %	25 %	512656394
124	NC_021503	CCAT	2	8	48180	48187	25 %	25 %	0 %	50 %	512656394
125	NC_021503	TTAA	2	8	48857	48864	50 %	50 %	0 %	0 %	512656396
126	NC_021503	ACTA	2	8	49309	49316	50 %	25 %	0 %	25 %	512656396
127	NC_021503	CAAC	2	8	50152	50159	50 %	0 %	0 %	50 %	512656397
128	NC_021503	GTAA	2	8	50206	50213	50 %	25 %	25 %	0 %	512656397
129	NC_021503	ATTT	2	8	50475	50482	25 %	75 %	0 %	0 %	512656398
130	NC_021503	TCAT	2	8	50638	50645	25 %	50 %	0 %	25 %	512656398
131	NC_021503	GAAT	2	8	50775	50782	50 %	25 %	25 %	0 %	512656398
132	NC_021503	GTTG	2	8	50814	50821	0 %	50 %	50 %	0 %	512656398
133	NC_021503	AATT	2	8	51820	51827	50 %	50 %	0 %	0 %	512656399
134	NC_021503	CGAA	2	8	52196	52203	50 %	0 %	25 %	25 %	512656400
135	NC_021503	CAGT	2	8	52604	52611	25 %	25 %	25 %	25 %	512656400
136	NC_021503	CTAG	2	8	52635	52642	25 %	25 %	25 %	25 %	512656400

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.