MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 96

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	AC	3	6	1725	1730	50 %	0 %	0 %	50 %	512656347
2	NC_021503	AC	3	6	2329	2334	50 %	0 %	0 %	50 %	512656348
3	NC_021503	GT	3	6	2545	2550	0 %	50 %	50 %	0 %	512656348
4	NC_021503	GT	3	6	4630	4635	0 %	50 %	50 %	0 %	512656351
5	NC_021503	CT	3	6	4897	4902	0 %	50 %	0 %	50 %	512656351
6	NC_021503	TC	3	6	5461	5466	0 %	50 %	0 %	50 %	512656352
7	NC_021503	TG	3	6	5823	5828	0 %	50 %	50 %	0 %	512656352
8	NC_021503	AC	3	6	6638	6643	50 %	0 %	0 %	50 %	512656353
9	NC_021503	AT	3	6	6683	6688	50 %	50 %	0 %	0 %	512656353
10	NC_021503	TG	3	6	7111	7116	0 %	50 %	50 %	0 %	512656353
11	NC_021503	TA	3	6	7560	7565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021503	AT	3	6	7570	7575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021503	GA	3	6	7605	7610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021503	TA	3	6	7900	7905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021503	AT	3	6	8872	8877	50 %	50 %	0 %	0 %	512656354
16	NC_021503	TA	3	6	9224	9229	50 %	50 %	0 %	0 %	512656354
17	NC_021503	TA	3	6	9967	9972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021503	AT	3	6	10029	10034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021503	AT	3	6	10159	10164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021503	AT	3	6	10198	10203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021503	TA	4	8	10348	10355	50 %	50 %	0 %	0 %	512656356
22	NC_021503	AT	3	6	10527	10532	50 %	50 %	0 %	0 %	512656356
23	NC_021503	AT	3	6	10636	10641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021503	AT	3	6	10658	10663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021503	AC	3	6	11427	11432	50 %	0 %	0 %	50 %	512656357
26	NC_021503	TG	3	6	12555	12560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021503	AT	3	6	12718	12723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021503	TA	3	6	13063	13068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021503	AT	3	6	13475	13480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021503	TA	3	6	13579	13584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021503	GT	3	6	13959	13964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021503	AT	3	6	14046	14051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021503	AT	3	6	14162	14167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021503	AT	3	6	14250	14255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021503	AT	3	6	14542	14547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021503	AC	3	6	14567	14572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_021503	CA	3	6	14573	14578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_021503	TA	3	6	14646	14651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021503	TA	3	6	14713	14718	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021503	AT	3	6	14749	14754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021503	TA	3	6	14816	14821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021503	AT	3	6	15150	15155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021503	GT	3	6	15496	15501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021503	TA	3	6	15617	15622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021503	AT	3	6	15874	15879	50 %	50 %	0 %	0 %	512656362
46	NC_021503	TA	3	6	15999	16004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021503	AG	3	6	17710	17715	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021503	TA	3	6	18952	18957	50 %	50 %	0 %	0 %	512656365
49	NC_021503	CT	3	6	19110	19115	0 %	50 %	0 %	50 %	512656365
50	NC_021503	CG	3	6	19374	19379	0 %	0 %	50 %	50 %	512656365
51	NC_021503	GA	3	6	19993	19998	50 %	0 %	50 %	0 %	512656365
52	NC_021503	CA	3	6	21345	21350	50 %	0 %	0 %	50 %	512656367
53	NC_021503	TA	3	6	22290	22295	50 %	50 %	0 %	0 %	512656369
54	NC_021503	AT	3	6	22310	22315	50 %	50 %	0 %	0 %	512656369
55	NC_021503	AT	3	6	22661	22666	50 %	50 %	0 %	0 %	512656369
56	NC_021503	TA	3	6	23058	23063	50 %	50 %	0 %	0 %	512656369
57	NC_021503	AG	3	6	23115	23120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021503	AT	4	8	23186	23193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021503	AT	3	6	25037	25042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021503	AT	3	6	25978	25983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021503	TG	3	6	26104	26109	0 %	50 %	50 %	0 %	512656373
62	NC_021503	AT	3	6	27308	27313	50 %	50 %	0 %	0 %	512656373
63	NC_021503	TG	3	6	27527	27532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021503	TA	6	12	27688	27699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021503	GC	3	6	29199	29204	0 %	0 %	50 %	50 %	512656376
66	NC_021503	TA	3	6	31151	31156	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021503	TG	3	6	31837	31842	0 %	50 %	50 %	0 %	512656378
68	NC_021503	AT	3	6	31978	31983	50 %	50 %	0 %	0 %	512656378
69	NC_021503	AT	3	6	34171	34176	50 %	50 %	0 %	0 %	512656378
70	NC_021503	TA	3	6	34590	34595	50 %	50 %	0 %	0 %	512656380
71	NC_021503	GA	3	6	34755	34760	50 %	0 %	50 %	0 %	512656380
72	NC_021503	AT	3	6	34974	34979	50 %	50 %	0 %	0 %	512656381
73	NC_021503	TA	3	6	35669	35674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021503	TG	3	6	36292	36297	0 %	50 %	50 %	0 %	512656382
75	NC_021503	TA	3	6	36402	36407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021503	AT	3	6	36434	36439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021503	AT	3	6	36480	36485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021503	AT	3	6	36936	36941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021503	GT	4	8	37125	37132	0 %	50 %	50 %	0 %	512656383
80	NC_021503	AT	3	6	37586	37591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021503	CT	3	6	40885	40890	0 %	50 %	0 %	50 %	512656385
82	NC_021503	CG	3	6	42306	42311	0 %	0 %	50 %	50 %	512656387
83	NC_021503	AT	3	6	43453	43458	50 %	50 %	0 %	0 %	512656388
84	NC_021503	TA	3	6	44489	44494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021503	TG	3	6	47609	47614	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021503	CA	3	6	47949	47954	50 %	0 %	0 %	50 %	512656394
87	NC_021503	AT	3	6	48382	48387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021503	AT	3	6	48634	48639	50 %	50 %	0 %	0 %	512656395
89	NC_021503	TA	3	6	49348	49353	50 %	50 %	0 %	0 %	512656396
90	NC_021503	AT	4	8	49499	49506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021503	CA	3	6	49836	49841	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021503	CG	3	6	49871	49876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_021503	TG	3	6	50114	50119	0 %	50 %	50 %	0 %	512656397
94	NC_021503	CT	3	6	51395	51400	0 %	50 %	0 %	50 %	512656398
95	NC_021503	CA	3	6	51755	51760	50 %	0 %	0 %	50 %	512656399
96	NC_021503	AT	3	6	51866	51871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.