MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri I5007 plasmid pLRI01

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021503	AC	3	6	1725	1730	50 %	0 %	0 %	50 %	512656347
2	NC_021503	AC	3	6	2329	2334	50 %	0 %	0 %	50 %	512656348
3	NC_021503	GT	3	6	2545	2550	0 %	50 %	50 %	0 %	512656348
4	NC_021503	GT	3	6	4630	4635	0 %	50 %	50 %	0 %	512656351
5	NC_021503	CT	3	6	4897	4902	0 %	50 %	0 %	50 %	512656351
6	NC_021503	TC	3	6	5461	5466	0 %	50 %	0 %	50 %	512656352
7	NC_021503	TG	3	6	5823	5828	0 %	50 %	50 %	0 %	512656352
8	NC_021503	AC	3	6	6638	6643	50 %	0 %	0 %	50 %	512656353
9	NC_021503	AT	3	6	6683	6688	50 %	50 %	0 %	0 %	512656353
10	NC_021503	TG	3	6	7111	7116	0 %	50 %	50 %	0 %	512656353
11	NC_021503	AT	3	6	8872	8877	50 %	50 %	0 %	0 %	512656354
12	NC_021503	TA	3	6	9224	9229	50 %	50 %	0 %	0 %	512656354
13	NC_021503	TA	4	8	10348	10355	50 %	50 %	0 %	0 %	512656356
14	NC_021503	AT	3	6	10527	10532	50 %	50 %	0 %	0 %	512656356
15	NC_021503	AC	3	6	11427	11432	50 %	0 %	0 %	50 %	512656357
16	NC_021503	AT	3	6	15874	15879	50 %	50 %	0 %	0 %	512656362
17	NC_021503	TA	3	6	18952	18957	50 %	50 %	0 %	0 %	512656365
18	NC_021503	CT	3	6	19110	19115	0 %	50 %	0 %	50 %	512656365
19	NC_021503	CG	3	6	19374	19379	0 %	0 %	50 %	50 %	512656365
20	NC_021503	GA	3	6	19993	19998	50 %	0 %	50 %	0 %	512656365
21	NC_021503	CA	3	6	21345	21350	50 %	0 %	0 %	50 %	512656367
22	NC_021503	TA	3	6	22290	22295	50 %	50 %	0 %	0 %	512656369
23	NC_021503	AT	3	6	22310	22315	50 %	50 %	0 %	0 %	512656369
24	NC_021503	AT	3	6	22661	22666	50 %	50 %	0 %	0 %	512656369
25	NC_021503	TA	3	6	23058	23063	50 %	50 %	0 %	0 %	512656369
26	NC_021503	TG	3	6	26104	26109	0 %	50 %	50 %	0 %	512656373
27	NC_021503	AT	3	6	27308	27313	50 %	50 %	0 %	0 %	512656373
28	NC_021503	GC	3	6	29199	29204	0 %	0 %	50 %	50 %	512656376
29	NC_021503	TG	3	6	31837	31842	0 %	50 %	50 %	0 %	512656378
30	NC_021503	AT	3	6	31978	31983	50 %	50 %	0 %	0 %	512656378
31	NC_021503	AT	3	6	34171	34176	50 %	50 %	0 %	0 %	512656378
32	NC_021503	TA	3	6	34590	34595	50 %	50 %	0 %	0 %	512656380
33	NC_021503	GA	3	6	34755	34760	50 %	0 %	50 %	0 %	512656380
34	NC_021503	AT	3	6	34974	34979	50 %	50 %	0 %	0 %	512656381
35	NC_021503	TG	3	6	36292	36297	0 %	50 %	50 %	0 %	512656382
36	NC_021503	GT	4	8	37125	37132	0 %	50 %	50 %	0 %	512656383
37	NC_021503	CT	3	6	40885	40890	0 %	50 %	0 %	50 %	512656385
38	NC_021503	CG	3	6	42306	42311	0 %	0 %	50 %	50 %	512656387
39	NC_021503	AT	3	6	43453	43458	50 %	50 %	0 %	0 %	512656388
40	NC_021503	CA	3	6	47949	47954	50 %	0 %	0 %	50 %	512656394
41	NC_021503	AT	3	6	48634	48639	50 %	50 %	0 %	0 %	512656395
42	NC_021503	TA	3	6	49348	49353	50 %	50 %	0 %	0 %	512656396
43	NC_021503	TG	3	6	50114	50119	0 %	50 %	50 %	0 %	512656397
44	NC_021503	CT	3	6	51395	51400	0 %	50 %	0 %	50 %	512656398
45	NC_021503	CA	3	6	51755	51760	50 %	0 %	0 %	50 %	512656399

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.